MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790 plasmid PL47

Total Repeats: 384

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008213	TGA	2	6	120	125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644368
2	NC_008213	CTT	2	6	193	198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109644368
3	NC_008213	TGT	2	6	244	249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109644368
4	NC_008213	AGT	2	6	293	298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644368
5	NC_008213	GAC	2	6	325	330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644368
6	NC_008213	CTG	2	6	403	408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644368
7	NC_008213	TCA	2	6	443	448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644368
8	NC_008213	AGC	2	6	467	472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644368
9	NC_008213	TGA	2	6	477	482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644368
10	NC_008213	TCG	2	6	494	499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644368
11	NC_008213	CAC	2	6	854	859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109644369
12	NC_008213	ATC	2	6	882	887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644369
13	NC_008213	GAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109644369
14	NC_008213	TCA	2	6	949	954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644369
15	NC_008213	TCC	2	6	960	965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	109644369
16	NC_008213	TCC	2	6	1198	1203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	109644369
17	NC_008213	GAC	3	9	1206	1214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644369
18	NC_008213	CTC	2	6	1385	1390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	109644369
19	NC_008213	ATG	2	6	1474	1479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644369
20	NC_008213	CTG	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644370
21	NC_008213	ACT	3	9	2102	2110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644370
22	NC_008213	GAG	2	6	2127	2132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	109644370
23	NC_008213	GAC	2	6	2153	2158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644370
24	NC_008213	GGA	2	6	2214	2219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	109644370
25	NC_008213	TCA	2	6	2307	2312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644370
26	NC_008213	TAT	2	6	4001	4006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109644371
27	NC_008213	TTG	2	6	4078	4083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109644371
28	NC_008213	TAA	2	6	4105	4110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109644371
29	NC_008213	AAT	2	6	4247	4252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109644371
30	NC_008213	ATC	2	6	4406	4411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644371
31	NC_008213	ACT	2	6	4445	4450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644371
32	NC_008213	TCA	2	6	4455	4460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644371
33	NC_008213	TGC	2	6	4568	4573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644371
34	NC_008213	TAT	2	6	4721	4726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109644372
35	NC_008213	ATT	2	6	4740	4745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109644372
36	NC_008213	ATC	2	6	4756	4761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644372
37	NC_008213	TGA	2	6	4820	4825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644372
38	NC_008213	ATT	2	6	4879	4884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109644372
39	NC_008213	GCT	2	6	5019	5024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644372
40	NC_008213	CGT	2	6	5484	5489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644373
41	NC_008213	GAT	2	6	5531	5536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644373
42	NC_008213	TGA	2	6	5551	5556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644373
43	NC_008213	ACC	2	6	5601	5606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109644373
44	NC_008213	GAT	2	6	5611	5616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644373
45	NC_008213	GAC	2	6	5617	5622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644373
46	NC_008213	GAC	2	6	5701	5706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644373
47	NC_008213	ACC	3	9	5813	5821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109644373
48	NC_008213	GCA	2	6	5857	5862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644373
49	NC_008213	TCC	2	6	5874	5879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	109644373
50	NC_008213	TGC	2	6	5979	5984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644373
51	NC_008213	CTG	2	6	6144	6149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644373
52	NC_008213	ACT	2	6	6238	6243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644373
53	NC_008213	GAC	2	6	6274	6279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644373
54	NC_008213	GTC	2	6	6363	6368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644373
55	NC_008213	ATT	2	6	6397	6402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109644373
56	NC_008213	TCT	2	6	6520	6525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109644373
57	NC_008213	GTG	2	6	6571	6576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109644373
58	NC_008213	CGT	2	6	6629	6634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644373
59	NC_008213	GGA	2	6	6667	6672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	109644373
60	NC_008213	TCT	2	6	6700	6705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109644373
61	NC_008213	GAG	2	6	7289	7294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	109644374
62	NC_008213	GTT	2	6	7309	7314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109644374
63	NC_008213	GAG	2	6	7324	7329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	109644374
64	NC_008213	CAC	2	6	7500	7505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109644374
65	NC_008213	ATC	2	6	7790	7795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644375
66	NC_008213	CGA	2	6	7834	7839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644375
67	NC_008213	TAA	2	6	7909	7914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109644375
68	NC_008213	GAT	2	6	8632	8637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644376
69	NC_008213	CTG	2	6	8696	8701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644376
70	NC_008213	CTC	2	6	8749	8754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	109644376
71	NC_008213	GAT	2	6	8755	8760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644376
72	NC_008213	TGA	2	6	8790	8795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644376
73	NC_008213	GGA	2	6	9259	9264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	109644377
74	NC_008213	CGA	2	6	9272	9277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644377
75	NC_008213	GAT	2	6	9291	9296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644377
76	NC_008213	GAC	3	9	9382	9390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644377
77	NC_008213	ATC	2	6	9494	9499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644377
78	NC_008213	CAT	2	6	9522	9527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644377
79	NC_008213	TCA	2	6	10751	10756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644378
80	NC_008213	GAA	2	6	10761	10766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109644378
81	NC_008213	GAA	3	9	10812	10820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109644378
82	NC_008213	GAA	2	6	10866	10871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109644378
83	NC_008213	GAT	2	6	10875	10880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644378
84	NC_008213	ACC	2	6	10890	10895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109644378
85	NC_008213	AGC	2	6	10958	10963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644378
86	NC_008213	TGC	2	6	11005	11010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644378
87	NC_008213	GTC	2	6	11041	11046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644378
88	NC_008213	CCG	2	6	11622	11627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	109644379
89	NC_008213	GAC	2	6	11720	11725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644379
90	NC_008213	GAC	2	6	11744	11749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644379
91	NC_008213	CAG	2	6	11918	11923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644379
92	NC_008213	AAG	2	6	11963	11968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109644379
93	NC_008213	ACA	2	6	12015	12020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109644379
94	NC_008213	GAG	2	6	12065	12070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	109644379
95	NC_008213	CTG	2	6	12170	12175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644379
96	NC_008213	TCA	2	6	12238	12243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644379
97	NC_008213	GAC	2	6	12324	12329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644379
98	NC_008213	TGG	2	6	12358	12363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109644379
99	NC_008213	AGA	2	6	12424	12429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109644379
100	NC_008213	CGA	2	6	12487	12492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644379
101	NC_008213	TAC	2	6	12584	12589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644379
102	NC_008213	TCT	2	6	12640	12645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109644379
103	NC_008213	GAG	2	6	12680	12685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	109644379
104	NC_008213	GAT	2	6	12689	12694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644379
105	NC_008213	TCG	2	6	12719	12724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644379
106	NC_008213	GGA	2	6	12746	12751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	109644379
107	NC_008213	GTG	2	6	12855	12860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109644379
108	NC_008213	AAG	2	6	12879	12884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109644379
109	NC_008213	CTT	2	6	12887	12892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109644379
110	NC_008213	ATT	2	6	13019	13024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109644379
111	NC_008213	AAC	2	6	13028	13033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109644379
112	NC_008213	GGT	2	6	13253	13258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109644379
113	NC_008213	ATA	2	6	13292	13297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109644379
114	NC_008213	GGA	2	6	13350	13355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	109644379
115	NC_008213	GGA	2	6	13411	13416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	109644379
116	NC_008213	AGA	2	6	13435	13440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109644379
117	NC_008213	AGG	2	6	13513	13518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	109644379
118	NC_008213	ACT	2	6	13575	13580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644379
119	NC_008213	ACG	2	6	13590	13595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644379
120	NC_008213	GAA	2	6	13640	13645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109644379
121	NC_008213	GAA	2	6	13658	13663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109644379
122	NC_008213	CAA	2	6	13720	13725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109644379
123	NC_008213	TTC	2	6	13802	13807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109644379
124	NC_008213	TCT	2	6	13906	13911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109644379
125	NC_008213	CAA	2	6	13948	13953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109644379
126	NC_008213	GAC	2	6	13973	13978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644379
127	NC_008213	ACG	2	6	14070	14075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644379
128	NC_008213	TAA	2	6	14187	14192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109644379
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375	NC_008213	TCA	2	6	45562	45567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644402
376	NC_008213	GTG	2	6	45571	45576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109644402
377	NC_008213	AGA	2	6	45598	45603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109644402
378	NC_008213	GAC	2	6	45646	45651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644402
379	NC_008213	GCA	2	6	45722	45727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644402
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.