MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mesorhizobium sp. BNC1 plasmid 1

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008242	CCGCT	2	10	2720	2729	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_008242	GCAGC	2	10	10436	10445	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_008242	AAACC	2	10	13991	14000	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_008242	GCAGC	2	10	19604	19613	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_008242	GCAAC	2	10	33740	33749	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_008242	GGCGC	2	10	33832	33841	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7	NC_008242	ACCCG	2	10	46782	46791	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_008242	ACGCC	2	10	46844	46853	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_008242	AGCAA	2	10	48148	48157	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_008242	CGGCC	2	10	51042	51051	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11	NC_008242	CCCGC	2	10	58533	58542	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
12	NC_008242	GCCGC	2	10	90503	90512	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13	NC_008242	CGGCG	2	10	91611	91620	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14	NC_008242	GGGGA	2	10	93149	93158	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008242	ATCGC	2	10	99251	99260	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_008242	GCGAG	2	10	99471	99480	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_008242	GCGCC	2	10	104628	104637	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18	NC_008242	ACTGA	2	10	111837	111846	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_008242	GCGCT	2	10	122866	122875	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_008242	CGCGG	2	10	132699	132708	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
21	NC_008242	TCGGC	2	10	146934	146943	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_008242	CCTGA	2	10	147689	147698	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_008242	GGTTT	2	10	148115	148124	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008242	TGTGG	2	10	152371	152380	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008242	CTGCG	2	10	152790	152799	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_008242	GCCGC	3	15	186689	186703	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
27	NC_008242	CGCCC	2	10	190865	190874	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
28	NC_008242	CCGGA	2	10	208531	208540	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_008242	GCGCC	2	10	227066	227075	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
30	NC_008242	CAGCG	2	10	228907	228916	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_008242	CAGAA	2	10	254255	254264	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_008242	GAGGG	2	10	259528	259537	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008242	CAACC	2	10	262407	262416	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
34	NC_008242	GAACG	2	10	262501	262510	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_008242	ATCCT	2	10	263500	263509	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_008242	GGCCG	2	10	274704	274713	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
37	NC_008242	CCGGC	2	10	281849	281858	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
38	NC_008242	CGAGA	2	10	293561	293570	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_008242	GTTTT	2	10	300082	300091	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008242	TCAAT	2	10	312294	312303	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_008242	TTCCG	2	10	315609	315618	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_008242	GTGAT	2	10	316422	316431	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008242	CCTTC	2	10	327873	327882	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.