MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790 plasmid PL47

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008213	CT	3	6	1628	1633	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008213	AT	3	6	1672	1677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008213	AT	3	6	2795	2800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008213	AT	3	6	3502	3507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008213	CA	3	6	3604	3609	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008213	GA	3	6	5217	5222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008213	AT	3	6	5273	5278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008213	AG	3	6	5409	5414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008213	AT	3	6	5415	5420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008213	CT	3	6	6869	6874	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008213	GA	3	6	6918	6923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008213	CT	3	6	7105	7110	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008213	TG	3	6	7242	7247	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008213	GA	3	6	8146	8151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008213	CT	3	6	8851	8856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008213	AC	3	6	9706	9711	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008213	AG	3	6	9725	9730	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008213	AC	3	6	9974	9979	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_008213	AT	3	6	10653	10658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008213	GA	3	6	11315	11320	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008213	AT	3	6	11440	11445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008213	AG	3	6	11482	11487	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008213	TG	3	6	19484	19489	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008213	TA	3	6	19501	19506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008213	AT	3	6	19512	19517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008213	AT	3	6	19528	19533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008213	GT	3	6	21208	21213	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008213	GA	3	6	21289	21294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008213	CA	4	8	21445	21452	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008213	TG	3	6	22410	22415	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008213	GA	3	6	23457	23462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008213	GA	3	6	23828	23833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008213	AT	3	6	24977	24982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008213	AC	3	6	25135	25140	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008213	CT	3	6	26167	26172	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_008213	CT	3	6	26735	26740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008213	AT	3	6	26776	26781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008213	GT	3	6	29128	29133	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008213	CT	3	6	29300	29305	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008213	AC	3	6	29781	29786	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008213	AT	4	8	29842	29849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008213	TA	3	6	29912	29917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008213	CT	3	6	30055	30060	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008213	GA	3	6	30080	30085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008213	TA	3	6	32707	32712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008213	AT	3	6	33344	33349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008213	AC	3	6	35873	35878	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008213	GT	3	6	36124	36129	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008213	CA	3	6	37314	37319	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008213	TA	4	8	38387	38394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008213	TG	3	6	38404	38409	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008213	CA	3	6	38573	38578	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008213	CA	4	8	42313	42320	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008213	TC	3	6	42396	42401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008213	AT	4	8	42816	42823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008213	GA	3	6	43329	43334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008213	CT	3	6	44217	44222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_008213	TC	3	6	46324	46329	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.