MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Clostridium difficile 630 plasmid pCD630

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008226	A	6	6	32	37	100 %	0 %	0 %	0 %	110666923
2	NC_008226	T	6	6	49	54	0 %	100 %	0 %	0 %	110666923
3	NC_008226	C	7	7	148	154	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4	NC_008226	T	6	6	165	170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008226	G	6	6	235	240	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008226	T	8	8	249	256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008226	T	6	6	329	334	0 %	100 %	0 %	0 %	110666924
8	NC_008226	A	8	8	953	960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008226	T	6	6	1009	1014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008226	T	7	7	1359	1365	0 %	100 %	0 %	0 %	110666926
11	NC_008226	T	6	6	1665	1670	0 %	100 %	0 %	0 %	110666926
12	NC_008226	T	8	8	1976	1983	0 %	100 %	0 %	0 %	110666926
13	NC_008226	T	7	7	2014	2020	0 %	100 %	0 %	0 %	110666926
14	NC_008226	T	7	7	2235	2241	0 %	100 %	0 %	0 %	110666926
15	NC_008226	T	6	6	2273	2278	0 %	100 %	0 %	0 %	110666926
16	NC_008226	T	6	6	2394	2399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008226	T	6	6	2461	2466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008226	A	7	7	2509	2515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008226	T	8	8	2646	2653	0 %	100 %	0 %	0 %	110666927
20	NC_008226	A	6	6	2681	2686	100 %	0 %	0 %	0 %	110666927
21	NC_008226	A	6	6	2693	2698	100 %	0 %	0 %	0 %	110666927
22	NC_008226	T	8	8	2712	2719	0 %	100 %	0 %	0 %	110666927
23	NC_008226	T	6	6	2772	2777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008226	T	6	6	2861	2866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008226	T	7	7	2893	2899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008226	T	6	6	3023	3028	0 %	100 %	0 %	0 %	110666928
27	NC_008226	T	6	6	3077	3082	0 %	100 %	0 %	0 %	110666928
28	NC_008226	T	6	6	3368	3373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008226	T	6	6	3615	3620	0 %	100 %	0 %	0 %	110666929
30	NC_008226	T	6	6	3669	3674	0 %	100 %	0 %	0 %	110666929
31	NC_008226	T	8	8	3806	3813	0 %	100 %	0 %	0 %	110666929
32	NC_008226	T	7	7	4331	4337	0 %	100 %	0 %	0 %	110666929
33	NC_008226	T	6	6	4513	4518	0 %	100 %	0 %	0 %	110666929
34	NC_008226	T	6	6	5742	5747	0 %	100 %	0 %	0 %	110666929
35	NC_008226	T	6	6	5761	5766	0 %	100 %	0 %	0 %	110666929
36	NC_008226	T	7	7	5780	5786	0 %	100 %	0 %	0 %	110666929
37	NC_008226	T	6	6	6064	6069	0 %	100 %	0 %	0 %	110666929
38	NC_008226	T	8	8	6120	6127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008226	T	7	7	6296	6302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008226	T	6	6	6353	6358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008226	T	7	7	6401	6407	0 %	100 %	0 %	0 %	110666930
42	NC_008226	T	6	6	6497	6502	0 %	100 %	0 %	0 %	110666930
43	NC_008226	T	7	7	6521	6527	0 %	100 %	0 %	0 %	110666930
44	NC_008226	T	6	6	6582	6587	0 %	100 %	0 %	0 %	110666930
45	NC_008226	T	6	6	6699	6704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008226	A	6	6	6835	6840	100 %	0 %	0 %	0 %	110666931
47	NC_008226	A	6	6	6959	6964	100 %	0 %	0 %	0 %	110666931
48	NC_008226	T	6	6	7709	7714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.