MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mesorhizobium sp. BNC1 plasmid 2

Total Repeats: 1782

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008243	CGG	3	9	271	279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110347236
2	NC_008243	CGG	2	6	338	343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110347236
3	NC_008243	CGG	2	6	485	490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110347236
4	NC_008243	GCC	2	6	494	499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110347236
5	NC_008243	GCG	2	6	525	530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110347236
6	NC_008243	ATT	2	6	531	536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110347236
7	NC_008243	GCT	2	6	547	552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110347236
8	NC_008243	GGT	2	6	556	561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110347236
9	NC_008243	CGA	2	6	562	567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110347236
10	NC_008243	TTC	2	6	599	604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110347236
11	NC_008243	CGC	2	6	685	690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110347236
12	NC_008243	GCG	2	6	696	701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110347236
13	NC_008243	CAG	2	6	704	709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110347236
14	NC_008243	GGT	2	6	766	771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110347236
15	NC_008243	GCT	2	6	829	834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110347236
16	NC_008243	TCT	2	6	852	857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110347236
17	NC_008243	GCC	2	6	879	884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110347236
18	NC_008243	CAT	2	6	896	901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110347236
19	NC_008243	AGC	2	6	1002	1007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110347236
20	NC_008243	GCA	2	6	1021	1026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110347236
21	NC_008243	CAT	2	6	1069	1074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110347236
22	NC_008243	AGG	2	6	1242	1247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110347236
23	NC_008243	GCA	2	6	1273	1278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110347236
24	NC_008243	CGT	2	6	1297	1302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110347236
25	NC_008243	CCG	2	6	1305	1310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110347236
26	NC_008243	CGA	2	6	1318	1323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110347236
27	NC_008243	TCG	2	6	1419	1424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110347236
28	NC_008243	ACC	3	9	1520	1528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110347236
29	NC_008243	GAA	2	6	1574	1579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110347236
30	NC_008243	CTA	2	6	1585	1590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110347236
31	NC_008243	CTC	2	6	1596	1601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110347236
32	NC_008243	GGC	2	6	1636	1641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110347236
33	NC_008243	CCG	2	6	1691	1696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110347236
34	NC_008243	CAT	2	6	1825	1830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110347236
35	NC_008243	CGA	3	9	1858	1866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110347236
36	NC_008243	GCG	2	6	1912	1917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110347236
37	NC_008243	GCG	2	6	1960	1965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110347236
38	NC_008243	GCC	2	6	1978	1983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110347236
39	NC_008243	CGG	2	6	1996	2001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110347236
40	NC_008243	CAC	2	6	2032	2037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110347236
41	NC_008243	CAG	2	6	2070	2075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110347236
42	NC_008243	TCT	2	6	2097	2102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110347236
43	NC_008243	ATC	2	6	2349	2354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110347237
44	NC_008243	CGA	2	6	2366	2371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110347237
45	NC_008243	CTG	2	6	2556	2561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110347237
46	NC_008243	GGC	2	6	2672	2677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110347237
47	NC_008243	GAA	2	6	2862	2867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110347237
48	NC_008243	ATC	2	6	2895	2900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110347237
49	NC_008243	CTG	2	6	2937	2942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110347237
50	NC_008243	GAA	2	6	2952	2957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110347237
51	NC_008243	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110347237
52	NC_008243	GCC	3	9	3311	3319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110347238
53	NC_008243	GGT	2	6	3394	3399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110347238
54	NC_008243	GGC	2	6	3532	3537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110347238
55	NC_008243	AAG	2	6	3582	3587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110347238
56	NC_008243	ACG	2	6	3600	3605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110347238
57	NC_008243	CGG	2	6	3673	3678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110347238
58	NC_008243	CAA	2	6	3827	3832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110347238
59	NC_008243	GAT	2	6	4061	4066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110347238
60	NC_008243	GAA	2	6	4316	4321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110347238
61	NC_008243	TCA	2	6	4359	4364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110347238
62	NC_008243	ACA	2	6	4542	4547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110347238
63	NC_008243	GCC	2	6	4655	4660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110347238
64	NC_008243	GAG	2	6	4664	4669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110347238
65	NC_008243	AGG	2	6	4686	4691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110347238
66	NC_008243	GAA	2	6	4712	4717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110347238
67	NC_008243	GCC	3	9	4962	4970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110347239
68	NC_008243	ATT	2	6	4982	4987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110347239
69	NC_008243	CGT	3	9	4999	5007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110347239
70	NC_008243	GCG	2	6	5069	5074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110347239
71	NC_008243	GCA	2	6	5188	5193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110347239
72	NC_008243	ATT	2	6	5282	5287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110347239
73	NC_008243	TGT	2	6	5320	5325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110347239
74	NC_008243	TTC	2	6	5342	5347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110347239
75	NC_008243	GCA	2	6	5361	5366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110347239
76	NC_008243	TTC	2	6	5397	5402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110347239
77	NC_008243	GAT	2	6	5527	5532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110347239
78	NC_008243	GCC	2	6	5657	5662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110347239
79	NC_008243	TCG	2	6	5685	5690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110347239
80	NC_008243	CGT	2	6	5692	5697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110347239
81	NC_008243	TCC	2	6	5799	5804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110347239
82	NC_008243	CGA	2	6	6084	6089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110347240
83	NC_008243	TGG	2	6	6108	6113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110347240
84	NC_008243	TTC	3	9	6134	6142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110347240
85	NC_008243	TCG	2	6	6149	6154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110347240
86	NC_008243	TCG	2	6	6185	6190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110347240
87	NC_008243	CGG	2	6	6243	6248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110347240
88	NC_008243	ACA	2	6	6257	6262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110347240
89	NC_008243	TGC	2	6	6305	6310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110347240
90	NC_008243	TGG	2	6	6317	6322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110347240
91	NC_008243	TTC	2	6	6557	6562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110347240
92	NC_008243	GGC	2	6	6564	6569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110347240
93	NC_008243	ATG	2	6	6622	6627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110347240
94	NC_008243	CAT	2	6	6684	6689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110347240
95	NC_008243	CTT	2	6	6768	6773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110347240
96	NC_008243	CGC	2	6	6784	6789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110347240
97	NC_008243	GGA	2	6	6826	6831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110347241
98	NC_008243	CGC	2	6	6854	6859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110347241
99	NC_008243	CGT	2	6	6862	6867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110347241
100	NC_008243	GAA	2	6	6980	6985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110347241
101	NC_008243	CAT	2	6	7006	7011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110347241
102	NC_008243	ACA	2	6	7021	7026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110347241
103	NC_008243	AGT	2	6	7027	7032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110347241
104	NC_008243	GAA	2	6	7165	7170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110347241
105	NC_008243	GAA	2	6	7211	7216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110347241
106	NC_008243	AGG	2	6	7270	7275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110347241
107	NC_008243	CCG	2	6	7393	7398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110347241
108	NC_008243	GAC	2	6	7406	7411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110347241
109	NC_008243	TCA	2	6	7431	7436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110347241
110	NC_008243	CAG	2	6	7457	7462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110347241
111	NC_008243	CTG	2	6	7562	7567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110347241
112	NC_008243	CTT	2	6	7737	7742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110347242
113	NC_008243	CGG	2	6	7779	7784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110347242
114	NC_008243	GCG	2	6	7840	7845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110347242
115	NC_008243	CGG	2	6	7918	7923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110347242
116	NC_008243	GAA	2	6	7993	7998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110347242
117	NC_008243	CGC	2	6	8055	8060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110347242
118	NC_008243	TGA	2	6	8314	8319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110347242
119	NC_008243	TCT	2	6	8381	8386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110347242
120	NC_008243	GAA	2	6	8560	8565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110347242
121	NC_008243	CGG	2	6	8709	8714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110347243
122	NC_008243	TGA	3	9	8734	8742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110347243
123	NC_008243	GGC	2	6	8815	8820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110347243
124	NC_008243	ACG	2	6	8979	8984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110347243
125	NC_008243	GTG	2	6	9251	9256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110347243
126	NC_008243	CGA	2	6	9364	9369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110347243
127	NC_008243	ACG	2	6	9393	9398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110347243
128	NC_008243	GCC	2	6	9445	9450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110347243
129	NC_008243	TCA	2	6	9490	9495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110347243
130	NC_008243	TTG	2	6	9519	9524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110347243
131	NC_008243	GCT	2	6	9580	9585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110347243
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133	NC_008243	CAG	2	6	9837	9842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110347244
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241	NC_008243	AGG	2	6	19107	19112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110347250
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248	NC_008243	CTC	2	6	19783	19788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110347250
249	NC_008243	CGA	2	6	19797	19802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110347250
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251	NC_008243	TCG	2	6	20006	20011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110347251
252	NC_008243	CAG	2	6	20020	20025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110347251
253	NC_008243	ATG	2	6	20084	20089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110347251
254	NC_008243	CGC	2	6	20112	20117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110347251
255	NC_008243	ATC	2	6	20138	20143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110347251
256	NC_008243	CTT	2	6	20313	20318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110347251
257	NC_008243	CAG	3	9	20395	20403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110347251
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259	NC_008243	CAC	2	6	20551	20556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110347251
260	NC_008243	ACC	3	9	20567	20575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110347251
261	NC_008243	CAC	2	6	20581	20586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110347251
262	NC_008243	GCC	2	6	20845	20850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110347251
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