MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Helicobacter acinonychis str. Sheeba chromosome

Total Repeats: 4501

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008229	GCAT	2	8	221	228	25 %	25 %	25 %	25 %	109946641
2	NC_008229	CAGA	2	8	725	732	50 %	0 %	25 %	25 %	109946641
3	NC_008229	TCGC	2	8	1192	1199	0 %	25 %	25 %	50 %	109946641
4	NC_008229	TGAA	2	8	1319	1326	50 %	25 %	25 %	0 %	109946641
5	NC_008229	TGAA	2	8	1358	1365	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008229	TTTA	2	8	1498	1505	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008229	CCAA	2	8	1906	1913	50 %	0 %	0 %	50 %	109946642
8	NC_008229	AAAC	2	8	1949	1956	75 %	0 %	0 %	25 %	109946642
9	NC_008229	TGCG	2	8	2288	2295	0 %	25 %	50 %	25 %	109946642
10	NC_008229	ACAA	2	8	2365	2372	75 %	0 %	0 %	25 %	109946642
11	NC_008229	AAAG	2	8	2838	2845	75 %	0 %	25 %	0 %	109946642
12	NC_008229	TATT	2	8	2991	2998	25 %	75 %	0 %	0 %	109946642
13	NC_008229	TTTA	2	8	3457	3464	25 %	75 %	0 %	0 %	109946643
14	NC_008229	AAAT	2	8	5028	5035	75 %	25 %	0 %	0 %	109946646
15	NC_008229	CTTG	2	8	5077	5084	0 %	50 %	25 %	25 %	109946646
16	NC_008229	AGCG	2	8	5672	5679	25 %	0 %	50 %	25 %	109946646
17	NC_008229	ATTT	2	8	5979	5986	25 %	75 %	0 %	0 %	109946646
18	NC_008229	TGAG	2	8	6387	6394	25 %	25 %	50 %	0 %	109946646
19	NC_008229	ACGA	2	8	6669	6676	50 %	0 %	25 %	25 %	109946646
20	NC_008229	AGCA	2	8	7198	7205	50 %	0 %	25 %	25 %	109946647
21	NC_008229	TTTA	2	8	7318	7325	25 %	75 %	0 %	0 %	109946647
22	NC_008229	TATC	2	8	8049	8056	25 %	50 %	0 %	25 %	109946647
23	NC_008229	GATT	2	8	8186	8193	25 %	50 %	25 %	0 %	109946647
24	NC_008229	AAAG	2	8	8340	8347	75 %	0 %	25 %	0 %	109946648
25	NC_008229	ATTC	2	8	8351	8358	25 %	50 %	0 %	25 %	109946648
26	NC_008229	TTAT	2	8	8563	8570	25 %	75 %	0 %	0 %	109946648
27	NC_008229	CTTG	2	8	8698	8705	0 %	50 %	25 %	25 %	109946648
28	NC_008229	TGAA	2	8	8869	8876	50 %	25 %	25 %	0 %	109946648
29	NC_008229	TTTG	2	8	10676	10683	0 %	75 %	25 %	0 %	109946649
30	NC_008229	ACTC	2	8	10736	10743	25 %	25 %	0 %	50 %	109946649
31	NC_008229	TCAA	2	8	10744	10751	50 %	25 %	0 %	25 %	109946649
32	NC_008229	ATCA	2	8	10902	10909	50 %	25 %	0 %	25 %	109946649
33	NC_008229	AGCG	2	8	10983	10990	25 %	0 %	50 %	25 %	109946649
34	NC_008229	TTGA	2	8	10992	10999	25 %	50 %	25 %	0 %	109946649
35	NC_008229	AATC	2	8	11586	11593	50 %	25 %	0 %	25 %	109946649
36	NC_008229	GTTT	2	8	13097	13104	0 %	75 %	25 %	0 %	109946650
37	NC_008229	CAAG	2	8	13278	13285	50 %	0 %	25 %	25 %	109946651
38	NC_008229	TCAA	2	8	13442	13449	50 %	25 %	0 %	25 %	109946651
39	NC_008229	ACCC	2	8	14814	14821	25 %	0 %	0 %	75 %	109946651
40	NC_008229	ACCC	2	8	14848	14855	25 %	0 %	0 %	75 %	109946651
41	NC_008229	TTTA	2	8	15404	15411	25 %	75 %	0 %	0 %	109946651
42	NC_008229	ACAA	2	8	15675	15682	75 %	0 %	0 %	25 %	109946651
43	NC_008229	AATA	2	8	15804	15811	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008229	CAAG	2	8	16055	16062	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_008229	CTTT	2	8	17565	17572	0 %	75 %	0 %	25 %	109946653
46	NC_008229	ATAA	2	8	19050	19057	75 %	25 %	0 %	0 %	162139481
47	NC_008229	TTTC	2	8	19157	19164	0 %	75 %	0 %	25 %	162139481
48	NC_008229	CTTG	2	8	19379	19386	0 %	50 %	25 %	25 %	162139481
49	NC_008229	CCCT	2	8	20918	20925	0 %	25 %	0 %	75 %	109946656
50	NC_008229	CAAA	2	8	21204	21211	75 %	0 %	0 %	25 %	109946656
51	NC_008229	AGAA	2	8	21422	21429	75 %	0 %	25 %	0 %	109946656
52	NC_008229	CTCC	2	8	21648	21655	0 %	25 %	0 %	75 %	109946657
53	NC_008229	CTTT	2	8	21921	21928	0 %	75 %	0 %	25 %	109946657
54	NC_008229	GTTA	2	8	22133	22140	25 %	50 %	25 %	0 %	109946657
55	NC_008229	GTTT	2	8	22586	22593	0 %	75 %	25 %	0 %	109946657
56	NC_008229	GCTT	2	8	22959	22966	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_008229	AATA	2	8	22994	23001	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008229	TAAA	2	8	24122	24129	75 %	25 %	0 %	0 %	109946659
59	NC_008229	CGCT	2	8	24310	24317	0 %	25 %	25 %	50 %	109946659
60	NC_008229	TCAA	2	8	24462	24469	50 %	25 %	0 %	25 %	109946659
61	NC_008229	AGAA	2	8	24646	24653	75 %	0 %	25 %	0 %	109946659
62	NC_008229	TTTG	2	8	24882	24889	0 %	75 %	25 %	0 %	109946660
63	NC_008229	TTGA	2	8	25069	25076	25 %	50 %	25 %	0 %	109946660
64	NC_008229	ATGG	2	8	25099	25106	25 %	25 %	50 %	0 %	109946660
65	NC_008229	AAAG	2	8	25361	25368	75 %	0 %	25 %	0 %	109946660
66	NC_008229	CTAT	2	8	25601	25608	25 %	50 %	0 %	25 %	109946660
67	NC_008229	TTGA	2	8	25738	25745	25 %	50 %	25 %	0 %	109946660
68	NC_008229	TAAA	2	8	26065	26072	75 %	25 %	0 %	0 %	109946661
69	NC_008229	TGAA	2	8	26347	26354	50 %	25 %	25 %	0 %	109946661
70	NC_008229	TAAG	2	8	26805	26812	50 %	25 %	25 %	0 %	109946662
71	NC_008229	TATT	2	8	27430	27437	25 %	75 %	0 %	0 %	109946663
72	NC_008229	GGGA	2	8	27552	27559	25 %	0 %	75 %	0 %	109946663
73	NC_008229	AGAA	2	8	27868	27875	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008229	GCAA	2	8	28105	28112	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_008229	GGAT	2	8	28270	28277	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008229	GCGA	2	8	29075	29082	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_008229	CAAA	2	8	29650	29657	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_008229	GGTG	2	8	29811	29818	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008229	AATC	2	8	29823	29830	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_008229	AAAG	2	8	29947	29954	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008229	AGCT	2	8	30304	30311	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_008229	TCCC	2	8	30602	30609	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
83	NC_008229	CAGG	2	8	31057	31064	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_008229	AGCC	2	8	31176	31183	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_008229	GATG	2	8	31510	31517	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008229	ATTT	2	8	32576	32583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008229	ATCA	2	8	32648	32655	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_008229	TTGT	2	8	32681	32688	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008229	CCAT	2	8	32750	32757	25 %	25 %	0 %	50 %	109946664
90	NC_008229	ATTG	2	8	33031	33038	25 %	50 %	25 %	0 %	109946664
91	NC_008229	TAAA	2	8	33804	33811	75 %	25 %	0 %	0 %	109946665
92	NC_008229	AACA	2	8	34240	34247	75 %	0 %	0 %	25 %	109946665
93	NC_008229	GAAA	3	12	34611	34622	75 %	0 %	25 %	0 %	109946665
94	NC_008229	AGGG	2	8	34845	34852	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008229	TCAT	2	8	35801	35808	25 %	50 %	0 %	25 %	109946667
96	NC_008229	CAAT	2	8	35829	35836	50 %	25 %	0 %	25 %	109946667
97	NC_008229	TACT	2	8	35837	35844	25 %	50 %	0 %	25 %	109946667
98	NC_008229	TTCA	2	8	35898	35905	25 %	50 %	0 %	25 %	109946667
99	NC_008229	GTTT	2	8	36290	36297	0 %	75 %	25 %	0 %	109946667
100	NC_008229	TAAA	2	8	36622	36629	75 %	25 %	0 %	0 %	109946667
101	NC_008229	ATCA	2	8	36850	36857	50 %	25 %	0 %	25 %	109946668
102	NC_008229	AGTC	2	8	36858	36865	25 %	25 %	25 %	25 %	109946668
103	NC_008229	ATCA	2	8	37059	37066	50 %	25 %	0 %	25 %	109946668
104	NC_008229	TTGG	2	8	37305	37312	0 %	50 %	50 %	0 %	109946669
105	NC_008229	TTGG	2	8	37436	37443	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008229	ATAA	2	8	40048	40055	75 %	25 %	0 %	0 %	109946674
107	NC_008229	GAAT	2	8	40629	40636	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008229	GCTC	2	8	41578	41585	0 %	25 %	25 %	50 %	109946675
109	NC_008229	GATG	2	8	42025	42032	25 %	25 %	50 %	0 %	109946675
110	NC_008229	ATGA	2	8	42262	42269	50 %	25 %	25 %	0 %	109946676
111	NC_008229	GCGT	2	8	42608	42615	0 %	25 %	50 %	25 %	109946676
112	NC_008229	TTTA	2	8	43515	43522	25 %	75 %	0 %	0 %	109946678
113	NC_008229	GAGT	2	8	43715	43722	25 %	25 %	50 %	0 %	109946678
114	NC_008229	GTTT	2	8	43738	43745	0 %	75 %	25 %	0 %	109946678
115	NC_008229	CAGA	2	8	44317	44324	50 %	0 %	25 %	25 %	109946680
116	NC_008229	CCAA	2	8	44518	44525	50 %	0 %	0 %	50 %	109946680
117	NC_008229	CGCT	2	8	45325	45332	0 %	25 %	25 %	50 %	109946680
118	NC_008229	TTGT	2	8	45713	45720	0 %	75 %	25 %	0 %	109946680
119	NC_008229	GCTT	2	8	46224	46231	0 %	50 %	25 %	25 %	109946680
120	NC_008229	CAAT	2	8	46241	46248	50 %	25 %	0 %	25 %	109946680
121	NC_008229	GAAA	2	8	46283	46290	75 %	0 %	25 %	0 %	109946680
122	NC_008229	ATGA	2	8	46564	46571	50 %	25 %	25 %	0 %	109946681
123	NC_008229	TCAA	2	8	47846	47853	50 %	25 %	0 %	25 %	109946683
124	NC_008229	TGCA	2	8	48042	48049	25 %	25 %	25 %	25 %	109946684
125	NC_008229	TTGT	2	8	48155	48162	0 %	75 %	25 %	0 %	109946684
126	NC_008229	TTGG	2	8	48584	48591	0 %	50 %	50 %	0 %	109946684
127	NC_008229	TAAA	2	8	49010	49017	75 %	25 %	0 %	0 %	109946684
128	NC_008229	TAAA	2	8	49020	49027	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008229	CAAG	2	8	49084	49091	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_008229	GAAA	2	8	49174	49181	75 %	0 %	25 %	0 %	109946685
131	NC_008229	GCTC	2	8	49502	49509	0 %	25 %	25 %	50 %	109946685
132	NC_008229	TGAA	2	8	49752	49759	50 %	25 %	25 %	0 %	109946685
133	NC_008229	TATT	2	8	49928	49935	25 %	75 %	0 %	0 %	109946686
134	NC_008229	GTTT	2	8	49941	49948	0 %	75 %	25 %	0 %	109946686
135	NC_008229	TGAT	2	8	50285	50292	25 %	50 %	25 %	0 %	109946686
136	NC_008229	TTGT	2	8	50592	50599	0 %	75 %	25 %	0 %	109946686
137	NC_008229	ACAA	2	8	50654	50661	75 %	0 %	0 %	25 %	109946686
138	NC_008229	CAAC	2	8	50959	50966	50 %	0 %	0 %	50 %	109946687
139	NC_008229	CAAC	2	8	51032	51039	50 %	0 %	0 %	50 %	109946687
140	NC_008229	CAAA	2	8	51179	51186	75 %	0 %	0 %	25 %	109946687
141	NC_008229	ATTG	2	8	51664	51671	25 %	50 %	25 %	0 %	109946687
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143	NC_008229	TCAA	2	8	51852	51859	50 %	25 %	0 %	25 %	109946687
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