MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790

Total Repeats: 1288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008212	TCGAA	2	10	1505	1514	40 %	20 %	20 %	20 %	110666977
2	NC_008212	TTTTC	2	10	10351	10360	0 %	80 %	0 %	20 %	110666984
3	NC_008212	CCAGC	2	10	11602	11611	20 %	0 %	20 %	60 %	110666984
4	NC_008212	GCAAC	2	10	14504	14513	40 %	0 %	20 %	40 %	110666987
5	NC_008212	AGTCA	2	10	16346	16355	40 %	20 %	20 %	20 %	110666988
6	NC_008212	CATTG	2	10	18794	18803	20 %	40 %	20 %	20 %	110666990
7	NC_008212	AAAAT	2	10	19320	19329	80 %	20 %	0 %	0 %	110666991
8	NC_008212	CAGTC	2	10	20947	20956	20 %	20 %	20 %	40 %	110666993
9	NC_008212	TCCCC	2	10	31586	31595	0 %	20 %	0 %	80 %	110667000
10	NC_008212	CGAAC	2	10	31617	31626	40 %	0 %	20 %	40 %	110667000
11	NC_008212	AGTCA	2	10	34750	34759	40 %	20 %	20 %	20 %	110667004
12	NC_008212	CTGTT	2	10	36628	36637	0 %	60 %	20 %	20 %	110667006
13	NC_008212	AATGA	2	10	37880	37889	60 %	20 %	20 %	0 %	110667009
14	NC_008212	GCTGT	2	10	38296	38305	0 %	40 %	40 %	20 %	110667010
15	NC_008212	TGATG	2	10	40115	40124	20 %	40 %	40 %	0 %	110667012
16	NC_008212	CACGA	2	10	40334	40343	40 %	0 %	20 %	40 %	110667012
17	NC_008212	TGTCC	2	10	43605	43614	0 %	40 %	20 %	40 %	110667014
18	NC_008212	GCTCG	2	10	48666	48675	0 %	20 %	40 %	40 %	110667020
19	NC_008212	ACCAC	2	10	54847	54856	40 %	0 %	0 %	60 %	110667024
20	NC_008212	CAATT	2	10	55454	55463	40 %	40 %	0 %	20 %	110667024
21	NC_008212	ACACG	2	10	58471	58480	40 %	0 %	20 %	40 %	110667026
22	NC_008212	ATTCA	2	10	59184	59193	40 %	40 %	0 %	20 %	110667026
23	NC_008212	GACCT	2	10	60390	60399	20 %	20 %	20 %	40 %	110667027
24	NC_008212	CGAAA	2	10	61599	61608	60 %	0 %	20 %	20 %	110667028
25	NC_008212	AATGG	2	10	62820	62829	40 %	20 %	40 %	0 %	110667028
26	NC_008212	AATGG	2	10	63280	63289	40 %	20 %	40 %	0 %	110667028
27	NC_008212	CATCC	2	10	79334	79343	20 %	20 %	0 %	60 %	110667035
28	NC_008212	GAGAT	2	10	82206	82215	40 %	20 %	40 %	0 %	110667037
29	NC_008212	CAGAT	2	10	83907	83916	40 %	20 %	20 %	20 %	110667039
30	NC_008212	GATCT	2	10	89359	89368	20 %	40 %	20 %	20 %	110667046
31	NC_008212	GTTTG	2	10	91106	91115	0 %	60 %	40 %	0 %	110667048
32	NC_008212	CGAGC	2	10	92129	92138	20 %	0 %	40 %	40 %	110667049
33	NC_008212	GTTTG	2	10	93997	94006	0 %	60 %	40 %	0 %	110667049
34	NC_008212	AATCA	2	10	94404	94413	60 %	20 %	0 %	20 %	110667050
35	NC_008212	AATCC	2	10	102327	102336	40 %	20 %	0 %	40 %	110667056
36	NC_008212	TGAAC	2	10	102449	102458	40 %	20 %	20 %	20 %	110667056
37	NC_008212	GATTG	2	10	104039	104048	20 %	40 %	40 %	0 %	110667057
38	NC_008212	GACAC	2	10	104159	104168	40 %	0 %	20 %	40 %	110667057
39	NC_008212	GTTGA	2	10	105870	105879	20 %	40 %	40 %	0 %	110667057
40	NC_008212	ACCTG	2	10	107129	107138	20 %	20 %	20 %	40 %	110667057
41	NC_008212	CCGCG	2	10	108504	108513	0 %	0 %	40 %	60 %	110667057
42	NC_008212	CGACC	2	10	109123	109132	20 %	0 %	20 %	60 %	110667057
43	NC_008212	ACTCG	2	10	109279	109288	20 %	20 %	20 %	40 %	110667057
44	NC_008212	ACCGC	2	10	113213	113222	20 %	0 %	20 %	60 %	110667057
45	NC_008212	CCGCA	2	10	114082	114091	20 %	0 %	20 %	60 %	110667057
46	NC_008212	CCGGT	2	10	116147	116156	0 %	20 %	40 %	40 %	110667057
47	NC_008212	AGTCG	2	10	117025	117034	20 %	20 %	40 %	20 %	110667057
48	NC_008212	CGTTC	2	10	117205	117214	0 %	40 %	20 %	40 %	110667057
49	NC_008212	CCGCT	2	10	117552	117561	0 %	20 %	20 %	60 %	110667057
50	NC_008212	TCGAG	2	10	119223	119232	20 %	20 %	40 %	20 %	110667057
51	NC_008212	GTGTA	2	10	119924	119933	20 %	40 %	40 %	0 %	110667057
52	NC_008212	GTCCC	2	10	120201	120210	0 %	20 %	20 %	60 %	110667057
53	NC_008212	TTGAC	2	10	120419	120428	20 %	40 %	20 %	20 %	110667057
54	NC_008212	TCGCC	2	10	122676	122685	0 %	20 %	20 %	60 %	110667057
55	NC_008212	CACCG	2	10	125596	125605	20 %	0 %	20 %	60 %	110667057
56	NC_008212	CAGCG	2	10	125980	125989	20 %	0 %	40 %	40 %	110667057
57	NC_008212	TGTTC	2	10	126290	126299	0 %	60 %	20 %	20 %	110667057
58	NC_008212	CCCGA	2	10	129518	129527	20 %	0 %	20 %	60 %	110667057
59	NC_008212	AACTG	2	10	132507	132516	40 %	20 %	20 %	20 %	110667059
60	NC_008212	TTGAA	2	10	134482	134491	40 %	40 %	20 %	0 %	110667060
61	NC_008212	ATTCT	2	10	134493	134502	20 %	60 %	0 %	20 %	110667060
62	NC_008212	CGAAC	2	10	135270	135279	40 %	0 %	20 %	40 %	110667060
63	NC_008212	GTAAT	2	10	137040	137049	40 %	40 %	20 %	0 %	110667061
64	NC_008212	GACCC	2	10	141492	141501	20 %	0 %	20 %	60 %	110667065
65	NC_008212	GATTG	2	10	142516	142525	20 %	40 %	40 %	0 %	110667066
66	NC_008212	ACTCC	2	10	147443	147452	20 %	20 %	0 %	60 %	110667070
67	NC_008212	GTTGT	2	10	147825	147834	0 %	60 %	40 %	0 %	110667070
68	NC_008212	TCAAT	2	10	148002	148011	40 %	40 %	0 %	20 %	110667070
69	NC_008212	CATAT	2	10	149311	149320	40 %	40 %	0 %	20 %	110667071
70	NC_008212	GCCAC	2	10	152632	152641	20 %	0 %	20 %	60 %	110667073
71	NC_008212	ATATC	2	10	152662	152671	40 %	40 %	0 %	20 %	110667073
72	NC_008212	ACGAG	2	10	157849	157858	40 %	0 %	40 %	20 %	110667078
73	NC_008212	ACATA	2	10	160264	160273	60 %	20 %	0 %	20 %	110667081
74	NC_008212	GGATC	2	10	162600	162609	20 %	20 %	40 %	20 %	110667083
75	NC_008212	GACAT	2	10	163992	164001	40 %	20 %	20 %	20 %	110667085
76	NC_008212	GACGT	2	10	169093	169102	20 %	20 %	40 %	20 %	110667090
77	NC_008212	TCATC	2	10	173562	173571	20 %	40 %	0 %	40 %	110667093
78	NC_008212	CAATC	2	10	173681	173690	40 %	20 %	0 %	40 %	110667093
79	NC_008212	ATTCA	2	10	176667	176676	40 %	40 %	0 %	20 %	110667095
80	NC_008212	TCACC	2	10	181156	181165	20 %	20 %	0 %	60 %	110667098
81	NC_008212	GATAT	2	10	183416	183425	40 %	40 %	20 %	0 %	110667100
82	NC_008212	GTTGT	2	10	187571	187580	0 %	60 %	40 %	0 %	110667102
83	NC_008212	GGACA	2	10	188547	188556	40 %	0 %	40 %	20 %	110667103
84	NC_008212	GGATT	2	10	188560	188569	20 %	40 %	40 %	0 %	110667103
85	NC_008212	GAAAG	2	10	189226	189235	60 %	0 %	40 %	0 %	110667104
86	NC_008212	GCAGA	2	10	189815	189824	40 %	0 %	40 %	20 %	110667104
87	NC_008212	TTCAC	2	10	191031	191040	20 %	40 %	0 %	40 %	110667104
88	NC_008212	ACTCA	2	10	192424	192433	40 %	20 %	0 %	40 %	110667106
89	NC_008212	CGACT	2	10	192832	192841	20 %	20 %	20 %	40 %	110667106
90	NC_008212	CATCT	2	10	195515	195524	20 %	40 %	0 %	40 %	110667108
91	NC_008212	GTATC	2	10	198315	198324	20 %	40 %	20 %	20 %	110667112
92	NC_008212	CAATA	2	10	199281	199290	60 %	20 %	0 %	20 %	110667112
93	NC_008212	AGATC	2	10	199972	199981	40 %	20 %	20 %	20 %	110667113
94	NC_008212	TCGAA	2	10	204024	204033	40 %	20 %	20 %	20 %	110667118
95	NC_008212	GAGTC	2	10	211551	211560	20 %	20 %	40 %	20 %	110667127
96	NC_008212	AAAAG	2	10	212416	212425	80 %	0 %	20 %	0 %	110667127
97	NC_008212	ATGAA	2	10	216495	216504	60 %	20 %	20 %	0 %	110667130
98	NC_008212	AACAC	2	10	221455	221464	60 %	0 %	0 %	40 %	110667136
99	NC_008212	TGACC	2	10	222829	222838	20 %	20 %	20 %	40 %	110667137
100	NC_008212	ACCAC	2	10	227279	227288	40 %	0 %	0 %	60 %	110667140
101	NC_008212	AGACG	2	10	227501	227510	40 %	0 %	40 %	20 %	110667140
102	NC_008212	GGTGT	2	10	232219	232228	0 %	40 %	60 %	0 %	110667144
103	NC_008212	GAAAA	2	10	238608	238617	80 %	0 %	20 %	0 %	110667149
104	NC_008212	AATCG	2	10	238743	238752	40 %	20 %	20 %	20 %	110667149
105	NC_008212	TTGCT	2	10	241820	241829	0 %	60 %	20 %	20 %	110667154
106	NC_008212	ATCGC	2	10	244609	244618	20 %	20 %	20 %	40 %	110667155
107	NC_008212	CAATC	2	10	245251	245260	40 %	20 %	0 %	40 %	110667156
108	NC_008212	TTGTT	2	10	247788	247797	0 %	80 %	20 %	0 %	110667158
109	NC_008212	GCCGT	2	10	248664	248673	0 %	20 %	40 %	40 %	110667158
110	NC_008212	CTCAA	2	10	249363	249372	40 %	20 %	0 %	40 %	110667158
111	NC_008212	CAACA	2	10	255392	255401	60 %	0 %	0 %	40 %	110667163
112	NC_008212	ATTGT	2	10	257425	257434	20 %	60 %	20 %	0 %	110667166
113	NC_008212	TGGGG	2	10	259803	259812	0 %	20 %	80 %	0 %	110667166
114	NC_008212	TTCAA	2	10	261384	261393	40 %	40 %	0 %	20 %	110667166
115	NC_008212	CTTAT	2	10	261430	261439	20 %	60 %	0 %	20 %	110667166
116	NC_008212	GTAAT	2	10	264470	264479	40 %	40 %	20 %	0 %	110667169
117	NC_008212	TGGGT	2	10	265993	266002	0 %	40 %	60 %	0 %	110667170
118	NC_008212	GGGGT	2	10	266803	266812	0 %	20 %	80 %	0 %	110667170
119	NC_008212	GCTCA	2	10	269427	269436	20 %	20 %	20 %	40 %	110667170
120	NC_008212	CGGCA	2	10	269697	269706	20 %	0 %	40 %	40 %	110667170
121	NC_008212	AGTCG	2	10	270933	270942	20 %	20 %	40 %	20 %	110667170
122	NC_008212	CGTCA	2	10	272691	272700	20 %	20 %	20 %	40 %	110667170
123	NC_008212	CGGCT	2	10	273704	273713	0 %	20 %	40 %	40 %	110667170
124	NC_008212	ACGCC	2	10	274139	274148	20 %	0 %	20 %	60 %	110667170
125	NC_008212	TCGTT	2	10	275460	275469	0 %	60 %	20 %	20 %	110667171
126	NC_008212	GCACG	2	10	277234	277243	20 %	0 %	40 %	40 %	110667172
127	NC_008212	GTGAC	2	10	284203	284212	20 %	20 %	40 %	20 %	110667177
128	NC_008212	CGAAA	2	10	289020	289029	60 %	0 %	20 %	20 %	110667178
129	NC_008212	GATAA	2	10	289048	289057	60 %	20 %	20 %	0 %	110667178
130	NC_008212	CCAAG	2	10	292444	292453	40 %	0 %	20 %	40 %	110667179
131	NC_008212	TCGAA	2	10	295774	295783	40 %	20 %	20 %	20 %	110667180
132	NC_008212	TCGAA	2	10	302132	302141	40 %	20 %	20 %	20 %	110667184
133	NC_008212	TACGA	2	10	302671	302680	40 %	20 %	20 %	20 %	110667184
134	NC_008212	TTCCG	2	10	305983	305992	0 %	40 %	20 %	40 %	110667187
135	NC_008212	GAGTC	2	10	307876	307885	20 %	20 %	40 %	20 %	110667188
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249	NC_008212	AGCTC	2	10	601541	601550	20 %	20 %	20 %	40 %	110667446
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253	NC_008212	TGATC	2	10	611556	611565	20 %	40 %	20 %	20 %	110667453
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258	NC_008212	TACCA	2	10	620729	620738	40 %	20 %	0 %	40 %	110667461
259	NC_008212	ATATA	2	10	627832	627841	60 %	40 %	0 %	0 %	110667470
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391	NC_008212	TTTTG	2	10	959593	959602	0 %	80 %	20 %	0 %	110667733
392	NC_008212	ACCAT	2	10	960844	960853	40 %	20 %	0 %	40 %	110667735
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396	NC_008212	ATCAT	2	10	969560	969569	40 %	40 %	0 %	20 %	110667742
397	NC_008212	GATCG	2	10	974835	974844	20 %	20 %	40 %	20 %	110667748
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400	NC_008212	ATTGA	2	10	980749	980758	40 %	40 %	20 %	0 %	110667752
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497	NC_008212	GGACC	2	10	1224006	1224015	20 %	0 %	40 %	40 %	110667958
498	NC_008212	TGATG	2	10	1225922	1225931	20 %	40 %	40 %	0 %	110667959
499	NC_008212	ATTCA	2	10	1228096	1228105	40 %	40 %	0 %	20 %	110667962
500	NC_008212	CCAAT	2	10	1229093	1229102	40 %	20 %	0 %	40 %	110667962

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