MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mesorhizobium sp. BNC1 plasmid 1

Total Repeats: 953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008242	TCCA	2	8	309	316	25 %	25 %	0 %	50 %	110346918
2	NC_008242	ACGA	2	8	629	636	50 %	0 %	25 %	25 %	110346918
3	NC_008242	ATCG	2	8	727	734	25 %	25 %	25 %	25 %	110346918
4	NC_008242	GCGG	2	8	1224	1231	0 %	0 %	75 %	25 %	110346919
5	NC_008242	CTAT	2	8	1709	1716	25 %	50 %	0 %	25 %	110346919
6	NC_008242	GCTC	2	8	2014	2021	0 %	25 %	25 %	50 %	110346919
7	NC_008242	TGGC	2	8	2168	2175	0 %	25 %	50 %	25 %	110346920
8	NC_008242	TTCT	2	8	2243	2250	0 %	75 %	0 %	25 %	110346920
9	NC_008242	CTGG	2	8	2691	2698	0 %	25 %	50 %	25 %	110346920
10	NC_008242	TCGA	2	8	3057	3064	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_008242	TCGC	2	8	3175	3182	0 %	25 %	25 %	50 %	110346921
12	NC_008242	GAGC	2	8	3676	3683	25 %	0 %	50 %	25 %	110346922
13	NC_008242	GTTC	2	8	3921	3928	0 %	50 %	25 %	25 %	110346922
14	NC_008242	ATCG	3	12	4048	4059	25 %	25 %	25 %	25 %	110346923
15	NC_008242	GCGG	2	8	4294	4301	0 %	0 %	75 %	25 %	110346923
16	NC_008242	TTCG	2	8	4627	4634	0 %	50 %	25 %	25 %	110346923
17	NC_008242	GGGC	2	8	5100	5107	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_008242	TGAA	2	8	5771	5778	50 %	25 %	25 %	0 %	110346924
19	NC_008242	GAAG	2	8	5799	5806	50 %	0 %	50 %	0 %	110346924
20	NC_008242	GCTT	2	8	6371	6378	0 %	50 %	25 %	25 %	110346925
21	NC_008242	CTCG	2	8	6547	6554	0 %	25 %	25 %	50 %	110346925
22	NC_008242	CCCG	2	8	6625	6632	0 %	0 %	25 %	75 %	110346925
23	NC_008242	GTCG	2	8	7408	7415	0 %	25 %	50 %	25 %	110346926
24	NC_008242	GCCT	2	8	7474	7481	0 %	25 %	25 %	50 %	110346926
25	NC_008242	TCGC	2	8	7540	7547	0 %	25 %	25 %	50 %	110346926
26	NC_008242	GGAA	2	8	7604	7611	50 %	0 %	50 %	0 %	110346926
27	NC_008242	CGGG	2	8	8197	8204	0 %	0 %	75 %	25 %	110346927
28	NC_008242	CGTC	2	8	8245	8252	0 %	25 %	25 %	50 %	110346927
29	NC_008242	AGCG	2	8	8283	8290	25 %	0 %	50 %	25 %	110346927
30	NC_008242	GCCG	2	8	8967	8974	0 %	0 %	50 %	50 %	110346928
31	NC_008242	TGGC	2	8	9554	9561	0 %	25 %	50 %	25 %	110346929
32	NC_008242	GGGA	2	8	10224	10231	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008242	TCGC	2	8	10232	10239	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008242	GCCG	2	8	10419	10426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008242	GAGC	2	8	10475	10482	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008242	GTCC	2	8	10486	10493	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008242	ATGC	2	8	10627	10634	25 %	25 %	25 %	25 %	110346930
38	NC_008242	GACC	2	8	11937	11944	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008242	CCTA	2	8	12013	12020	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008242	CTGA	2	8	12208	12215	25 %	25 %	25 %	25 %	110346931
41	NC_008242	TTCC	2	8	13123	13130	0 %	50 %	0 %	50 %	110346932
42	NC_008242	TGCC	2	8	13439	13446	0 %	25 %	25 %	50 %	110346932
43	NC_008242	TCGA	2	8	13881	13888	25 %	25 %	25 %	25 %	110346933
44	NC_008242	CGAC	2	8	14513	14520	25 %	0 %	25 %	50 %	110346934
45	NC_008242	TGAA	2	8	15545	15552	50 %	25 %	25 %	0 %	110346935
46	NC_008242	GATC	2	8	15687	15694	25 %	25 %	25 %	25 %	110346935
47	NC_008242	GCAA	2	8	15949	15956	50 %	0 %	25 %	25 %	110346935
48	NC_008242	CGAT	2	8	16155	16162	25 %	25 %	25 %	25 %	110346936
49	NC_008242	ACGG	2	8	16463	16470	25 %	0 %	50 %	25 %	110346936
50	NC_008242	GCTG	2	8	16598	16605	0 %	25 %	50 %	25 %	110346936
51	NC_008242	AACA	2	8	16853	16860	75 %	0 %	0 %	25 %	110346936
52	NC_008242	GCCC	2	8	16994	17001	0 %	0 %	25 %	75 %	110346936
53	NC_008242	ATCG	2	8	17184	17191	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_008242	TCGT	2	8	18185	18192	0 %	50 %	25 %	25 %	110346938
55	NC_008242	AGGG	2	8	18916	18923	25 %	0 %	75 %	0 %	110346938
56	NC_008242	AGCG	2	8	19064	19071	25 %	0 %	50 %	25 %	110346938
57	NC_008242	GCCA	2	8	19418	19425	25 %	0 %	25 %	50 %	110346938
58	NC_008242	CCGG	2	8	19744	19751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008242	CATT	2	8	20122	20129	25 %	50 %	0 %	25 %	110346939
60	NC_008242	GTTC	2	8	20155	20162	0 %	50 %	25 %	25 %	110346939
61	NC_008242	ATTG	2	8	20425	20432	25 %	50 %	25 %	0 %	110346939
62	NC_008242	TCTT	2	8	20556	20563	0 %	75 %	0 %	25 %	110346939
63	NC_008242	GCTG	2	8	21448	21455	0 %	25 %	50 %	25 %	110346939
64	NC_008242	AGCA	2	8	21769	21776	50 %	0 %	25 %	25 %	110346940
65	NC_008242	CGAT	2	8	22870	22877	25 %	25 %	25 %	25 %	110346941
66	NC_008242	AGCC	2	8	23041	23048	25 %	0 %	25 %	50 %	110346941
67	NC_008242	CGCC	2	8	23884	23891	0 %	0 %	25 %	75 %	110346942
68	NC_008242	CAGG	2	8	24857	24864	25 %	0 %	50 %	25 %	110346942
69	NC_008242	GTCC	2	8	24929	24936	0 %	25 %	25 %	50 %	110346942
70	NC_008242	ACGC	2	8	24955	24962	25 %	0 %	25 %	50 %	110346942
71	NC_008242	CGAG	2	8	25359	25366	25 %	0 %	50 %	25 %	110346942
72	NC_008242	GAAC	2	8	25646	25653	50 %	0 %	25 %	25 %	110346942
73	NC_008242	ACCA	2	8	25709	25716	50 %	0 %	0 %	50 %	110346942
74	NC_008242	CACG	2	8	26695	26702	25 %	0 %	25 %	50 %	110346943
75	NC_008242	GGAC	2	8	26920	26927	25 %	0 %	50 %	25 %	110346943
76	NC_008242	CCGA	2	8	27590	27597	25 %	0 %	25 %	50 %	110346943
77	NC_008242	ATCG	2	8	27605	27612	25 %	25 %	25 %	25 %	110346943
78	NC_008242	GCTG	2	8	27991	27998	0 %	25 %	50 %	25 %	110346943
79	NC_008242	CGCT	2	8	30389	30396	0 %	25 %	25 %	50 %	110346946
80	NC_008242	GCTC	2	8	31094	31101	0 %	25 %	25 %	50 %	110346947
81	NC_008242	TGGC	2	8	31666	31673	0 %	25 %	50 %	25 %	110346948
82	NC_008242	TTGA	2	8	31979	31986	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008242	CACC	2	8	33007	33014	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
84	NC_008242	AGGA	2	8	33469	33476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008242	GCAC	2	8	33768	33775	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_008242	CCGG	2	8	34066	34073	0 %	0 %	50 %	50 %	110346950
87	NC_008242	CCAC	2	8	34350	34357	25 %	0 %	0 %	75 %	110346950
88	NC_008242	GCCC	2	8	34691	34698	0 %	0 %	25 %	75 %	110346951
89	NC_008242	CTTC	2	8	35130	35137	0 %	50 %	0 %	50 %	110346951
90	NC_008242	GCGG	2	8	35892	35899	0 %	0 %	75 %	25 %	110346952
91	NC_008242	GTCA	2	8	36266	36273	25 %	25 %	25 %	25 %	110346953
92	NC_008242	CCGC	2	8	36304	36311	0 %	0 %	25 %	75 %	110346953
93	NC_008242	CCGT	2	8	36980	36987	0 %	25 %	25 %	50 %	110346954
94	NC_008242	GCTC	2	8	37034	37041	0 %	25 %	25 %	50 %	110346954
95	NC_008242	CGTG	2	8	37445	37452	0 %	25 %	50 %	25 %	110346955
96	NC_008242	TCGC	2	8	37479	37486	0 %	25 %	25 %	50 %	110346955
97	NC_008242	GTTC	2	8	38390	38397	0 %	50 %	25 %	25 %	110346955
98	NC_008242	CAGG	2	8	38745	38752	25 %	0 %	50 %	25 %	110346955
99	NC_008242	CGTT	2	8	38941	38948	0 %	50 %	25 %	25 %	110346955
100	NC_008242	CGGT	2	8	39103	39110	0 %	25 %	50 %	25 %	110346955
101	NC_008242	CCTT	2	8	39112	39119	0 %	50 %	0 %	50 %	110346955
102	NC_008242	CGCT	2	8	39591	39598	0 %	25 %	25 %	50 %	110346956
103	NC_008242	ATCC	2	8	40006	40013	25 %	25 %	0 %	50 %	110346956
104	NC_008242	GCAG	2	8	40096	40103	25 %	0 %	50 %	25 %	110346956
105	NC_008242	GATA	2	8	41070	41077	50 %	25 %	25 %	0 %	110346957
106	NC_008242	TCGC	2	8	41173	41180	0 %	25 %	25 %	50 %	110346957
107	NC_008242	CGTT	2	8	41404	41411	0 %	50 %	25 %	25 %	110346957
108	NC_008242	CAGA	2	8	42152	42159	50 %	0 %	25 %	25 %	110346957
109	NC_008242	GCCC	2	8	42492	42499	0 %	0 %	25 %	75 %	110346957
110	NC_008242	GCGT	2	8	43460	43467	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_008242	GGCA	2	8	43492	43499	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_008242	CGTC	2	8	43746	43753	0 %	25 %	25 %	50 %	110346959
113	NC_008242	GAAG	2	8	44103	44110	50 %	0 %	50 %	0 %	110346959
114	NC_008242	AAGC	2	8	45230	45237	50 %	0 %	25 %	25 %	110346959
115	NC_008242	GCCG	2	8	45633	45640	0 %	0 %	50 %	50 %	110346959
116	NC_008242	CGGA	2	8	45867	45874	25 %	0 %	50 %	25 %	110346960
117	NC_008242	CGGC	2	8	45937	45944	0 %	0 %	50 %	50 %	110346960
118	NC_008242	CCAA	2	8	47542	47549	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_008242	GCTC	2	8	47891	47898	0 %	25 %	25 %	50 %	110346963
120	NC_008242	GCTG	2	8	48487	48494	0 %	25 %	50 %	25 %	110346964
121	NC_008242	GATC	2	8	48619	48626	25 %	25 %	25 %	25 %	110346965
122	NC_008242	ATCT	2	8	49088	49095	25 %	50 %	0 %	25 %	110346966
123	NC_008242	AGGA	2	8	50720	50727	50 %	0 %	50 %	0 %	110346967
124	NC_008242	GGAG	2	8	51015	51022	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008242	CGGC	2	8	51027	51034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_008242	CGGC	2	8	51574	51581	0 %	0 %	50 %	50 %	110346968
127	NC_008242	CCAT	2	8	51595	51602	25 %	25 %	0 %	50 %	110346968
128	NC_008242	CGCC	2	8	52033	52040	0 %	0 %	25 %	75 %	110346968
129	NC_008242	CGGC	2	8	52216	52223	0 %	0 %	50 %	50 %	110346968
130	NC_008242	CCGG	2	8	52508	52515	0 %	0 %	50 %	50 %	110346968
131	NC_008242	GCAG	2	8	52729	52736	25 %	0 %	50 %	25 %	110346968
132	NC_008242	CCGA	2	8	53739	53746	25 %	0 %	25 %	50 %	110346968
133	NC_008242	TTCC	2	8	53810	53817	0 %	50 %	0 %	50 %	110346968
134	NC_008242	CGGA	2	8	54281	54288	25 %	0 %	50 %	25 %	110346968
135	NC_008242	ACCA	2	8	54297	54304	50 %	0 %	0 %	50 %	110346968
136	NC_008242	CGGG	2	8	54424	54431	0 %	0 %	75 %	25 %	110346968
137	NC_008242	GCGG	2	8	54476	54483	0 %	0 %	75 %	25 %	110346968
138	NC_008242	CCGA	2	8	55014	55021	25 %	0 %	25 %	50 %	110346968
139	NC_008242	GGCC	2	8	55334	55341	0 %	0 %	50 %	50 %	110346968
140	NC_008242	ACCG	2	8	55581	55588	25 %	0 %	25 %	50 %	110346968
141	NC_008242	GAGG	2	8	55607	55614	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008242	CATG	2	8	55757	55764	25 %	25 %	25 %	25 %	110346969
143	NC_008242	GCCG	2	8	56040	56047	0 %	0 %	50 %	50 %	110346969
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499	NC_008242	CATC	2	8	177558	177565	25 %	25 %	0 %	50 %	110347071
500	NC_008242	GCAA	2	8	177740	177747	50 %	0 %	25 %	25 %	110347071

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