MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Clostridium difficile 630 plasmid pCD630

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008226	AT	3	6	21	26	50 %	50 %	0 %	0 %	110666923
2	NC_008226	AT	3	6	57	62	50 %	50 %	0 %	0 %	110666923
3	NC_008226	CA	3	6	460	465	50 %	0 %	0 %	50 %	110666924
4	NC_008226	CT	3	6	539	544	0 %	50 %	0 %	50 %	110666924
5	NC_008226	TA	3	6	551	556	50 %	50 %	0 %	0 %	110666925
6	NC_008226	TA	3	6	1328	1333	50 %	50 %	0 %	0 %	110666926
7	NC_008226	TA	3	6	1893	1898	50 %	50 %	0 %	0 %	110666926
8	NC_008226	CT	3	6	3643	3648	0 %	50 %	0 %	50 %	110666929
9	NC_008226	TA	4	8	3697	3704	50 %	50 %	0 %	0 %	110666929
10	NC_008226	TA	3	6	3897	3902	50 %	50 %	0 %	0 %	110666929
11	NC_008226	CT	3	6	3963	3968	0 %	50 %	0 %	50 %	110666929
12	NC_008226	TA	3	6	4124	4129	50 %	50 %	0 %	0 %	110666929
13	NC_008226	TA	4	8	4449	4456	50 %	50 %	0 %	0 %	110666929
14	NC_008226	TA	3	6	4495	4500	50 %	50 %	0 %	0 %	110666929
15	NC_008226	TC	3	6	4564	4569	0 %	50 %	0 %	50 %	110666929
16	NC_008226	TA	3	6	4585	4590	50 %	50 %	0 %	0 %	110666929
17	NC_008226	AT	3	6	4940	4945	50 %	50 %	0 %	0 %	110666929
18	NC_008226	TA	3	6	5090	5095	50 %	50 %	0 %	0 %	110666929
19	NC_008226	AT	3	6	5233	5238	50 %	50 %	0 %	0 %	110666929
20	NC_008226	TA	3	6	5936	5941	50 %	50 %	0 %	0 %	110666929
21	NC_008226	AT	5	10	6369	6378	50 %	50 %	0 %	0 %	110666930
22	NC_008226	AT	3	6	6492	6497	50 %	50 %	0 %	0 %	110666930
23	NC_008226	AT	3	6	7099	7104	50 %	50 %	0 %	0 %	110666932

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.