MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Helicobacter acinonychis str. Sheeba chromosome

Total Repeats: 15462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008229	CAA	2	6	49	54	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109946641
2	NC_008229	GCA	2	6	158	163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109946641
3	NC_008229	GGC	2	6	442	447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	109946641
4	NC_008229	AAC	2	6	565	570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109946641
5	NC_008229	AGG	2	6	662	667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	109946641
6	NC_008229	AGA	2	6	756	761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946641
7	NC_008229	GAA	2	6	877	882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946641
8	NC_008229	AGA	2	6	1011	1016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946641
9	NC_008229	GAA	2	6	1267	1272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946641
10	NC_008229	AGA	2	6	1299	1304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946641
11	NC_008229	TTA	2	6	1444	1449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008229	CTA	2	6	1476	1481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008229	AGA	2	6	1643	1648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946642
14	NC_008229	CAC	2	6	1738	1743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109946642
15	NC_008229	CTT	2	6	1813	1818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109946642
16	NC_008229	TAT	2	6	1847	1852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109946642
17	NC_008229	TTC	2	6	1877	1882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109946642
18	NC_008229	CTT	2	6	1918	1923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109946642
19	NC_008229	CAA	2	6	1968	1973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109946642
20	NC_008229	AGG	2	6	2120	2125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	109946642
21	NC_008229	AAC	2	6	2208	2213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109946642
22	NC_008229	AAT	2	6	2217	2222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109946642
23	NC_008229	AAT	3	9	2229	2237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109946642
24	NC_008229	ATG	3	9	2308	2316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109946642
25	NC_008229	ACC	2	6	2373	2378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109946642
26	NC_008229	ATC	2	6	2430	2435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109946642
27	NC_008229	AGA	2	6	2477	2482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946642
28	NC_008229	TTC	2	6	2518	2523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109946642
29	NC_008229	CAC	2	6	2534	2539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109946642
30	NC_008229	AGA	2	6	2600	2605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946642
31	NC_008229	GAT	2	6	2685	2690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109946642
32	NC_008229	TTC	2	6	2732	2737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109946642
33	NC_008229	ATT	2	6	2818	2823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109946642
34	NC_008229	AAG	2	6	2887	2892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946642
35	NC_008229	AGA	2	6	2915	2920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946642
36	NC_008229	GTT	2	6	2967	2972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109946642
37	NC_008229	TGG	2	6	3014	3019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008229	ACC	2	6	3036	3041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_008229	TCT	2	6	3059	3064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008229	CAA	2	6	3276	3281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109946643
41	NC_008229	GGT	2	6	3353	3358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109946643
42	NC_008229	AAG	2	6	3421	3426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946643
43	NC_008229	CAT	2	6	3431	3436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109946643
44	NC_008229	CAA	2	6	3489	3494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109946643
45	NC_008229	AGA	2	6	3540	3545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946643
46	NC_008229	TGG	2	6	3756	3761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109946643
47	NC_008229	CAA	2	6	3771	3776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109946643
48	NC_008229	ATT	2	6	3808	3813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109946643
49	NC_008229	CCA	2	6	4048	4053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109946644
50	NC_008229	ATC	2	6	4109	4114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109946644
51	NC_008229	GAT	2	6	4115	4120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109946644
52	NC_008229	TAA	2	6	4311	4316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109946644
53	NC_008229	ATC	2	6	4413	4418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109946644
54	NC_008229	TAA	2	6	4551	4556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109946645
55	NC_008229	GGT	2	6	4588	4593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109946645
56	NC_008229	TTC	2	6	4643	4648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109946645
57	NC_008229	TCA	2	6	4674	4679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109946645
58	NC_008229	ATC	2	6	4685	4690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109946645
59	NC_008229	CTT	2	6	4693	4698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109946645
60	NC_008229	CAT	2	6	4711	4716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109946645
61	NC_008229	CTT	2	6	4717	4722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109946645
62	NC_008229	TAA	2	6	4975	4980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008229	TTA	2	6	5039	5044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109946646
64	NC_008229	GCG	2	6	5145	5150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	109946646
65	NC_008229	TAT	2	6	5344	5349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109946646
66	NC_008229	GGC	2	6	5378	5383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	109946646
67	NC_008229	TTA	2	6	5501	5506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109946646
68	NC_008229	AAT	2	6	5666	5671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109946646
69	NC_008229	CTT	2	6	5697	5702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109946646
70	NC_008229	CAA	2	6	5726	5731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109946646
71	NC_008229	TAA	2	6	5854	5859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109946646
72	NC_008229	ATT	2	6	5947	5952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109946646
73	NC_008229	TGT	2	6	6001	6006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109946646
74	NC_008229	GTT	2	6	6022	6027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109946646
75	NC_008229	TGA	2	6	6070	6075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109946646
76	NC_008229	GCA	2	6	6076	6081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109946646
77	NC_008229	GAA	2	6	6308	6313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946646
78	NC_008229	AGA	2	6	6460	6465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946646
79	NC_008229	GAA	2	6	6473	6478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946646
80	NC_008229	TGG	2	6	6555	6560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109946646
81	NC_008229	AAG	2	6	6660	6665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946646
82	NC_008229	GAA	3	9	6958	6966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946647
83	NC_008229	TGG	2	6	7032	7037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109946647
84	NC_008229	TTA	2	6	7072	7077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109946647
85	NC_008229	AGA	2	6	7098	7103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946647
86	NC_008229	TCA	2	6	7211	7216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109946647
87	NC_008229	ACA	2	6	7298	7303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109946647
88	NC_008229	GAT	2	6	7330	7335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109946647
89	NC_008229	ATT	2	6	7373	7378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109946647
90	NC_008229	CAA	2	6	7401	7406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109946647
91	NC_008229	TGA	2	6	7512	7517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109946647
92	NC_008229	GCC	2	6	7525	7530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	109946647
93	NC_008229	ACA	2	6	7621	7626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109946647
94	NC_008229	AGA	2	6	7713	7718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946647
95	NC_008229	GAA	2	6	7723	7728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946647
96	NC_008229	AGT	2	6	7810	7815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109946647
97	NC_008229	ATC	2	6	7877	7882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109946647
98	NC_008229	ATA	2	6	8030	8035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109946647
99	NC_008229	CAT	2	6	8217	8222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109946647
100	NC_008229	TAA	2	6	8274	8279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109946647
101	NC_008229	GAA	2	6	8463	8468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946648
102	NC_008229	TGA	3	9	8546	8554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109946648
103	NC_008229	GAT	2	6	8915	8920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109946648
104	NC_008229	TTA	2	6	9069	9074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109946649
105	NC_008229	TGA	2	6	9400	9405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109946649
106	NC_008229	TAA	2	6	9419	9424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109946649
107	NC_008229	AGT	2	6	9518	9523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109946649
108	NC_008229	ATT	2	6	9568	9573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109946649
109	NC_008229	GAT	2	6	9624	9629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109946649
110	NC_008229	TAA	2	6	9632	9637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109946649
111	NC_008229	TGA	2	6	9671	9676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109946649
112	NC_008229	GAT	2	6	9776	9781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109946649
113	NC_008229	TTG	2	6	9933	9938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109946649
114	NC_008229	ATG	2	6	9984	9989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109946649
115	NC_008229	AGA	3	9	10022	10030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946649
116	NC_008229	TTA	2	6	10069	10074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109946649
117	NC_008229	CAA	2	6	10146	10151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109946649
118	NC_008229	GAA	2	6	10158	10163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946649
119	NC_008229	TGA	2	6	10393	10398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109946649
120	NC_008229	CAA	2	6	10443	10448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109946649
121	NC_008229	TGG	2	6	10534	10539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109946649
122	NC_008229	GAA	2	6	10638	10643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946649
123	NC_008229	GAT	2	6	10719	10724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109946649
124	NC_008229	AGA	2	6	10781	10786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946649
125	NC_008229	TTC	2	6	11021	11026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109946649
126	NC_008229	TAA	2	6	11165	11170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109946649
127	NC_008229	ATT	2	6	11292	11297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109946649
128	NC_008229	ATG	2	6	11374	11379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109946649
129	NC_008229	GAA	2	6	11502	11507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946649
130	NC_008229	GAA	2	6	11517	11522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109946649
131	NC_008229	GTT	2	6	11642	11647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109946649
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