MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Helicobacter acinonychis str. Sheeba chromosome

Total Repeats: 744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008229	CTCTAG	2	12	6183	6194	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	109946646
2	NC_008229	TGAAAA	2	12	10097	10108	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	109946649
3	NC_008229	AAAAGA	2	12	10301	10312	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	109946649
4	NC_008229	TTGATT	2	12	10510	10521	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	109946649
5	NC_008229	GGGTTT	2	12	10694	10705	0 %	50 %	50 %	0 %	109946649
6	NC_008229	TATGAA	2	12	12205	12216	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	109946650
7	NC_008229	GAAAAA	2	12	12385	12396	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	109946650
8	NC_008229	CGCTCA	2	12	14141	14152	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	109946651
9	NC_008229	CTAAAA	2	12	14159	14170	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	109946651
10	NC_008229	GAAAGA	2	12	15091	15102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946651
11	NC_008229	GAAAAA	2	12	15358	15369	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	109946651
12	NC_008229	TTTTCT	2	12	17859	17870	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	109946653
13	NC_008229	CCAGGC	2	12	21283	21294	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	109946656
14	NC_008229	ACTAAC	2	12	22280	22291	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	109946657
15	NC_008229	AAGTTA	2	12	22684	22695	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	109946657
16	NC_008229	TCTTTA	2	12	23438	23449	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	109946658
17	NC_008229	TCCCGC	2	12	26754	26765	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_008229	GGTTTT	2	12	32222	32233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008229	TGCAAA	2	12	33991	34002	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	109946665
20	NC_008229	TAAGGA	2	12	45866	45877	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	109946680
21	NC_008229	TCAATA	2	12	46430	46441	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	109946681
22	NC_008229	TAGGGG	2	12	47369	47380	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	109946683
23	NC_008229	TATTTT	2	12	48232	48243	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	109946684
24	NC_008229	AGACAA	2	12	54744	54755	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	109946690
25	NC_008229	ATGCAA	2	12	57167	57178	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	109946692
26	NC_008229	TGCCTA	2	12	62281	62292	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	109946697
27	NC_008229	TAGAGC	2	12	62463	62474	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	109946697
28	NC_008229	AATTTC	2	12	67706	67717	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	109946702
29	NC_008229	CTCGCA	2	12	69539	69550	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	109946703
30	NC_008229	CAAGCC	2	12	70915	70926	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	109946704
31	NC_008229	AAGATT	2	12	73687	73698	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	109946707
32	NC_008229	ATGACA	2	12	74645	74656	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	109946708
33	NC_008229	TGAGCG	2	12	76129	76140	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	109946709
34	NC_008229	TGAGCT	2	12	77541	77552	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	109946710
35	NC_008229	CCCATC	2	12	85934	85945	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	109946716
36	NC_008229	TAAGAA	2	12	87917	87928	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008229	ATGCAC	2	12	91941	91952	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	109946726
38	NC_008229	GTATTC	2	12	92103	92114	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	109946726
39	NC_008229	GAGCGA	2	12	93046	93057	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	109946727
40	NC_008229	AAATGC	2	12	100817	100828	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	109946734
41	NC_008229	GTTTTA	2	12	101347	101358	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008229	CCCATG	2	12	104437	104448	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	109946739
43	NC_008229	CGTGGG	2	12	106038	106049	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	109946740
44	NC_008229	GCGATG	2	12	106634	106645	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	109946740
45	NC_008229	CTTGCA	2	12	106824	106835	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	109946740
46	NC_008229	TCGCCC	2	12	111133	111144	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	109946744
47	NC_008229	ATTAAA	2	12	111977	111988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109946745
48	NC_008229	GCTCTT	2	12	116970	116981	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	109946747
49	NC_008229	GATTTG	2	12	125151	125162	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	109946759
50	NC_008229	AAAGGC	2	12	128929	128940	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	109946766
51	NC_008229	AAGTGA	2	12	130198	130209	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	109946771
52	NC_008229	CAAAAC	2	12	133869	133880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109946777
53	NC_008229	ATCACT	2	12	136067	136078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109946781
54	NC_008229	AGAGGT	2	12	141501	141512	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	109946788
55	NC_008229	CAAGTT	2	12	142859	142870	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	109946790
56	NC_008229	ATCAAT	2	12	144474	144485	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	109946791
57	NC_008229	CTTTTT	2	12	146961	146972	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	109946794
58	NC_008229	CCAATT	2	12	148289	148300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109946796
59	NC_008229	GCCTGT	2	12	150186	150197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109946800
60	NC_008229	TCCGAT	2	12	151031	151042	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	109946801
61	NC_008229	TCTTTT	2	12	153408	153419	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_008229	TCTTTA	2	12	153539	153550	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	109946802
63	NC_008229	TCGCTC	2	12	154500	154511	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008229	TTTAAT	2	12	154756	154767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109946805
65	NC_008229	AATCCC	2	12	156026	156037	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	109946808
66	NC_008229	CCCTAA	2	12	156743	156754	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	109946810
67	NC_008229	AGTGGC	2	12	156921	156932	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	109946810
68	NC_008229	AATAAA	2	12	157457	157468	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	109946811
69	NC_008229	TTCTTT	2	12	163816	163827	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	109946816
70	NC_008229	TTTTTA	2	12	164336	164347	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	109946816
71	NC_008229	TTTAGG	2	12	165569	165580	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	109946817
72	NC_008229	TTGGTG	2	12	166276	166287	0 %	50 %	50 %	0 %	109946819
73	NC_008229	GTATTT	2	12	166299	166310	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	109946819
74	NC_008229	TAAAGA	2	12	168722	168733	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	109946822
75	NC_008229	ATTGAA	2	12	169083	169094	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	109946822
76	NC_008229	ACCGGC	2	12	170449	170460	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	109946823
77	NC_008229	CAAAAA	2	12	180761	180772	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	109946832
78	NC_008229	GTGATA	2	12	181063	181074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109946832
79	NC_008229	CCAAAA	2	12	181763	181774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109946832
80	NC_008229	TAAAAT	2	12	182056	182067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109946833
81	NC_008229	CGCTTT	2	12	185209	185220	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	109946834
82	NC_008229	TTCATT	2	12	191068	191079	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	109946840
83	NC_008229	GCGTAA	2	12	192447	192458	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	109946842
84	NC_008229	ATCAAA	2	12	193868	193879	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	109946844
85	NC_008229	TTGGTT	2	12	197381	197392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109946850
86	NC_008229	AAAACA	2	12	197870	197881	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	109946851
87	NC_008229	CGCCTT	2	12	198223	198234	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	109946851
88	NC_008229	GCTAAA	2	12	201997	202008	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	109946861
89	NC_008229	AAATAC	2	12	206250	206261	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	109946865
90	NC_008229	ATTTGT	2	12	209914	209925	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	109946870
91	NC_008229	ATTATA	2	12	212098	212109	50 %	50 %	0 %	0 %	109946874
92	NC_008229	TAATTC	2	12	216386	216397	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	109946879
93	NC_008229	CTTGCC	2	12	216686	216697	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	109946879
94	NC_008229	CTTGCC	2	12	216751	216762	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	109946879
95	NC_008229	CTAATT	2	12	220816	220827	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	109946883
96	NC_008229	AAGCCT	2	12	222819	222830	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	109946887
97	NC_008229	CAAACC	2	12	222836	222847	50 %	0 %	0 %	50 %	109946887
98	NC_008229	TAGGGG	2	12	223494	223505	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008229	ATGCAA	2	12	223728	223739	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	109946888
100	NC_008229	AGCGTG	2	12	224293	224304	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	109946888
101	NC_008229	GACTTT	2	12	225750	225761	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	109946890
102	NC_008229	AAAATC	2	12	227655	227666	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	109946892
103	NC_008229	TAAAAC	2	12	230176	230187	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	109946894
104	NC_008229	AAAAGA	2	12	233878	233889	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008229	CGGCGA	2	12	237706	237717	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	109946900
106	NC_008229	AAATCA	2	12	238796	238807	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	109946901
107	NC_008229	AGAAAA	2	12	240606	240617	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	109946901
108	NC_008229	AAAACA	2	12	240749	240760	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	109946901
109	NC_008229	CTATGT	2	12	242557	242568	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	109946902
110	NC_008229	AGATGA	2	12	243332	243343	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	109946904
111	NC_008229	AAGAAA	2	12	245568	245579	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	109946905
112	NC_008229	TTTTCT	2	12	246308	246319	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	109946907
113	NC_008229	AGTGGA	2	12	252666	252677	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	109946913
114	NC_008229	TGAGCG	2	12	254909	254920	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	109946913
115	NC_008229	ACGATA	2	12	255200	255211	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	109946913
116	NC_008229	TCTTTT	2	12	256707	256718	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	109946915
117	NC_008229	AGGCTA	2	12	262268	262279	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	109946921
118	NC_008229	TTTCAT	2	12	265790	265801	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	109946925
119	NC_008229	TAAATC	2	12	270560	270571	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	109946930
120	NC_008229	TAGCGA	2	12	271613	271624	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	109946931
121	NC_008229	TATCGC	2	12	274712	274723	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	109946933
122	NC_008229	CCTAAA	2	12	277158	277169	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	109946936
123	NC_008229	TTGTTT	2	12	281336	281347	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008229	CTTGGG	2	12	282001	282012	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	109946943
125	NC_008229	TTTATT	2	12	282602	282613	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008229	TTGGGT	2	12	287045	287056	0 %	50 %	50 %	0 %	109946948
127	NC_008229	GATTTT	2	12	287553	287564	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	109946949
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140	NC_008229	TAAAGA	2	12	306199	306210	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	109946969
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166	NC_008229	CATAAA	2	12	364049	364060	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	109947023
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187	NC_008229	TGAGCG	2	12	423267	423278	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	109947074
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220	NC_008229	GAAGTG	2	12	490221	490232	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	109947147
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228	NC_008229	TCTTTT	2	12	500185	500196	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
229	NC_008229	AAAATC	2	12	503078	503089	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	109947158
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234	NC_008229	GCAATC	2	12	521266	521277	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	109947178
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