MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Mesorhizobium sp. BNC1 plasmid 1

Total Repeats: 679

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008242	GTC	2	6	743	748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008242	AGT	2	6	2857	2862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008242	GCC	2	6	3093	3098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_008242	CGC	2	6	3106	3111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_008242	GCG	2	6	3471	3476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008242	CCA	2	6	3954	3959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_008242	CGA	2	6	4819	4824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008242	TGA	2	6	4980	4985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008242	TCG	2	6	5186	5191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008242	GCC	2	6	5328	5333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_008242	GCA	2	6	6000	6005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008242	ATC	2	6	6010	6015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008242	TGC	2	6	6031	6036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008242	CCG	2	6	9975	9980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_008242	GCA	2	6	9987	9992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008242	CGT	2	6	10313	10318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008242	GCG	3	9	10351	10359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008242	CGG	2	6	11541	11546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008242	GCA	2	6	11618	11623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008242	TGC	2	6	11633	11638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008242	GAC	2	6	11760	11765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008242	TCG	2	6	11802	11807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008242	ATC	2	6	11863	11868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008242	GAT	2	6	11969	11974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008242	ACA	2	6	12064	12069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008242	CGG	2	6	12086	12091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008242	ACG	2	6	12808	12813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008242	TGC	2	6	13484	13489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_008242	ATA	2	6	13537	13542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008242	GGA	2	6	13555	13560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008242	CTC	3	9	17078	17086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_008242	AGC	2	6	17146	17151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008242	CGA	2	6	19572	19577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008242	TGG	2	6	19787	19792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008242	TCA	2	6	19901	19906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_008242	GCC	2	6	19969	19974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_008242	GAA	2	6	25848	25853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008242	GCT	2	6	25879	25884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008242	GCG	2	6	28809	28814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008242	GGA	2	6	28874	28879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008242	GTC	2	6	28888	28893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008242	TCG	2	6	32772	32777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008242	CAG	2	6	32930	32935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008242	ATC	2	6	33018	33023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008242	CGG	2	6	33044	33049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008242	GCT	2	6	33079	33084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008242	CCA	2	6	33200	33205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_008242	CTT	2	6	33290	33295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008242	TGG	2	6	33458	33463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008242	TCG	2	6	33670	33675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008242	CGC	3	9	33697	33705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_008242	CGC	3	9	33781	33789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_008242	GCG	3	9	33902	33910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008242	CGC	2	6	34503	34508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_008242	CGA	2	6	42529	42534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008242	TGG	2	6	43476	43481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008242	GCC	2	6	43560	43565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_008242	GCC	2	6	46855	46860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_008242	GCA	2	6	47526	47531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008242	GCG	2	6	49363	49368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008242	CCA	2	6	49425	49430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_008242	GTC	2	6	49437	49442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008242	CCA	2	6	49544	49549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_008242	GCA	2	6	49575	49580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008242	CCA	2	6	49614	49619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_008242	GAC	2	6	49675	49680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008242	GAT	2	6	50997	51002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008242	CGG	2	6	56669	56674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008242	CGG	2	6	56723	56728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008242	TCC	2	6	56802	56807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_008242	CGA	2	6	57872	57877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008242	ACG	2	6	57886	57891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008242	GTT	2	6	58662	58667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008242	TTG	2	6	58823	58828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008242	CTC	2	6	58850	58855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_008242	GTG	2	6	58880	58885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008242	GAT	2	6	58951	58956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008242	GCA	2	6	59172	59177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008242	AGG	2	6	59614	59619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008242	CGA	2	6	60339	60344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008242	GCC	2	6	60407	60412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_008242	GCC	2	6	60441	60446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_008242	TCC	2	6	65628	65633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_008242	GTT	2	6	65695	65700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008242	CGA	2	6	65840	65845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008242	TCC	2	6	66005	66010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_008242	TGA	2	6	66030	66035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008242	CTG	2	6	73200	73205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008242	GCC	2	6	74309	74314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_008242	TCT	2	6	74403	74408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008242	GCT	2	6	80099	80104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008242	TCT	2	6	80295	80300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008242	ATT	2	6	83262	83267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008242	CCA	2	6	83308	83313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_008242	TCG	2	6	83350	83355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008242	GCG	2	6	83360	83365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008242	CTA	2	6	86520	86525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008242	CAT	2	6	86529	86534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008242	GCG	2	6	86610	86615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008242	CTT	2	6	86644	86649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008242	CGT	2	6	90533	90538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008242	GTA	2	6	90540	90545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008242	CTG	2	6	90555	90560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_008242	CTG	2	6	90579	90584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_008242	GCG	2	6	90690	90695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008242	CAG	2	6	90837	90842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008242	TCG	2	6	90856	90861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_008242	GCC	2	6	90912	90917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_008242	ACC	2	6	91002	91007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_008242	AGC	3	9	91024	91032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008242	CGG	2	6	91082	91087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_008242	GCC	2	6	91239	91244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_008242	ATG	2	6	91369	91374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008242	GCC	2	6	91433	91438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_008242	CGT	3	9	91533	91541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008242	GCA	2	6	91581	91586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_008242	GGC	3	9	91663	91671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008242	GCG	2	6	92790	92795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008242	ACG	2	6	94415	94420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_008242	GCG	2	6	94462	94467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008242	CCG	2	6	94494	94499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_008242	TTG	2	6	94513	94518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008242	CGC	2	6	98306	98311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_008242	ATC	2	6	98337	98342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_008242	GCG	2	6	98360	98365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_008242	TCG	2	6	98748	98753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_008242	GCG	2	6	98754	98759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008242	GCG	2	6	98903	98908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_008242	TCG	2	6	98909	98914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008242	GGT	2	6	99081	99086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008242	GAC	3	9	99129	99137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_008242	CGC	2	6	99145	99150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_008242	ACC	2	6	99313	99318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_008242	GCT	2	6	99354	99359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_008242	GCA	2	6	99416	99421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_008242	GGC	3	9	99442	99450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_008242	TCG	2	6	99527	99532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008242	TCG	2	6	99631	99636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_008242	GCC	2	6	99764	99769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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404	NC_008242	GTT	2	6	176574	176579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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