MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter acinonychis str. Sheeba chromosome

Total Repeats: 1329

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008229	CAAAA	2	10	1555	1564	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_008229	CAAGC	2	10	3084	3093	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_008229	TTATC	2	10	4936	4945	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_008229	CCCTA	2	10	6236	6245	20 %	20 %	0 %	60 %	109946646
5	NC_008229	GGGGA	2	10	7561	7570	20 %	0 %	80 %	0 %	109946647
6	NC_008229	TAATT	2	10	8079	8088	40 %	60 %	0 %	0 %	109946647
7	NC_008229	ACAAA	2	10	11767	11776	80 %	0 %	0 %	20 %	109946649
8	NC_008229	ACAAA	2	10	12323	12332	80 %	0 %	0 %	20 %	109946650
9	NC_008229	ATTTT	2	10	12898	12907	20 %	80 %	0 %	0 %	109946650
10	NC_008229	ATCAA	2	10	13133	13142	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_008229	AAAAG	2	10	14598	14607	80 %	0 %	20 %	0 %	109946651
12	NC_008229	CGATC	2	10	15298	15307	20 %	20 %	20 %	40 %	109946651
13	NC_008229	ATTTT	2	10	18934	18943	20 %	80 %	0 %	0 %	162139481
14	NC_008229	AATCC	2	10	20655	20664	40 %	20 %	0 %	40 %	109946655
15	NC_008229	CAAAT	2	10	21941	21950	60 %	20 %	0 %	20 %	109946657
16	NC_008229	ACTTT	2	10	23286	23295	20 %	60 %	0 %	20 %	109946658
17	NC_008229	AAATA	2	10	23420	23429	80 %	20 %	0 %	0 %	109946658
18	NC_008229	AGCGA	2	10	25502	25511	40 %	0 %	40 %	20 %	109946660
19	NC_008229	TTGTT	2	10	25658	25667	0 %	80 %	20 %	0 %	109946660
20	NC_008229	AAAGA	2	10	26699	26708	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008229	CCAAC	2	10	28368	28377	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
22	NC_008229	AGTAA	2	10	28717	28726	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008229	AGTGA	2	10	29014	29023	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008229	AGATG	2	10	30489	30498	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008229	TTGAA	2	10	30721	30730	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008229	TAAAA	2	10	31862	31871	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008229	GTTTA	2	10	32359	32368	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008229	GGTTT	2	10	32377	32386	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008229	GGTTT	2	10	32444	32453	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008229	TTGGT	2	10	32463	32472	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008229	TTAAA	2	10	32608	32617	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008229	GTGAA	2	10	33264	33273	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008229	TCAAA	2	10	37377	37386	60 %	20 %	0 %	20 %	109946669
34	NC_008229	TGATC	2	10	37929	37938	20 %	40 %	20 %	20 %	109946671
35	NC_008229	CAATT	2	10	38876	38885	40 %	40 %	0 %	20 %	109946673
36	NC_008229	CAAGC	2	10	41500	41509	40 %	0 %	20 %	40 %	109946675
37	NC_008229	TGGGT	2	10	41937	41946	0 %	40 %	60 %	0 %	109946675
38	NC_008229	TGATT	2	10	41956	41965	20 %	60 %	20 %	0 %	109946675
39	NC_008229	AGATA	2	10	44072	44081	60 %	20 %	20 %	0 %	109946679
40	NC_008229	GTGGG	2	10	45529	45538	0 %	20 %	80 %	0 %	109946680
41	NC_008229	CAAAA	2	10	46166	46175	80 %	0 %	0 %	20 %	109946680
42	NC_008229	ATGAA	2	10	46574	46583	60 %	20 %	20 %	0 %	109946681
43	NC_008229	TGGGG	2	10	46780	46789	0 %	20 %	80 %	0 %	109946682
44	NC_008229	ATTTT	2	10	48312	48321	20 %	80 %	0 %	0 %	109946684
45	NC_008229	TGCAT	2	10	49118	49127	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_008229	ATTAT	2	10	50768	50777	40 %	60 %	0 %	0 %	109946686
47	NC_008229	TGAGT	2	10	52172	52181	20 %	40 %	40 %	0 %	109946688
48	NC_008229	CAAAC	2	10	53198	53207	60 %	0 %	0 %	40 %	109946688
49	NC_008229	ATGCT	2	10	55585	55594	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_008229	TTAAT	2	10	55792	55801	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008229	ATTTT	2	10	57444	57453	20 %	80 %	0 %	0 %	109946692
52	NC_008229	GATTT	2	10	58704	58713	20 %	60 %	20 %	0 %	109946692
53	NC_008229	AAAAT	2	10	60655	60664	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008229	ACCGC	2	10	60871	60880	20 %	0 %	20 %	60 %	109946695
55	NC_008229	TTTTA	2	10	62028	62037	20 %	80 %	0 %	0 %	109946696
56	NC_008229	GGCGT	2	10	62050	62059	0 %	20 %	60 %	20 %	109946696
57	NC_008229	TGATG	2	10	62224	62233	20 %	40 %	40 %	0 %	109946697
58	NC_008229	GATTT	2	10	63191	63200	20 %	60 %	20 %	0 %	109946697
59	NC_008229	AGGGC	2	10	63551	63560	20 %	0 %	60 %	20 %	109946698
60	NC_008229	ATTGA	2	10	64215	64224	40 %	40 %	20 %	0 %	109946698
61	NC_008229	CACCC	2	10	67340	67349	20 %	0 %	0 %	80 %	109946702
62	NC_008229	ATTCA	2	10	67574	67583	40 %	40 %	0 %	20 %	109946702
63	NC_008229	AAAGT	2	10	68829	68838	60 %	20 %	20 %	0 %	109946703
64	NC_008229	AATAG	2	10	70117	70126	60 %	20 %	20 %	0 %	109946704
65	NC_008229	ATCCA	2	10	70978	70987	40 %	20 %	0 %	40 %	109946704
66	NC_008229	TTACC	2	10	72342	72351	20 %	40 %	0 %	40 %	109946704
67	NC_008229	AATAC	2	10	72407	72416	60 %	20 %	0 %	20 %	109946704
68	NC_008229	CTATT	2	10	72504	72513	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_008229	CCATA	2	10	73796	73805	40 %	20 %	0 %	40 %	109946707
70	NC_008229	TCAAA	2	10	75177	75186	60 %	20 %	0 %	20 %	109946708
71	NC_008229	AAATT	2	10	76686	76695	60 %	40 %	0 %	0 %	109946710
72	NC_008229	TATTT	2	10	79356	79365	20 %	80 %	0 %	0 %	109946712
73	NC_008229	TAAAA	2	10	82858	82867	80 %	20 %	0 %	0 %	109946714
74	NC_008229	CTAAA	2	10	83567	83576	60 %	20 %	0 %	20 %	109946715
75	NC_008229	TCCCA	2	10	83870	83879	20 %	20 %	0 %	60 %	109946715
76	NC_008229	GCTCC	2	10	84191	84200	0 %	20 %	20 %	60 %	109946715
77	NC_008229	AAAAT	2	10	84370	84379	80 %	20 %	0 %	0 %	109946715
78	NC_008229	TCGCA	2	10	84728	84737	20 %	20 %	20 %	40 %	109946715
79	NC_008229	CAAAG	2	10	84741	84750	60 %	0 %	20 %	20 %	109946715
80	NC_008229	AGGCT	2	10	86620	86629	20 %	20 %	40 %	20 %	109946717
81	NC_008229	ATTGG	2	10	87564	87573	20 %	40 %	40 %	0 %	109946721
82	NC_008229	ATCTT	2	10	89741	89750	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_008229	TTGAA	2	10	89871	89880	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008229	ATAAA	2	10	90687	90696	80 %	20 %	0 %	0 %	109946725
85	NC_008229	TAAAA	2	10	92445	92454	80 %	20 %	0 %	0 %	109946726
86	NC_008229	AATAT	2	10	94341	94350	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008229	TATAT	2	10	94365	94374	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008229	TCATT	2	10	95863	95872	20 %	60 %	0 %	20 %	109946731
89	NC_008229	TTTTA	2	10	96010	96019	20 %	80 %	0 %	0 %	109946732
90	NC_008229	TGATT	2	10	97919	97928	20 %	60 %	20 %	0 %	109946733
91	NC_008229	CTGTT	2	10	99040	99049	0 %	60 %	20 %	20 %	109946734
92	NC_008229	TGTTT	2	10	101032	101041	0 %	80 %	20 %	0 %	109946735
93	NC_008229	TTTTG	2	10	101050	101059	0 %	80 %	20 %	0 %	109946735
94	NC_008229	AAAAC	2	10	101980	101989	80 %	0 %	0 %	20 %	109946736
95	NC_008229	AAAAT	2	10	108457	108466	80 %	20 %	0 %	0 %	109946742
96	NC_008229	TCAAA	2	10	108766	108775	60 %	20 %	0 %	20 %	109946743
97	NC_008229	TGAAT	2	10	109087	109096	40 %	40 %	20 %	0 %	109946743
98	NC_008229	AGAAA	2	10	116128	116137	80 %	0 %	20 %	0 %	109946747
99	NC_008229	AATGA	2	10	116390	116399	60 %	20 %	20 %	0 %	109946747
100	NC_008229	TTCCA	2	10	119626	119635	20 %	40 %	0 %	40 %	109946753
101	NC_008229	ACGCA	2	10	119836	119845	40 %	0 %	20 %	40 %	109946754
102	NC_008229	ACGCC	2	10	120332	120341	20 %	0 %	20 %	60 %	109946754
103	NC_008229	TGAAT	2	10	120828	120837	40 %	40 %	20 %	0 %	109946754
104	NC_008229	TTATA	2	10	121487	121496	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008229	GTTTG	2	10	122197	122206	0 %	60 %	40 %	0 %	109946755
106	NC_008229	TCTAA	2	10	122219	122228	40 %	40 %	0 %	20 %	109946755
107	NC_008229	GCAAA	2	10	123594	123603	60 %	0 %	20 %	20 %	109946757
108	NC_008229	GCATA	2	10	123974	123983	40 %	20 %	20 %	20 %	109946757
109	NC_008229	TTTTC	2	10	124098	124107	0 %	80 %	0 %	20 %	109946757
110	NC_008229	ATAAG	2	10	124374	124383	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008229	TTTTA	2	10	124497	124506	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008229	GTTAA	2	10	129176	129185	40 %	40 %	20 %	0 %	109946767
113	NC_008229	CAAGG	2	10	129336	129345	40 %	0 %	40 %	20 %	109946768
114	NC_008229	GTTTG	2	10	130169	130178	0 %	60 %	40 %	0 %	109946771
115	NC_008229	GAAAG	2	10	132232	132241	60 %	0 %	40 %	0 %	109946775
116	NC_008229	TCTAT	2	10	132922	132931	20 %	60 %	0 %	20 %	109946776
117	NC_008229	TTTTA	2	10	140212	140221	20 %	80 %	0 %	0 %	109946786
118	NC_008229	TATTC	2	10	142287	142296	20 %	60 %	0 %	20 %	109946789
119	NC_008229	ATCAA	2	10	142456	142465	60 %	20 %	0 %	20 %	109946789
120	NC_008229	TAAAA	2	10	145201	145210	80 %	20 %	0 %	0 %	109946792
121	NC_008229	TTGCT	2	10	146470	146479	0 %	60 %	20 %	20 %	109946792
122	NC_008229	TTGCT	2	10	147663	147672	0 %	60 %	20 %	20 %	109946795
123	NC_008229	TCTAT	2	10	150678	150687	20 %	60 %	0 %	20 %	109946801
124	NC_008229	ATTTC	2	10	151364	151373	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_008229	TCGTG	2	10	152838	152847	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_008229	TTTAG	2	10	153936	153945	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008229	AAATC	2	10	154860	154869	60 %	20 %	0 %	20 %	109946805
128	NC_008229	TAAAA	2	10	154971	154980	80 %	20 %	0 %	0 %	109946806
129	NC_008229	TCATT	2	10	155339	155348	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_008229	ATTTT	2	10	156612	156621	20 %	80 %	0 %	0 %	109946810
131	NC_008229	CAAAG	2	10	156705	156714	60 %	0 %	20 %	20 %	109946810
132	NC_008229	GATTT	2	10	156900	156909	20 %	60 %	20 %	0 %	109946810
133	NC_008229	AAAAT	2	10	157203	157212	80 %	20 %	0 %	0 %	109946811
134	NC_008229	AGTGA	2	10	159575	159584	40 %	20 %	40 %	0 %	109946813
135	NC_008229	TGAAA	2	10	160824	160833	60 %	20 %	20 %	0 %	109946814
136	NC_008229	TTTTC	2	10	164032	164041	0 %	80 %	0 %	20 %	109946816
137	NC_008229	TTTGG	2	10	164110	164119	0 %	60 %	40 %	0 %	109946816
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139	NC_008229	ATTGA	2	10	172143	172152	40 %	40 %	20 %	0 %	109946824
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499	NC_008229	AATGG	2	10	589515	589524	40 %	20 %	40 %	0 %	109947247
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