MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790 plasmid PL47

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008213	GATG	2	8	48	55	25 %	25 %	50 %	0 %	109644368
2	NC_008213	GATG	2	8	202	209	25 %	25 %	50 %	0 %	109644368
3	NC_008213	GTTC	2	8	1147	1154	0 %	50 %	25 %	25 %	109644369
4	NC_008213	CTCG	2	8	1184	1191	0 %	25 %	25 %	50 %	109644369
5	NC_008213	TCTT	2	8	1797	1804	0 %	75 %	0 %	25 %	109644370
6	NC_008213	CATT	2	8	1852	1859	25 %	50 %	0 %	25 %	109644370
7	NC_008213	TCCC	2	8	1860	1867	0 %	25 %	0 %	75 %	109644370
8	NC_008213	TGTC	2	8	2134	2141	0 %	50 %	25 %	25 %	109644370
9	NC_008213	TCAG	2	8	3974	3981	25 %	25 %	25 %	25 %	109644371
10	NC_008213	TGGT	2	8	4173	4180	0 %	50 %	50 %	0 %	109644371
11	NC_008213	TCTG	2	8	5571	5578	0 %	50 %	25 %	25 %	109644373
12	NC_008213	ATCA	2	8	6177	6184	50 %	25 %	0 %	25 %	109644373
13	NC_008213	CAGT	2	8	6320	6327	25 %	25 %	25 %	25 %	109644373
14	NC_008213	ATTG	2	8	6720	6727	25 %	50 %	25 %	0 %	109644373
15	NC_008213	ACAG	2	8	7376	7383	50 %	0 %	25 %	25 %	109644374
16	NC_008213	GTAC	2	8	8508	8515	25 %	25 %	25 %	25 %	109644376
17	NC_008213	ACAG	2	8	8586	8593	50 %	0 %	25 %	25 %	109644376
18	NC_008213	GAAC	2	8	9171	9178	50 %	0 %	25 %	25 %	109644377
19	NC_008213	CAGA	2	8	9476	9483	50 %	0 %	25 %	25 %	109644377
20	NC_008213	CGGA	2	8	9504	9511	25 %	0 %	50 %	25 %	109644377
21	NC_008213	TGTA	2	8	10709	10716	25 %	50 %	25 %	0 %	109644378
22	NC_008213	TGAG	2	8	10717	10724	25 %	25 %	50 %	0 %	109644378
23	NC_008213	CGAA	2	8	11810	11817	50 %	0 %	25 %	25 %	109644379
24	NC_008213	GTTC	2	8	12145	12152	0 %	50 %	25 %	25 %	109644379
25	NC_008213	AACA	2	8	12430	12437	75 %	0 %	0 %	25 %	109644379
26	NC_008213	AGCG	2	8	13704	13711	25 %	0 %	50 %	25 %	109644379
27	NC_008213	GAAC	2	8	13783	13790	50 %	0 %	25 %	25 %	109644379
28	NC_008213	ATAG	2	8	14216	14223	50 %	25 %	25 %	0 %	109644379
29	NC_008213	TATC	2	8	14329	14336	25 %	50 %	0 %	25 %	109644379
30	NC_008213	TGAA	2	8	14514	14521	50 %	25 %	25 %	0 %	109644379
31	NC_008213	CATC	2	8	15621	15628	25 %	25 %	0 %	50 %	109644380
32	NC_008213	GCCT	2	8	15787	15794	0 %	25 %	25 %	50 %	109644380
33	NC_008213	CTCA	2	8	16360	16367	25 %	25 %	0 %	50 %	109644380
34	NC_008213	ATGT	2	8	16549	16556	25 %	50 %	25 %	0 %	109644380
35	NC_008213	CAGC	2	8	16786	16793	25 %	0 %	25 %	50 %	109644380
36	NC_008213	GAAC	2	8	19870	19877	50 %	0 %	25 %	25 %	109644382
37	NC_008213	TCAC	2	8	21903	21910	25 %	25 %	0 %	50 %	109644384
38	NC_008213	TGAT	2	8	22193	22200	25 %	50 %	25 %	0 %	109644384
39	NC_008213	GTCA	2	8	27186	27193	25 %	25 %	25 %	25 %	109644386
40	NC_008213	ATTG	2	8	27771	27778	25 %	50 %	25 %	0 %	109644386
41	NC_008213	TGCC	2	8	28845	28852	0 %	25 %	25 %	50 %	109644386
42	NC_008213	TCCA	2	8	31006	31013	25 %	25 %	0 %	50 %	109644387
43	NC_008213	CCAG	2	8	31335	31342	25 %	0 %	25 %	50 %	109644387
44	NC_008213	CTGC	2	8	31878	31885	0 %	25 %	25 %	50 %	109644387
45	NC_008213	GGAT	2	8	32005	32012	25 %	25 %	50 %	0 %	109644388
46	NC_008213	TGCT	2	8	32023	32030	0 %	50 %	25 %	25 %	109644388
47	NC_008213	TCGA	2	8	32203	32210	25 %	25 %	25 %	25 %	109644388
48	NC_008213	GATG	2	8	32537	32544	25 %	25 %	50 %	0 %	109644388
49	NC_008213	GGAT	2	8	33438	33445	25 %	25 %	50 %	0 %	109644389
50	NC_008213	CAGA	2	8	33592	33599	50 %	0 %	25 %	25 %	109644389
51	NC_008213	TCGG	2	8	33752	33759	0 %	25 %	50 %	25 %	109644389
52	NC_008213	CCAT	2	8	34209	34216	25 %	25 %	0 %	50 %	109644389
53	NC_008213	TGAT	2	8	34462	34469	25 %	50 %	25 %	0 %	109644390
54	NC_008213	AAGC	2	8	34896	34903	50 %	0 %	25 %	25 %	109644390
55	NC_008213	TGAG	2	8	35283	35290	25 %	25 %	50 %	0 %	109644390
56	NC_008213	CATC	2	8	36487	36494	25 %	25 %	0 %	50 %	109644392
57	NC_008213	TGAC	2	8	36664	36671	25 %	25 %	25 %	25 %	109644392
58	NC_008213	GATT	2	8	36713	36720	25 %	50 %	25 %	0 %	109644392
59	NC_008213	TCGA	2	8	36829	36836	25 %	25 %	25 %	25 %	109644392
60	NC_008213	TCAA	2	8	37012	37019	50 %	25 %	0 %	25 %	109644392
61	NC_008213	CCGA	2	8	37450	37457	25 %	0 %	25 %	50 %	109644393
62	NC_008213	GTCA	2	8	38011	38018	25 %	25 %	25 %	25 %	109644394
63	NC_008213	TCCG	2	8	38107	38114	0 %	25 %	25 %	50 %	109644394
64	NC_008213	AGCA	2	8	38914	38921	50 %	0 %	25 %	25 %	109644395
65	NC_008213	CCAA	2	8	39744	39751	50 %	0 %	0 %	50 %	109644396
66	NC_008213	AGAA	2	8	40078	40085	75 %	0 %	25 %	0 %	109644396
67	NC_008213	CATC	2	8	40418	40425	25 %	25 %	0 %	50 %	109644397
68	NC_008213	ACTC	2	8	40885	40892	25 %	25 %	0 %	50 %	109644397
69	NC_008213	ATTC	2	8	41738	41745	25 %	50 %	0 %	25 %	109644398
70	NC_008213	ATCA	2	8	41874	41881	50 %	25 %	0 %	25 %	109644398
71	NC_008213	CAAT	2	8	42091	42098	50 %	25 %	0 %	25 %	109644398
72	NC_008213	GTGG	2	8	42148	42155	0 %	25 %	75 %	0 %	109644398
73	NC_008213	TGGG	2	8	42944	42951	0 %	25 %	75 %	0 %	109644399
74	NC_008213	AGAC	2	8	44296	44303	50 %	0 %	25 %	25 %	109644401
75	NC_008213	GATG	2	8	44422	44429	25 %	25 %	50 %	0 %	109644401
76	NC_008213	CAAT	2	8	44871	44878	50 %	25 %	0 %	25 %	109644401
77	NC_008213	GTCA	2	8	45636	45643	25 %	25 %	25 %	25 %	109644402
78	NC_008213	GGAA	2	8	46674	46681	50 %	0 %	50 %	0 %	109644403

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.