MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mesorhizobium sp. BNC1 plasmid 1

Total Repeats: 4556

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008242	AGC	2	6	44	49	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346918
2	NC_008242	GGC	2	6	69	74	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110346918
3	NC_008242	TCA	3	9	78	86	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110346918
4	NC_008242	ATG	2	6	104	109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110346918
5	NC_008242	CCG	2	6	110	115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110346918
6	NC_008242	CGG	2	6	162	167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110346918
7	NC_008242	TGC	2	6	171	176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346918
8	NC_008242	GAG	2	6	232	237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110346918
9	NC_008242	CCG	2	6	261	266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110346918
10	NC_008242	AGC	2	6	395	400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346918
11	NC_008242	TCA	2	6	423	428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110346918
12	NC_008242	CAG	2	6	445	450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346918
13	NC_008242	CCA	2	6	455	460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110346918
14	NC_008242	GCC	2	6	496	501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110346918
15	NC_008242	GAC	2	6	574	579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346918
16	NC_008242	CGC	2	6	618	623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110346918
17	NC_008242	CGA	2	6	967	972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346919
18	NC_008242	CGG	2	6	1203	1208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110346919
19	NC_008242	TTC	2	6	1242	1247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110346919
20	NC_008242	GAA	2	6	1267	1272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110346919
21	NC_008242	GAA	2	6	1275	1280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110346919
22	NC_008242	TCG	2	6	1360	1365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346919
23	NC_008242	TGG	2	6	1421	1426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110346919
24	NC_008242	CAG	2	6	1451	1456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346919
25	NC_008242	CGG	2	6	1478	1483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110346919
26	NC_008242	CAA	2	6	1500	1505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110346919
27	NC_008242	CCT	2	6	1559	1564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110346919
28	NC_008242	AGC	2	6	1652	1657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346919
29	NC_008242	TCT	2	6	1673	1678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110346919
30	NC_008242	GAG	2	6	1732	1737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110346919
31	NC_008242	CAA	2	6	1842	1847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110346919
32	NC_008242	CGG	2	6	1941	1946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110346919
33	NC_008242	CGG	2	6	2070	2075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110346919
34	NC_008242	TGC	2	6	2257	2262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346920
35	NC_008242	TCT	2	6	2364	2369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110346920
36	NC_008242	TCG	2	6	2382	2387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346920
37	NC_008242	TGA	2	6	2418	2423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110346920
38	NC_008242	CTT	2	6	2539	2544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110346920
39	NC_008242	CGT	2	6	2578	2583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346920
40	NC_008242	TCG	2	6	2643	2648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346920
41	NC_008242	GAA	2	6	2663	2668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110346920
42	NC_008242	GCG	2	6	2678	2683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110346920
43	NC_008242	TTC	2	6	3248	3253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110346921
44	NC_008242	GGC	2	6	3313	3318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110346921
45	NC_008242	GAT	2	6	3402	3407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110346921
46	NC_008242	ACT	2	6	3702	3707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110346922
47	NC_008242	GCG	2	6	3770	3775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110346922
48	NC_008242	CCG	2	6	3865	3870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110346922
49	NC_008242	GGT	2	6	3999	4004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110346923
50	NC_008242	CAT	2	6	4090	4095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110346923
51	NC_008242	ATC	2	6	4109	4114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110346923
52	NC_008242	CGA	2	6	4216	4221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346923
53	NC_008242	TTG	2	6	4257	4262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110346923
54	NC_008242	TTC	2	6	4265	4270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110346923
55	NC_008242	CGC	2	6	4432	4437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110346923
56	NC_008242	AAG	2	6	4532	4537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110346923
57	NC_008242	GAA	2	6	4544	4549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110346923
58	NC_008242	CAT	2	6	4573	4578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110346923
59	NC_008242	ATC	2	6	4649	4654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110346923
60	NC_008242	TGG	2	6	5402	5407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110346924
61	NC_008242	GGC	2	6	5562	5567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110346924
62	NC_008242	AAG	2	6	5626	5631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110346924
63	NC_008242	GCT	2	6	5662	5667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346924
64	NC_008242	CTT	2	6	5688	5693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110346924
65	NC_008242	TGC	2	6	5735	5740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346924
66	NC_008242	CGA	2	6	5934	5939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346924
67	NC_008242	GCT	2	6	5940	5945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346924
68	NC_008242	GAC	2	6	6090	6095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346925
69	NC_008242	ACA	2	6	6115	6120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110346925
70	NC_008242	ACA	2	6	6129	6134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110346925
71	NC_008242	GCC	2	6	6193	6198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110346925
72	NC_008242	CGT	2	6	6292	6297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346925
73	NC_008242	GCA	2	6	6391	6396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346925
74	NC_008242	CCA	3	9	6521	6529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110346925
75	NC_008242	ACC	2	6	6648	6653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110346925
76	NC_008242	GGT	2	6	6698	6703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110346925
77	NC_008242	GCA	2	6	6709	6714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346925
78	NC_008242	CGA	2	6	6775	6780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346925
79	NC_008242	TCG	2	6	6927	6932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346925
80	NC_008242	CGA	2	6	7047	7052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346925
81	NC_008242	CGA	2	6	7060	7065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346925
82	NC_008242	TTC	2	6	7086	7091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110346925
83	NC_008242	ACG	2	6	7160	7165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346926
84	NC_008242	GTT	2	6	7339	7344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110346926
85	NC_008242	CGC	2	6	7359	7364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110346926
86	NC_008242	CGG	2	6	7394	7399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110346926
87	NC_008242	GAT	2	6	7447	7452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110346926
88	NC_008242	GAT	2	6	7558	7563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110346926
89	NC_008242	CTC	2	6	7615	7620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110346926
90	NC_008242	GCC	2	6	7667	7672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110346926
91	NC_008242	GGC	2	6	7779	7784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110346927
92	NC_008242	GCC	2	6	7818	7823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110346927
93	NC_008242	TCC	2	6	7848	7853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110346927
94	NC_008242	CTC	2	6	7922	7927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110346927
95	NC_008242	ACG	2	6	7935	7940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346927
96	NC_008242	CGC	4	12	7997	8008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110346927
97	NC_008242	TCG	2	6	8076	8081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346927
98	NC_008242	GCC	2	6	8229	8234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110346927
99	NC_008242	CCG	3	9	8254	8262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110346927
100	NC_008242	GCT	2	6	8269	8274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346927
101	NC_008242	GAA	2	6	8306	8311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110346927
102	NC_008242	CCA	2	6	8398	8403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110346927
103	NC_008242	GCT	2	6	8440	8445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346927
104	NC_008242	ATC	2	6	8474	8479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110346927
105	NC_008242	ACA	2	6	8511	8516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110346927
106	NC_008242	TCG	2	6	8569	8574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346927
107	NC_008242	CAT	2	6	8618	8623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110346927
108	NC_008242	GGC	3	9	8643	8651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110346928
109	NC_008242	GAT	2	6	8664	8669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110346928
110	NC_008242	TGA	2	6	8717	8722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110346928
111	NC_008242	CGG	2	6	8822	8827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110346928
112	NC_008242	TGG	2	6	8921	8926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110346928
113	NC_008242	GTC	2	6	8937	8942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346928
114	NC_008242	GAT	2	6	9108	9113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110346928
115	NC_008242	CGT	2	6	9125	9130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346928
116	NC_008242	CAG	2	6	9168	9173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346928
117	NC_008242	ACC	2	6	9350	9355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110346929
118	NC_008242	GAT	2	6	9362	9367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110346929
119	NC_008242	GAT	2	6	9401	9406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110346929
120	NC_008242	TCA	2	6	9415	9420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110346929
121	NC_008242	GTT	2	6	9539	9544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110346929
122	NC_008242	CCG	2	6	9613	9618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110346929
123	NC_008242	GCG	2	6	9619	9624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110346929
124	NC_008242	GCC	2	6	9685	9690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110346929
125	NC_008242	TCG	2	6	9795	9800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346929
126	NC_008242	CCG	2	6	9844	9849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110346929
127	NC_008242	TCC	2	6	9864	9869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110346929
128	NC_008242	CGC	2	6	10596	10601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110346930
129	NC_008242	AGA	2	6	10679	10684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110346930
130	NC_008242	TGC	2	6	10709	10714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346930
131	NC_008242	CAG	2	6	10734	10739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346930
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134	NC_008242	GAC	2	6	11051	11056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346930
135	NC_008242	GTA	2	6	11143	11148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110346930
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253	NC_008242	GGT	2	6	20758	20763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110346939
254	NC_008242	CTG	2	6	20858	20863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346939
255	NC_008242	CGA	2	6	20902	20907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346939
256	NC_008242	GAC	2	6	20987	20992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346939
257	NC_008242	TCC	2	6	20997	21002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110346939
258	NC_008242	TGC	2	6	21127	21132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346939
259	NC_008242	TCG	2	6	21144	21149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346939
260	NC_008242	TTC	2	6	21270	21275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110346939
261	NC_008242	CGG	2	6	21393	21398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110346939
262	NC_008242	CGA	2	6	21480	21485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346939
263	NC_008242	CTG	2	6	21536	21541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346939
264	NC_008242	ACC	2	6	21661	21666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110346940
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268	NC_008242	GAA	2	6	21885	21890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110346940
269	NC_008242	GCG	2	6	21905	21910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110346940
270	NC_008242	GAA	2	6	22195	22200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110346940
271	NC_008242	CCG	2	6	22268	22273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110346940
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274	NC_008242	TCC	2	6	22464	22469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110346940
275	NC_008242	ATC	2	6	22470	22475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110346940
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278	NC_008242	CGC	2	6	22806	22811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110346941
279	NC_008242	TCG	2	6	22888	22893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346941
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282	NC_008242	TCG	2	6	23236	23241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346941
283	NC_008242	CCT	2	6	23265	23270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110346941
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285	NC_008242	CCG	2	6	23422	23427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110346941
286	NC_008242	TCT	2	6	23465	23470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110346941
287	NC_008242	GGC	2	6	23595	23600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110346941
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291	NC_008242	CCT	2	6	23828	23833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110346942
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323	NC_008242	GAG	2	6	25697	25702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110346942
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326	NC_008242	GAA	2	6	25796	25801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110346942
327	NC_008242	GCA	2	6	25937	25942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346943
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334	NC_008242	GAG	2	6	26543	26548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110346943
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342	NC_008242	TGA	2	6	27123	27128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110346943
343	NC_008242	CGG	2	6	27135	27140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110346943
344	NC_008242	TCA	2	6	27150	27155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110346943
345	NC_008242	GAA	2	6	27167	27172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110346943
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370	NC_008242	CGA	2	6	28252	28257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346943
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372	NC_008242	AGA	2	6	28410	28415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110346943
373	NC_008242	TCG	2	6	28416	28421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346943
374	NC_008242	GCT	2	6	28493	28498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346943
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376	NC_008242	TGG	2	6	28593	28598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110346943
377	NC_008242	TGT	2	6	28599	28604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110346943
378	NC_008242	TCC	2	6	28626	28631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110346943
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381	NC_008242	CGG	2	6	29089	29094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110346944
382	NC_008242	GGC	2	6	29219	29224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110346944
383	NC_008242	TCA	2	6	29238	29243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110346944
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407	NC_008242	ACT	2	6	30595	30600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110346947
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499	NC_008242	TCG	2	6	38521	38526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346955
500	NC_008242	GCA	2	6	38579	38584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346955

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