MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mesorhizobium sp. BNC1 plasmid 2

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008243	CAAG	2	8	4917	4924	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008243	AGGA	2	8	9639	9646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008243	ATTG	2	8	17699	17706	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008243	ACAA	2	8	19987	19994	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_008243	TATC	2	8	47078	47085	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_008243	GCAG	2	8	62785	62792	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_008243	CGAA	3	12	62940	62951	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_008243	ACGC	2	8	65521	65528	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008243	CGGT	2	8	65544	65551	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_008243	CAGC	2	8	65848	65855	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008243	GGCC	2	8	65921	65928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008243	TCGG	2	8	69949	69956	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_008243	TCCC	2	8	73963	73970	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_008243	TGGA	2	8	74271	74278	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008243	CGCT	2	8	80570	80577	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008243	CCGG	2	8	100455	100462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008243	AAGC	2	8	100605	100612	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_008243	ATTC	2	8	106542	106549	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008243	CGGC	2	8	106976	106983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008243	CCAT	2	8	107258	107265	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008243	CCGC	2	8	107359	107366	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_008243	CGAA	2	8	111434	111441	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_008243	AGGA	2	8	111555	111562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008243	GCGA	2	8	111687	111694	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008243	TCCG	2	8	116775	116782	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008243	GACC	2	8	116878	116885	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008243	CGAG	2	8	116913	116920	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_008243	GCGA	2	8	117018	117025	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008243	AACC	2	8	118054	118061	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008243	CTAG	2	8	118136	118143	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_008243	AGGA	2	8	121715	121722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008243	GCGG	2	8	122880	122887	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_008243	CCGC	2	8	122894	122901	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
34	NC_008243	GTGG	2	8	122943	122950	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008243	TCGA	2	8	123562	123569	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008243	GGCC	2	8	123764	123771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008243	GATT	2	8	127294	127301	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008243	CTGG	2	8	127322	127329	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_008243	GACG	2	8	127858	127865	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_008243	GGTG	2	8	130762	130769	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.