MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790 plasmid PL47

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008213	TG	3	6	1002	1007	0 %	50 %	50 %	0 %	109644369
2	NC_008213	CT	3	6	1628	1633	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008213	AT	3	6	1672	1677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008213	AT	3	6	2382	2387	50 %	50 %	0 %	0 %	109644370
5	NC_008213	TG	3	6	2435	2440	0 %	50 %	50 %	0 %	109644370
6	NC_008213	AT	3	6	2451	2456	50 %	50 %	0 %	0 %	109644370
7	NC_008213	AT	3	6	2795	2800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008213	AT	3	6	3502	3507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008213	CA	3	6	3604	3609	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008213	CT	3	6	4151	4156	0 %	50 %	0 %	50 %	109644371
11	NC_008213	TA	3	6	4347	4352	50 %	50 %	0 %	0 %	109644371
12	NC_008213	GA	3	6	5217	5222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008213	AT	3	6	5273	5278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008213	AG	3	6	5409	5414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008213	AT	3	6	5415	5420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008213	GA	4	8	6422	6429	50 %	0 %	50 %	0 %	109644373
17	NC_008213	GA	4	8	6562	6569	50 %	0 %	50 %	0 %	109644373
18	NC_008213	CT	3	6	6869	6874	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_008213	GA	3	6	6918	6923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008213	CT	3	6	7105	7110	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008213	TG	3	6	7242	7247	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008213	AT	3	6	7299	7304	50 %	50 %	0 %	0 %	109644374
23	NC_008213	AG	3	6	7359	7364	50 %	0 %	50 %	0 %	109644374
24	NC_008213	TC	3	6	7486	7491	0 %	50 %	0 %	50 %	109644374
25	NC_008213	GA	3	6	8146	8151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008213	AT	3	6	8573	8578	50 %	50 %	0 %	0 %	109644376
27	NC_008213	CT	3	6	8851	8856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008213	AT	3	6	9540	9545	50 %	50 %	0 %	0 %	109644377
29	NC_008213	AC	3	6	9706	9711	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008213	AG	3	6	9725	9730	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008213	AC	3	6	9974	9979	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008213	AT	3	6	10653	10658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008213	GA	3	6	11315	11320	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008213	AT	3	6	11440	11445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008213	AG	3	6	11482	11487	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008213	CT	3	6	11647	11652	0 %	50 %	0 %	50 %	109644379
37	NC_008213	AG	3	6	12041	12046	50 %	0 %	50 %	0 %	109644379
38	NC_008213	AG	3	6	12446	12451	50 %	0 %	50 %	0 %	109644379
39	NC_008213	GA	3	6	12491	12496	50 %	0 %	50 %	0 %	109644379
40	NC_008213	AT	3	6	12543	12548	50 %	50 %	0 %	0 %	109644379
41	NC_008213	TC	3	6	13555	13560	0 %	50 %	0 %	50 %	109644379
42	NC_008213	CT	3	6	13934	13939	0 %	50 %	0 %	50 %	109644379
43	NC_008213	AT	3	6	14356	14361	50 %	50 %	0 %	0 %	109644379
44	NC_008213	TC	3	6	14638	14643	0 %	50 %	0 %	50 %	109644379
45	NC_008213	AG	3	6	15136	15141	50 %	0 %	50 %	0 %	109644379
46	NC_008213	AG	3	6	15170	15175	50 %	0 %	50 %	0 %	109644379
47	NC_008213	TC	3	6	16055	16060	0 %	50 %	0 %	50 %	109644380
48	NC_008213	TC	3	6	16065	16070	0 %	50 %	0 %	50 %	109644380
49	NC_008213	CT	3	6	16100	16105	0 %	50 %	0 %	50 %	109644380
50	NC_008213	AG	3	6	16541	16546	50 %	0 %	50 %	0 %	109644380
51	NC_008213	TA	4	8	16892	16899	50 %	50 %	0 %	0 %	109644380
52	NC_008213	CT	3	6	16952	16957	0 %	50 %	0 %	50 %	109644380
53	NC_008213	TC	3	6	17804	17809	0 %	50 %	0 %	50 %	109644380
54	NC_008213	TC	3	6	18065	18070	0 %	50 %	0 %	50 %	109644380
55	NC_008213	CT	3	6	18545	18550	0 %	50 %	0 %	50 %	109644380
56	NC_008213	TG	4	8	19097	19104	0 %	50 %	50 %	0 %	109644381
57	NC_008213	GA	3	6	19207	19212	50 %	0 %	50 %	0 %	109644381
58	NC_008213	TG	3	6	19484	19489	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008213	TA	3	6	19501	19506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008213	AT	3	6	19512	19517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008213	AT	3	6	19528	19533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008213	GT	3	6	20701	20706	0 %	50 %	50 %	0 %	109644383
63	NC_008213	CG	3	6	20769	20774	0 %	0 %	50 %	50 %	109644383
64	NC_008213	GT	3	6	21208	21213	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008213	GA	3	6	21289	21294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008213	CA	4	8	21445	21452	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_008213	TG	3	6	22410	22415	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008213	GA	3	6	23457	23462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008213	GA	3	6	23828	23833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008213	AT	3	6	24977	24982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008213	AC	3	6	25135	25140	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008213	AG	3	6	25518	25523	50 %	0 %	50 %	0 %	109644385
73	NC_008213	CT	3	6	25813	25818	0 %	50 %	0 %	50 %	109644385
74	NC_008213	CT	3	6	26167	26172	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_008213	CT	3	6	26735	26740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_008213	AT	3	6	26776	26781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008213	CT	3	6	27492	27497	0 %	50 %	0 %	50 %	109644386
78	NC_008213	CA	3	6	28005	28010	50 %	0 %	0 %	50 %	109644386
79	NC_008213	TG	3	6	28235	28240	0 %	50 %	50 %	0 %	109644386
80	NC_008213	CA	3	6	28751	28756	50 %	0 %	0 %	50 %	109644386
81	NC_008213	GT	3	6	29128	29133	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008213	CT	3	6	29300	29305	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_008213	AC	3	6	29781	29786	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_008213	AT	4	8	29842	29849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008213	TA	3	6	29912	29917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008213	CT	3	6	30055	30060	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_008213	GA	3	6	30080	30085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008213	GA	3	6	31395	31400	50 %	0 %	50 %	0 %	109644387
89	NC_008213	CT	3	6	31438	31443	0 %	50 %	0 %	50 %	109644387
90	NC_008213	AT	3	6	32144	32149	50 %	50 %	0 %	0 %	109644388
91	NC_008213	GA	3	6	32332	32337	50 %	0 %	50 %	0 %	109644388
92	NC_008213	AT	3	6	32525	32530	50 %	50 %	0 %	0 %	109644388
93	NC_008213	TA	3	6	32707	32712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008213	AT	3	6	33344	33349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008213	CA	3	6	33849	33854	50 %	0 %	0 %	50 %	109644389
96	NC_008213	TG	4	8	33928	33935	0 %	50 %	50 %	0 %	109644389
97	NC_008213	AC	3	6	34068	34073	50 %	0 %	0 %	50 %	109644389
98	NC_008213	AG	3	6	34727	34732	50 %	0 %	50 %	0 %	109644390
99	NC_008213	AT	3	6	35063	35068	50 %	50 %	0 %	0 %	109644390
100	NC_008213	AC	3	6	35873	35878	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_008213	GT	3	6	36124	36129	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008213	TC	3	6	36308	36313	0 %	50 %	0 %	50 %	109644392
103	NC_008213	CG	3	6	36428	36433	0 %	0 %	50 %	50 %	109644392
104	NC_008213	CA	3	6	37314	37319	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_008213	TG	3	6	38083	38088	0 %	50 %	50 %	0 %	109644394
106	NC_008213	GA	3	6	38291	38296	50 %	0 %	50 %	0 %	109644394
107	NC_008213	AC	3	6	38304	38309	50 %	0 %	0 %	50 %	109644394
108	NC_008213	TA	4	8	38387	38394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008213	TG	3	6	38404	38409	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008213	CA	3	6	38573	38578	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_008213	CT	3	6	38894	38899	0 %	50 %	0 %	50 %	109644395
112	NC_008213	CT	3	6	39334	39339	0 %	50 %	0 %	50 %	109644395
113	NC_008213	GA	3	6	39815	39820	50 %	0 %	50 %	0 %	109644396
114	NC_008213	CT	3	6	40184	40189	0 %	50 %	0 %	50 %	109644396
115	NC_008213	TC	3	6	40424	40429	0 %	50 %	0 %	50 %	109644397
116	NC_008213	TG	3	6	40494	40499	0 %	50 %	50 %	0 %	109644397
117	NC_008213	AG	3	6	40795	40800	50 %	0 %	50 %	0 %	109644397
118	NC_008213	TC	3	6	40921	40926	0 %	50 %	0 %	50 %	109644397
119	NC_008213	AG	3	6	40942	40947	50 %	0 %	50 %	0 %	109644397
120	NC_008213	AC	3	6	41455	41460	50 %	0 %	0 %	50 %	109644398
121	NC_008213	GA	3	6	41556	41561	50 %	0 %	50 %	0 %	109644398
122	NC_008213	CT	3	6	42006	42011	0 %	50 %	0 %	50 %	109644398
123	NC_008213	CA	4	8	42313	42320	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_008213	TC	3	6	42396	42401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_008213	AT	4	8	42816	42823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008213	GA	3	6	43329	43334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008213	CT	3	6	44217	44222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_008213	GC	3	6	44681	44686	0 %	0 %	50 %	50 %	109644401
129	NC_008213	GC	3	6	45356	45361	0 %	0 %	50 %	50 %	109644402
130	NC_008213	AT	3	6	45746	45751	50 %	50 %	0 %	0 %	109644402
131	NC_008213	TC	3	6	46324	46329	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.