MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790 plasmid PL47

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008213	TCGGTG	2	12	365	376	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	109644368
2	NC_008213	GTCACT	2	12	2093	2104	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	109644370
3	NC_008213	AATCCC	2	12	2680	2691	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008213	TGTCAC	2	12	3212	3223	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008213	TGACAT	2	12	3492	3503	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_008213	CTGCTC	2	12	6791	6802	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	109644373
7	NC_008213	CATGAC	2	12	7520	7531	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	109644374
8	NC_008213	ACCCAG	2	12	8819	8830	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008213	CTGTGG	2	12	9453	9464	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	109644377
10	NC_008213	ATCGAC	2	12	10021	10032	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008213	GAGGAT	2	12	10767	10778	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	109644378
12	NC_008213	TTTCAC	2	12	11863	11874	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	109644379
13	NC_008213	GAAAGT	2	12	19658	19669	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	109644382
14	NC_008213	TAACCG	2	12	21709	21720	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008213	ATATCG	2	12	22365	22376	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_008213	TCGGTC	2	12	25734	25745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644385
17	NC_008213	CAGTAT	2	12	26537	26548	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_008213	CACTTG	2	12	33957	33968	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	109644389
19	NC_008213	TCAGAG	2	12	35234	35245	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	109644390
20	NC_008213	AAACAG	2	12	37635	37646	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_008213	AGAATA	2	12	40353	40364	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	109644396
22	NC_008213	GATATG	2	12	41334	41345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644398
23	NC_008213	GTGGAT	2	12	45203	45214	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	109644402

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.