MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium difficile 630 plasmid pCD630

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008226	TCTT	2	8	312	319	0 %	75 %	0 %	25 %	110666924
2	NC_008226	CTTA	2	8	586	593	25 %	50 %	0 %	25 %	110666925
3	NC_008226	ATCA	2	8	601	608	50 %	25 %	0 %	25 %	110666925
4	NC_008226	AAAT	3	12	941	952	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008226	TATT	2	8	969	976	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008226	CTAA	2	8	991	998	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_008226	TCAT	2	8	1069	1076	25 %	50 %	0 %	25 %	110666926
8	NC_008226	TTCA	2	8	1266	1273	25 %	50 %	0 %	25 %	110666926
9	NC_008226	TTTA	2	8	1428	1435	25 %	75 %	0 %	0 %	110666926
10	NC_008226	TTTG	2	8	2155	2162	0 %	75 %	25 %	0 %	110666926
11	NC_008226	TTTG	2	8	2206	2213	0 %	75 %	25 %	0 %	110666926
12	NC_008226	AAAT	2	8	2422	2429	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008226	TAAA	2	8	2522	2529	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008226	TTAT	2	8	2571	2578	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008226	CTTT	2	8	2741	2748	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_008226	TTTA	2	8	2960	2967	25 %	75 %	0 %	0 %	110666928
17	NC_008226	ATTG	2	8	3171	3178	25 %	50 %	25 %	0 %	110666928
18	NC_008226	TTTA	2	8	3978	3985	25 %	75 %	0 %	0 %	110666929
19	NC_008226	CTAT	2	8	4402	4409	25 %	50 %	0 %	25 %	110666929
20	NC_008226	CTTT	2	8	4931	4938	0 %	75 %	0 %	25 %	110666929
21	NC_008226	CTTT	2	8	5637	5644	0 %	75 %	0 %	25 %	110666929
22	NC_008226	TTTA	2	8	5946	5953	25 %	75 %	0 %	0 %	110666929
23	NC_008226	AATT	2	8	6078	6085	50 %	50 %	0 %	0 %	110666929
24	NC_008226	CAAA	2	8	6272	6279	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008226	ATCA	2	8	6510	6517	50 %	25 %	0 %	25 %	110666930
26	NC_008226	TATG	2	8	6639	6646	25 %	50 %	25 %	0 %	110666930
27	NC_008226	ATTT	2	8	6873	6880	25 %	75 %	0 %	0 %	110666931
28	NC_008226	AACA	2	8	6903	6910	75 %	0 %	0 %	25 %	110666931
29	NC_008226	CTAA	2	8	6920	6927	50 %	25 %	0 %	25 %	110666931
30	NC_008226	TTAT	2	8	6995	7002	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008226	TAAC	2	8	7134	7141	50 %	25 %	0 %	25 %	110666932
32	NC_008226	AAAT	2	8	7440	7447	75 %	25 %	0 %	0 %	110666932

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.