MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790 plasmid PL47

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008213	GTTGT	2	10	1952	1961	0 %	60 %	40 %	0 %	109644370
2	NC_008213	AGCCT	2	10	2190	2199	20 %	20 %	20 %	40 %	109644370
3	NC_008213	ATCTC	2	10	2367	2376	20 %	40 %	0 %	40 %	109644370
4	NC_008213	TGCAT	2	10	2422	2431	20 %	40 %	20 %	20 %	109644370
5	NC_008213	AGCCT	2	10	3310	3319	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_008213	TGATA	2	10	3725	3734	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008213	GTTTC	2	10	7570	7579	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_008213	GCAGA	2	10	8346	8355	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_008213	GATAT	2	10	8390	8399	40 %	40 %	20 %	0 %	109644376
10	NC_008213	TGAAT	2	10	8805	8814	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008213	TATCA	2	10	9802	9811	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_008213	TTTAT	2	10	12180	12189	20 %	80 %	0 %	0 %	109644379
13	NC_008213	TTTCC	2	10	16140	16149	0 %	60 %	0 %	40 %	109644380
14	NC_008213	TAATA	2	10	18915	18924	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008213	AAGAA	2	10	21124	21133	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008213	GTTTG	2	10	21227	21236	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008213	TCGTT	2	10	21509	21518	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_008213	CCTCT	2	10	22261	22270	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
19	NC_008213	CATGG	2	10	25878	25887	20 %	20 %	40 %	20 %	109644385
20	NC_008213	AATAT	2	10	26692	26701	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008213	ACGAG	2	10	27694	27703	40 %	0 %	40 %	20 %	109644386
22	NC_008213	ATTTC	2	10	28366	28375	20 %	60 %	0 %	20 %	109644386
23	NC_008213	TCGTG	2	10	28378	28387	0 %	40 %	40 %	20 %	109644386
24	NC_008213	TCCCA	2	10	28591	28600	20 %	20 %	0 %	60 %	109644386
25	NC_008213	CTGGA	2	10	29764	29773	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_008213	CTTCC	2	10	31955	31964	0 %	40 %	0 %	60 %	109644387
27	NC_008213	AATCA	2	10	33733	33742	60 %	20 %	0 %	20 %	109644389
28	NC_008213	CAGAT	2	10	35926	35935	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_008213	TTCAG	2	10	38117	38126	20 %	40 %	20 %	20 %	109644394
30	NC_008213	TTAAT	2	10	38605	38614	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008213	CCACA	2	10	43689	43698	40 %	0 %	0 %	60 %	109644400
32	NC_008213	GGGTT	2	10	43798	43807	0 %	40 %	60 %	0 %	109644400
33	NC_008213	ATCGA	2	10	44306	44315	40 %	20 %	20 %	20 %	109644401
34	NC_008213	CATAA	2	10	46249	46258	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.