MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790 plasmid PL47

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008213	ATCT	2	8	801	808	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008213	GTAT	2	8	1697	1704	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008213	TAAT	2	8	2543	2550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008213	CTGT	2	8	2654	2661	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_008213	GTAT	2	8	2820	2827	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008213	TCTT	2	8	2920	2927	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_008213	CATT	2	8	2975	2982	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_008213	TCCC	2	8	2983	2990	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_008213	ATTG	2	8	3012	3019	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008213	TCTG	2	8	3240	3247	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_008213	TGTC	2	8	3254	3261	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008213	TGCA	2	8	3522	3529	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_008213	CCAC	2	8	3691	3698	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_008213	TCAT	2	8	7931	7938	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_008213	ATGT	2	8	8183	8190	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008213	CTGT	2	8	9150	9157	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_008213	CGAG	2	8	9719	9726	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_008213	ACAG	2	8	9746	9753	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008213	GGTG	2	8	9792	9799	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008213	TGAT	2	8	10291	10298	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008213	GATT	2	8	10370	10377	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008213	ATCC	2	8	10572	10579	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008213	CATT	2	8	10626	10633	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_008213	CTCA	2	8	11104	11111	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008213	GTCT	2	8	11404	11411	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_008213	CAGT	2	8	11494	11501	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_008213	CAAA	2	8	18976	18983	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_008213	AATC	2	8	20067	20074	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008213	AGCT	2	8	20078	20085	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008213	AGTA	2	8	20260	20267	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008213	ACAA	2	8	20438	20445	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_008213	CTGT	2	8	21106	21113	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_008213	CGTC	2	8	21570	21577	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008213	TGAT	2	8	22345	22352	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008213	AGTC	2	8	22561	22568	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008213	TTGT	2	8	22577	22584	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008213	AATC	2	8	22603	22610	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008213	CCGC	2	8	22842	22849	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_008213	GACA	2	8	23101	23108	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_008213	TGAC	2	8	23189	23196	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008213	CAGA	2	8	24243	24250	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_008213	CAAT	2	8	24380	24387	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_008213	ATGA	2	8	24649	24656	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008213	TCAA	2	8	26141	26148	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_008213	TCCT	2	8	26217	26224	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008213	GACG	2	8	26977	26984	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_008213	AATC	2	8	30236	30243	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_008213	GACA	2	8	30367	30374	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_008213	ACAG	2	8	30582	30589	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_008213	TTTG	2	8	33155	33162	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008213	TGAA	2	8	36231	36238	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008213	TGAT	2	8	38415	38422	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008213	TTAT	2	8	41223	41230	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008213	AGAT	2	8	43992	43999	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008213	CTTT	2	8	44053	44060	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_008213	GCTG	3	12	45082	45093	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_008213	CTTA	2	8	45778	45785	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_008213	TCAG	2	8	45964	45971	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_008213	GATA	2	8	46241	46248	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.