MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Mesorhizobium sp. BNC1 plasmid 2

Total Repeats: 221

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008243	GC	3	6	1617	1622	0 %	0 %	50 %	50 %	110347236
2	NC_008243	CT	4	8	1844	1851	0 %	50 %	0 %	50 %	110347236
3	NC_008243	CT	3	6	2101	2106	0 %	50 %	0 %	50 %	110347236
4	NC_008243	GC	3	6	2436	2441	0 %	0 %	50 %	50 %	110347237
5	NC_008243	TG	3	6	2579	2584	0 %	50 %	50 %	0 %	110347237
6	NC_008243	AC	3	6	3172	3177	50 %	0 %	0 %	50 %	110347237
7	NC_008243	GA	3	6	5220	5225	50 %	0 %	50 %	0 %	110347239
8	NC_008243	TC	3	6	5294	5299	0 %	50 %	0 %	50 %	110347239
9	NC_008243	CG	3	6	6454	6459	0 %	0 %	50 %	50 %	110347240
10	NC_008243	GC	3	6	6810	6815	0 %	0 %	50 %	50 %	110347241
11	NC_008243	CA	3	6	7435	7440	50 %	0 %	0 %	50 %	110347241
12	NC_008243	CG	3	6	8223	8228	0 %	0 %	50 %	50 %	110347242
13	NC_008243	CG	3	6	9300	9305	0 %	0 %	50 %	50 %	110347243
14	NC_008243	GC	3	6	9554	9559	0 %	0 %	50 %	50 %	110347243
15	NC_008243	AC	4	8	9612	9619	50 %	0 %	0 %	50 %	110347243
16	NC_008243	CG	3	6	10521	10526	0 %	0 %	50 %	50 %	110347244
17	NC_008243	TG	3	6	11914	11919	0 %	50 %	50 %	0 %	110347244
18	NC_008243	TC	3	6	12040	12045	0 %	50 %	0 %	50 %	110347244
19	NC_008243	CG	3	6	12160	12165	0 %	0 %	50 %	50 %	110347244
20	NC_008243	CG	3	6	13426	13431	0 %	0 %	50 %	50 %	110347245
21	NC_008243	GC	3	6	14526	14531	0 %	0 %	50 %	50 %	110347246
22	NC_008243	TG	3	6	14792	14797	0 %	50 %	50 %	0 %	110347246
23	NC_008243	GC	3	6	15549	15554	0 %	0 %	50 %	50 %	110347247
24	NC_008243	CT	3	6	16091	16096	0 %	50 %	0 %	50 %	110347247
25	NC_008243	GC	3	6	16098	16103	0 %	0 %	50 %	50 %	110347247
26	NC_008243	GC	3	6	16182	16187	0 %	0 %	50 %	50 %	110347247
27	NC_008243	AT	3	6	17775	17780	50 %	50 %	0 %	0 %	110347249
28	NC_008243	CT	3	6	18032	18037	0 %	50 %	0 %	50 %	110347249
29	NC_008243	CT	3	6	18468	18473	0 %	50 %	0 %	50 %	110347249
30	NC_008243	GT	3	6	19381	19386	0 %	50 %	50 %	0 %	110347250
31	NC_008243	CG	3	6	20711	20716	0 %	0 %	50 %	50 %	110347251
32	NC_008243	CG	3	6	21125	21130	0 %	0 %	50 %	50 %	110347251
33	NC_008243	CG	3	6	21522	21527	0 %	0 %	50 %	50 %	110347251
34	NC_008243	GC	3	6	22724	22729	0 %	0 %	50 %	50 %	110347252
35	NC_008243	TC	3	6	23668	23673	0 %	50 %	0 %	50 %	110347253
36	NC_008243	CG	3	6	24033	24038	0 %	0 %	50 %	50 %	110347253
37	NC_008243	CG	3	6	24651	24656	0 %	0 %	50 %	50 %	110347254
38	NC_008243	CG	4	8	24885	24892	0 %	0 %	50 %	50 %	110347254
39	NC_008243	CG	3	6	25101	25106	0 %	0 %	50 %	50 %	110347255
40	NC_008243	TC	3	6	25417	25422	0 %	50 %	0 %	50 %	110347255
41	NC_008243	CG	3	6	26020	26025	0 %	0 %	50 %	50 %	110347256
42	NC_008243	CG	5	10	26565	26574	0 %	0 %	50 %	50 %	110347257
43	NC_008243	GC	3	6	26580	26585	0 %	0 %	50 %	50 %	110347257
44	NC_008243	CG	4	8	26681	26688	0 %	0 %	50 %	50 %	110347257
45	NC_008243	CG	3	6	26744	26749	0 %	0 %	50 %	50 %	110347257
46	NC_008243	CG	3	6	27241	27246	0 %	0 %	50 %	50 %	110347258
47	NC_008243	GC	3	6	27306	27311	0 %	0 %	50 %	50 %	110347258
48	NC_008243	CG	3	6	27417	27422	0 %	0 %	50 %	50 %	110347258
49	NC_008243	CG	3	6	27811	27816	0 %	0 %	50 %	50 %	110347259
50	NC_008243	CG	3	6	28531	28536	0 %	0 %	50 %	50 %	110347259
51	NC_008243	CA	3	6	28928	28933	50 %	0 %	0 %	50 %	110347259
52	NC_008243	GC	3	6	28942	28947	0 %	0 %	50 %	50 %	110347259
53	NC_008243	GC	3	6	28994	28999	0 %	0 %	50 %	50 %	110347259
54	NC_008243	GC	3	6	29112	29117	0 %	0 %	50 %	50 %	110347259
55	NC_008243	CG	3	6	31111	31116	0 %	0 %	50 %	50 %	110347262
56	NC_008243	GC	3	6	31665	31670	0 %	0 %	50 %	50 %	110347263
57	NC_008243	TC	4	8	32156	32163	0 %	50 %	0 %	50 %	110347263
58	NC_008243	TC	3	6	33226	33231	0 %	50 %	0 %	50 %	110347264
59	NC_008243	GA	3	6	33893	33898	50 %	0 %	50 %	0 %	110347265
60	NC_008243	TC	3	6	34267	34272	0 %	50 %	0 %	50 %	110347266
61	NC_008243	GC	3	6	34973	34978	0 %	0 %	50 %	50 %	110347266
62	NC_008243	CG	3	6	35659	35664	0 %	0 %	50 %	50 %	110347267
63	NC_008243	GT	3	6	35735	35740	0 %	50 %	50 %	0 %	110347267
64	NC_008243	CG	3	6	37309	37314	0 %	0 %	50 %	50 %	110347269
65	NC_008243	GC	3	6	37967	37972	0 %	0 %	50 %	50 %	110347269
66	NC_008243	CG	3	6	38689	38694	0 %	0 %	50 %	50 %	110347270
67	NC_008243	CG	4	8	39211	39218	0 %	0 %	50 %	50 %	110347271
68	NC_008243	GC	3	6	40665	40670	0 %	0 %	50 %	50 %	110347273
69	NC_008243	GA	3	6	42711	42716	50 %	0 %	50 %	0 %	110347275
70	NC_008243	AC	3	6	42733	42738	50 %	0 %	0 %	50 %	110347275
71	NC_008243	TC	3	6	43908	43913	0 %	50 %	0 %	50 %	110347276
72	NC_008243	CG	3	6	45429	45434	0 %	0 %	50 %	50 %	110347277
73	NC_008243	GC	3	6	46056	46061	0 %	0 %	50 %	50 %	110347277
74	NC_008243	GC	3	6	47339	47344	0 %	0 %	50 %	50 %	110347278
75	NC_008243	GC	3	6	47382	47387	0 %	0 %	50 %	50 %	110347278
76	NC_008243	CG	3	6	48003	48008	0 %	0 %	50 %	50 %	110347278
77	NC_008243	CG	3	6	48107	48112	0 %	0 %	50 %	50 %	110347278
78	NC_008243	CG	3	6	48145	48150	0 %	0 %	50 %	50 %	110347278
79	NC_008243	GC	3	6	48393	48398	0 %	0 %	50 %	50 %	110347279
80	NC_008243	GC	3	6	49262	49267	0 %	0 %	50 %	50 %	110347280
81	NC_008243	CG	4	8	49307	49314	0 %	0 %	50 %	50 %	110347280
82	NC_008243	CG	3	6	50298	50303	0 %	0 %	50 %	50 %	110347281
83	NC_008243	CG	4	8	50450	50457	0 %	0 %	50 %	50 %	110347281
84	NC_008243	GC	3	6	51218	51223	0 %	0 %	50 %	50 %	110347282
85	NC_008243	GC	4	8	51703	51710	0 %	0 %	50 %	50 %	110347282
86	NC_008243	GC	3	6	51915	51920	0 %	0 %	50 %	50 %	110347283
87	NC_008243	CG	3	6	51947	51952	0 %	0 %	50 %	50 %	110347283
88	NC_008243	CG	4	8	52004	52011	0 %	0 %	50 %	50 %	110347283
89	NC_008243	GC	4	8	52017	52024	0 %	0 %	50 %	50 %	110347283
90	NC_008243	CT	3	6	52568	52573	0 %	50 %	0 %	50 %	110347283
91	NC_008243	GC	3	6	53373	53378	0 %	0 %	50 %	50 %	110347284
92	NC_008243	CG	3	6	53613	53618	0 %	0 %	50 %	50 %	110347284
93	NC_008243	CG	3	6	54129	54134	0 %	0 %	50 %	50 %	110347285
94	NC_008243	GC	3	6	55036	55041	0 %	0 %	50 %	50 %	110347286
95	NC_008243	CG	3	6	55092	55097	0 %	0 %	50 %	50 %	110347286
96	NC_008243	GC	5	10	55362	55371	0 %	0 %	50 %	50 %	110347286
97	NC_008243	CG	3	6	55469	55474	0 %	0 %	50 %	50 %	110347286
98	NC_008243	CT	3	6	56253	56258	0 %	50 %	0 %	50 %	110347287
99	NC_008243	CA	3	6	56754	56759	50 %	0 %	0 %	50 %	110347287
100	NC_008243	AG	3	6	57803	57808	50 %	0 %	50 %	0 %	110347288
101	NC_008243	GC	3	6	57903	57908	0 %	0 %	50 %	50 %	110347288
102	NC_008243	GC	3	6	57960	57965	0 %	0 %	50 %	50 %	110347288
103	NC_008243	GC	3	6	58228	58233	0 %	0 %	50 %	50 %	110347288
104	NC_008243	GC	3	6	58944	58949	0 %	0 %	50 %	50 %	110347289
105	NC_008243	GC	3	6	59273	59278	0 %	0 %	50 %	50 %	110347289
106	NC_008243	CG	4	8	59359	59366	0 %	0 %	50 %	50 %	110347289
107	NC_008243	CG	3	6	59583	59588	0 %	0 %	50 %	50 %	110347289
108	NC_008243	GC	3	6	60680	60685	0 %	0 %	50 %	50 %	110347290
109	NC_008243	CG	3	6	60726	60731	0 %	0 %	50 %	50 %	110347290
110	NC_008243	GC	3	6	61423	61428	0 %	0 %	50 %	50 %	110347291
111	NC_008243	GC	3	6	61448	61453	0 %	0 %	50 %	50 %	110347291
112	NC_008243	CG	3	6	61709	61714	0 %	0 %	50 %	50 %	110347291
113	NC_008243	GC	3	6	61765	61770	0 %	0 %	50 %	50 %	110347291
114	NC_008243	GC	3	6	61814	61819	0 %	0 %	50 %	50 %	110347291
115	NC_008243	GC	3	6	62106	62111	0 %	0 %	50 %	50 %	110347291
116	NC_008243	GC	3	6	62367	62372	0 %	0 %	50 %	50 %	110347291
117	NC_008243	GC	3	6	62737	62742	0 %	0 %	50 %	50 %	110347291
118	NC_008243	GC	3	6	62744	62749	0 %	0 %	50 %	50 %	110347291
119	NC_008243	GC	3	6	63406	63411	0 %	0 %	50 %	50 %	110347292
120	NC_008243	CG	3	6	63454	63459	0 %	0 %	50 %	50 %	110347292
121	NC_008243	CG	3	6	63486	63491	0 %	0 %	50 %	50 %	110347292
122	NC_008243	TC	3	6	63696	63701	0 %	50 %	0 %	50 %	110347292
123	NC_008243	GC	3	6	63999	64004	0 %	0 %	50 %	50 %	110347292
124	NC_008243	GC	3	6	64077	64082	0 %	0 %	50 %	50 %	110347292
125	NC_008243	GC	3	6	64717	64722	0 %	0 %	50 %	50 %	110347293
126	NC_008243	GC	3	6	67057	67062	0 %	0 %	50 %	50 %	110347294
127	NC_008243	TG	4	8	67335	67342	0 %	50 %	50 %	0 %	110347295
128	NC_008243	TC	3	6	67380	67385	0 %	50 %	0 %	50 %	110347295
129	NC_008243	TC	3	6	67710	67715	0 %	50 %	0 %	50 %	110347295
130	NC_008243	CG	3	6	67718	67723	0 %	0 %	50 %	50 %	110347295
131	NC_008243	GC	3	6	68754	68759	0 %	0 %	50 %	50 %	110347296
132	NC_008243	GC	3	6	68933	68938	0 %	0 %	50 %	50 %	110347296
133	NC_008243	CG	3	6	68955	68960	0 %	0 %	50 %	50 %	110347296
134	NC_008243	GC	3	6	69144	69149	0 %	0 %	50 %	50 %	110347296
135	NC_008243	GC	3	6	71006	71011	0 %	0 %	50 %	50 %	110347297
136	NC_008243	AC	3	6	71498	71503	50 %	0 %	0 %	50 %	110347297
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138	NC_008243	GA	3	6	74701	74706	50 %	0 %	50 %	0 %	110347301
139	NC_008243	CG	4	8	75382	75389	0 %	0 %	50 %	50 %	110347302
140	NC_008243	GA	3	6	75394	75399	50 %	0 %	50 %	0 %	110347302
141	NC_008243	GC	3	6	76685	76690	0 %	0 %	50 %	50 %	110347304
142	NC_008243	GC	3	6	76782	76787	0 %	0 %	50 %	50 %	110347304
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.