MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Pseudoalteromonas atlantica T6c chromosome

Total Repeats: 2700

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008228	AGGCA	2	10	599	608	40 %	0 %	40 %	20 %	109896333
2	NC_008228	TCGGT	2	10	968	977	0 %	40 %	40 %	20 %	109896333
3	NC_008228	AGAGA	2	10	1458	1467	60 %	0 %	40 %	0 %	109896333
4	NC_008228	GCTTT	2	10	8591	8600	0 %	60 %	20 %	20 %	109896338
5	NC_008228	AGGCG	2	10	9337	9346	20 %	0 %	60 %	20 %	109896340
6	NC_008228	AGCGA	2	10	10034	10043	40 %	0 %	40 %	20 %	109896340
7	NC_008228	GCCTG	2	10	11088	11097	0 %	20 %	40 %	40 %	109896340
8	NC_008228	TGGCG	2	10	11473	11482	0 %	20 %	60 %	20 %	109896341
9	NC_008228	GTTGG	2	10	12882	12891	0 %	40 %	60 %	0 %	109896342
10	NC_008228	GCCAT	2	10	14790	14799	20 %	20 %	20 %	40 %	109896345
11	NC_008228	TTTAA	2	10	15285	15294	40 %	60 %	0 %	0 %	109896346
12	NC_008228	TCTGT	2	10	16759	16768	0 %	60 %	20 %	20 %	109896347
13	NC_008228	ACTGC	2	10	17817	17826	20 %	20 %	20 %	40 %	109896347
14	NC_008228	TCGCA	2	10	20352	20361	20 %	20 %	20 %	40 %	109896348
15	NC_008228	AGTTT	2	10	22141	22150	20 %	60 %	20 %	0 %	109896349
16	NC_008228	GTAAC	2	10	22366	22375	40 %	20 %	20 %	20 %	109896350
17	NC_008228	AGCTG	2	10	26579	26588	20 %	20 %	40 %	20 %	109896354
18	NC_008228	TTTGG	2	10	32721	32730	0 %	60 %	40 %	0 %	109896361
19	NC_008228	ATGAC	2	10	34565	34574	40 %	20 %	20 %	20 %	109896363
20	NC_008228	AGCTT	2	10	45473	45482	20 %	40 %	20 %	20 %	109896366
21	NC_008228	GGTGT	2	10	50178	50187	0 %	40 %	60 %	0 %	109896371
22	NC_008228	GGGCA	2	10	50348	50357	20 %	0 %	60 %	20 %	109896371
23	NC_008228	AGCGT	2	10	53131	53140	20 %	20 %	40 %	20 %	109896373
24	NC_008228	TGATT	2	10	59238	59247	20 %	60 %	20 %	0 %	109896378
25	NC_008228	ACTCG	2	10	59880	59889	20 %	20 %	20 %	40 %	109896379
26	NC_008228	CATGG	2	10	60679	60688	20 %	20 %	40 %	20 %	109896381
27	NC_008228	ATGGC	2	10	62201	62210	20 %	20 %	40 %	20 %	109896383
28	NC_008228	TACAA	2	10	62570	62579	60 %	20 %	0 %	20 %	109896383
29	NC_008228	AGTTG	2	10	65989	65998	20 %	40 %	40 %	0 %	109896387
30	NC_008228	GCTGT	2	10	66224	66233	0 %	40 %	40 %	20 %	109896387
31	NC_008228	TGCGT	2	10	73696	73705	0 %	40 %	40 %	20 %	109896392
32	NC_008228	CACGT	2	10	74564	74573	20 %	20 %	20 %	40 %	109896393
33	NC_008228	AACGC	2	10	76906	76915	40 %	0 %	20 %	40 %	109896397
34	NC_008228	GCAAG	2	10	78141	78150	40 %	0 %	40 %	20 %	109896398
35	NC_008228	AGCTT	2	10	80254	80263	20 %	40 %	20 %	20 %	109896400
36	NC_008228	CGTGG	2	10	81399	81408	0 %	20 %	60 %	20 %	109896401
37	NC_008228	TGTTC	2	10	84241	84250	0 %	60 %	20 %	20 %	109896402
38	NC_008228	TCAGC	2	10	84322	84331	20 %	20 %	20 %	40 %	109896402
39	NC_008228	CCAAT	2	10	84825	84834	40 %	20 %	0 %	40 %	109896402
40	NC_008228	GTATT	2	10	92141	92150	20 %	60 %	20 %	0 %	109896410
41	NC_008228	TGCGG	2	10	92531	92540	0 %	20 %	60 %	20 %	109896410
42	NC_008228	GCCTT	2	10	94201	94210	0 %	40 %	20 %	40 %	109896411
43	NC_008228	CCTAT	2	10	98664	98673	20 %	40 %	0 %	40 %	109896415
44	NC_008228	AGCCC	2	10	101968	101977	20 %	0 %	20 %	60 %	109896418
45	NC_008228	AGTAC	2	10	103232	103241	40 %	20 %	20 %	20 %	109896420
46	NC_008228	GCCAA	2	10	105125	105134	40 %	0 %	20 %	40 %	109896422
47	NC_008228	ATACA	2	10	105370	105379	60 %	20 %	0 %	20 %	109896422
48	NC_008228	TGTGC	2	10	107530	107539	0 %	40 %	40 %	20 %	109896424
49	NC_008228	TTGAT	2	10	109183	109192	20 %	60 %	20 %	0 %	109896426
50	NC_008228	TTGGC	2	10	110362	110371	0 %	40 %	40 %	20 %	109896427
51	NC_008228	TTGAA	2	10	110490	110499	40 %	40 %	20 %	0 %	109896427
52	NC_008228	GTTTT	2	10	110749	110758	0 %	80 %	20 %	0 %	109896427
53	NC_008228	GGTGC	2	10	113225	113234	0 %	20 %	60 %	20 %	109896430
54	NC_008228	GGGCA	2	10	114787	114796	20 %	0 %	60 %	20 %	109896432
55	NC_008228	CAACA	2	10	117641	117650	60 %	0 %	0 %	40 %	109896434
56	NC_008228	GTTGG	2	10	120296	120305	0 %	40 %	60 %	0 %	109896437
57	NC_008228	GTTTT	2	10	123501	123510	0 %	80 %	20 %	0 %	109896438
58	NC_008228	GGTAA	2	10	125255	125264	40 %	20 %	40 %	0 %	109896440
59	NC_008228	CAGGT	2	10	125406	125415	20 %	20 %	40 %	20 %	109896440
60	NC_008228	AGTTT	2	10	127252	127261	20 %	60 %	20 %	0 %	109896443
61	NC_008228	ATCAC	2	10	128872	128881	40 %	20 %	0 %	40 %	109896444
62	NC_008228	GGTGT	2	10	130217	130226	0 %	40 %	60 %	0 %	109896446
63	NC_008228	CAGCC	2	10	131430	131439	20 %	0 %	20 %	60 %	109896447
64	NC_008228	AATCC	2	10	135428	135437	40 %	20 %	0 %	40 %	109896448
65	NC_008228	AATTG	2	10	137187	137196	40 %	40 %	20 %	0 %	109896450
66	NC_008228	CTTTG	2	10	139858	139867	0 %	60 %	20 %	20 %	109896451
67	NC_008228	ATTTC	2	10	140227	140236	20 %	60 %	0 %	20 %	109896451
68	NC_008228	TTCAA	2	10	143138	143147	40 %	40 %	0 %	20 %	109896453
69	NC_008228	CCCAA	2	10	145288	145297	40 %	0 %	0 %	60 %	109896454
70	NC_008228	ACTTT	2	10	146924	146933	20 %	60 %	0 %	20 %	109896454
71	NC_008228	TTGCC	2	10	147296	147305	0 %	40 %	20 %	40 %	109896454
72	NC_008228	ACTCG	2	10	152582	152591	20 %	20 %	20 %	40 %	109896459
73	NC_008228	TGTGG	2	10	153916	153925	0 %	40 %	60 %	0 %	109896459
74	NC_008228	GCCAT	2	10	154452	154461	20 %	20 %	20 %	40 %	109896459
75	NC_008228	TGCAA	2	10	158370	158379	40 %	20 %	20 %	20 %	109896461
76	NC_008228	GTAAA	2	10	160311	160320	60 %	20 %	20 %	0 %	109896462
77	NC_008228	TACTT	2	10	161397	161406	20 %	60 %	0 %	20 %	109896464
78	NC_008228	ATGAC	2	10	162758	162767	40 %	20 %	20 %	20 %	109896465
79	NC_008228	GAAAT	2	10	164275	164284	60 %	20 %	20 %	0 %	109896467
80	NC_008228	CCATT	2	10	166176	166185	20 %	40 %	0 %	40 %	109896470
81	NC_008228	CCTAA	2	10	171124	171133	40 %	20 %	0 %	40 %	109896475
82	NC_008228	TAAAT	2	10	171909	171918	60 %	40 %	0 %	0 %	109896476
83	NC_008228	TAGGT	2	10	179499	179508	20 %	40 %	40 %	0 %	109896480
84	NC_008228	CTTGT	2	10	180988	180997	0 %	60 %	20 %	20 %	109896482
85	NC_008228	ACAAT	2	10	181965	181974	60 %	20 %	0 %	20 %	109896482
86	NC_008228	ACCAC	2	10	182169	182178	40 %	0 %	0 %	60 %	109896482
87	NC_008228	AATCG	2	10	182308	182317	40 %	20 %	20 %	20 %	109896483
88	NC_008228	CTCAG	2	10	182736	182745	20 %	20 %	20 %	40 %	109896483
89	NC_008228	GTAGC	2	10	183085	183094	20 %	20 %	40 %	20 %	109896483
90	NC_008228	ATGCA	2	10	185905	185914	40 %	20 %	20 %	20 %	109896485
91	NC_008228	ATTTC	2	10	187471	187480	20 %	60 %	0 %	20 %	109896486
92	NC_008228	ATGTA	2	10	188667	188676	40 %	40 %	20 %	0 %	109896486
93	NC_008228	TGAAT	2	10	189610	189619	40 %	40 %	20 %	0 %	109896487
94	NC_008228	GTAAG	2	10	190383	190392	40 %	20 %	40 %	0 %	109896489
95	NC_008228	AACCA	2	10	191214	191223	60 %	0 %	0 %	40 %	109896490
96	NC_008228	CAATT	2	10	192148	192157	40 %	40 %	0 %	20 %	109896491
97	NC_008228	CAAAG	2	10	195538	195547	60 %	0 %	20 %	20 %	109896495
98	NC_008228	AAACG	2	10	198648	198657	60 %	0 %	20 %	20 %	109896498
99	NC_008228	CGTTA	2	10	199439	199448	20 %	40 %	20 %	20 %	109896499
100	NC_008228	AATTG	2	10	207492	207501	40 %	40 %	20 %	0 %	109896507
101	NC_008228	CGCTA	2	10	208567	208576	20 %	20 %	20 %	40 %	109896508
102	NC_008228	AAGGC	2	10	211607	211616	40 %	0 %	40 %	20 %	109896513
103	NC_008228	GGTAT	2	10	216946	216955	20 %	40 %	40 %	0 %	109896514
104	NC_008228	GTTTT	2	10	217450	217459	0 %	80 %	20 %	0 %	109896515
105	NC_008228	TGAGC	2	10	218499	218508	20 %	20 %	40 %	20 %	109896516
106	NC_008228	CAAAA	2	10	218665	218674	80 %	0 %	0 %	20 %	109896517
107	NC_008228	ACGAA	2	10	219055	219064	60 %	0 %	20 %	20 %	109896517
108	NC_008228	AAGGC	2	10	223468	223477	40 %	0 %	40 %	20 %	109896519
109	NC_008228	AACCA	2	10	223680	223689	60 %	0 %	0 %	40 %	109896519
110	NC_008228	GGCGC	2	10	227198	227207	0 %	0 %	60 %	40 %	109896522
111	NC_008228	TGGCT	2	10	230193	230202	0 %	40 %	40 %	20 %	109896524
112	NC_008228	TCAAA	2	10	230577	230586	60 %	20 %	0 %	20 %	109896524
113	NC_008228	CCAAG	2	10	231774	231783	40 %	0 %	20 %	40 %	109896525
114	NC_008228	CAGTT	2	10	232116	232125	20 %	40 %	20 %	20 %	109896525
115	NC_008228	TAAAA	2	10	232448	232457	80 %	20 %	0 %	0 %	109896525
116	NC_008228	ATAGA	2	10	233351	233360	60 %	20 %	20 %	0 %	109896526
117	NC_008228	ATTTG	2	10	235093	235102	20 %	60 %	20 %	0 %	109896527
118	NC_008228	AATAC	2	10	236331	236340	60 %	20 %	0 %	20 %	109896529
119	NC_008228	CCAAT	2	10	238358	238367	40 %	20 %	0 %	40 %	109896531
120	NC_008228	GCCAA	2	10	239057	239066	40 %	0 %	20 %	40 %	109896531
121	NC_008228	TTGCG	2	10	239772	239781	0 %	40 %	40 %	20 %	109896531
122	NC_008228	GATTC	2	10	244148	244157	20 %	40 %	20 %	20 %	109896534
123	NC_008228	CATTC	2	10	244781	244790	20 %	40 %	0 %	40 %	109896534
124	NC_008228	CTGTT	2	10	244863	244872	0 %	60 %	20 %	20 %	109896534
125	NC_008228	TAAGC	2	10	244876	244885	40 %	20 %	20 %	20 %	109896534
126	NC_008228	ACAAA	2	10	246002	246011	80 %	0 %	0 %	20 %	109896534
127	NC_008228	GCTTT	2	10	248784	248793	0 %	60 %	20 %	20 %	109896537
128	NC_008228	GCAAG	2	10	248935	248944	40 %	0 %	40 %	20 %	109896537
129	NC_008228	CAAAA	2	10	250658	250667	80 %	0 %	0 %	20 %	109896538
130	NC_008228	GGCAT	2	10	251843	251852	20 %	20 %	40 %	20 %	109896539
131	NC_008228	ATTCA	2	10	252205	252214	40 %	40 %	0 %	20 %	109896540
132	NC_008228	GTCAT	2	10	253529	253538	20 %	40 %	20 %	20 %	109896541
133	NC_008228	GGTTG	2	10	254626	254635	0 %	40 %	60 %	0 %	109896542
134	NC_008228	GTTGG	2	10	256204	256213	0 %	40 %	60 %	0 %	109896543
135	NC_008228	ACCTT	2	10	259465	259474	20 %	40 %	0 %	40 %	109896546
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151	NC_008228	CTGCT	2	10	299543	299552	0 %	40 %	20 %	40 %	109896587
152	NC_008228	TTTCA	2	10	300290	300299	20 %	60 %	0 %	20 %	109896588
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156	NC_008228	AGAAA	2	10	301789	301798	80 %	0 %	20 %	0 %	109896589
157	NC_008228	ATTGA	2	10	303797	303806	40 %	40 %	20 %	0 %	109896591
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168	NC_008228	GGTGT	2	10	326419	326428	0 %	40 %	60 %	0 %	109896610
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260	NC_008228	TCAGG	2	10	492525	492534	20 %	20 %	40 %	20 %	109896747
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