MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790

Total Repeats: 6288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008212	TCAA	2	8	797	804	50 %	25 %	0 %	25 %	110666977
2	NC_008212	GTCA	2	8	1164	1171	25 %	25 %	25 %	25 %	110666977
3	NC_008212	TTCA	2	8	1871	1878	25 %	50 %	0 %	25 %	110666977
4	NC_008212	ACTT	2	8	1963	1970	25 %	50 %	0 %	25 %	110666977
5	NC_008212	AATT	2	8	2421	2428	50 %	50 %	0 %	0 %	110666977
6	NC_008212	ATAA	2	8	2794	2801	75 %	25 %	0 %	0 %	110666978
7	NC_008212	TCAC	2	8	2909	2916	25 %	25 %	0 %	50 %	110666978
8	NC_008212	AATC	2	8	3965	3972	50 %	25 %	0 %	25 %	110666979
9	NC_008212	GTTA	2	8	4162	4169	25 %	50 %	25 %	0 %	110666979
10	NC_008212	TCGA	2	8	4177	4184	25 %	25 %	25 %	25 %	110666979
11	NC_008212	GGCA	2	8	5070	5077	25 %	0 %	50 %	25 %	110666979
12	NC_008212	CGGT	2	8	5093	5100	0 %	25 %	50 %	25 %	110666979
13	NC_008212	CTCA	2	8	5435	5442	25 %	25 %	0 %	50 %	110666980
14	NC_008212	GTTT	2	8	5596	5603	0 %	75 %	25 %	0 %	110666980
15	NC_008212	ATAA	2	8	7172	7179	75 %	25 %	0 %	0 %	110666981
16	NC_008212	AATA	2	8	7300	7307	75 %	25 %	0 %	0 %	110666981
17	NC_008212	AAGT	2	8	7390	7397	50 %	25 %	25 %	0 %	110666981
18	NC_008212	ATAC	2	8	9213	9220	50 %	25 %	0 %	25 %	110666982
19	NC_008212	AAAC	2	8	10064	10071	75 %	0 %	0 %	25 %	110666983
20	NC_008212	CGTC	2	8	10718	10725	0 %	25 %	25 %	50 %	110666984
21	NC_008212	CATA	2	8	10798	10805	50 %	25 %	0 %	25 %	110666984
22	NC_008212	ACAA	2	8	10817	10824	75 %	0 %	0 %	25 %	110666984
23	NC_008212	GCTG	2	8	10914	10921	0 %	25 %	50 %	25 %	110666984
24	NC_008212	AGCA	2	8	11357	11364	50 %	0 %	25 %	25 %	110666984
25	NC_008212	ATTG	2	8	12151	12158	25 %	50 %	25 %	0 %	110666984
26	NC_008212	GTTT	2	8	12309	12316	0 %	75 %	25 %	0 %	110666984
27	NC_008212	CTTC	2	8	13539	13546	0 %	50 %	0 %	50 %	110666986
28	NC_008212	CATA	2	8	13675	13682	50 %	25 %	0 %	25 %	110666987
29	NC_008212	TCGT	2	8	13778	13785	0 %	50 %	25 %	25 %	110666987
30	NC_008212	ACAG	2	8	14016	14023	50 %	0 %	25 %	25 %	110666987
31	NC_008212	TCGT	2	8	14051	14058	0 %	50 %	25 %	25 %	110666987
32	NC_008212	TGGA	2	8	14084	14091	25 %	25 %	50 %	0 %	110666987
33	NC_008212	GATT	2	8	14655	14662	25 %	50 %	25 %	0 %	110666987
34	NC_008212	AATA	2	8	15223	15230	75 %	25 %	0 %	0 %	110666987
35	NC_008212	CGAC	2	8	15562	15569	25 %	0 %	25 %	50 %	110666987
36	NC_008212	CACT	2	8	16908	16915	25 %	25 %	0 %	50 %	110666988
37	NC_008212	GGAA	2	8	17115	17122	50 %	0 %	50 %	0 %	110666988
38	NC_008212	TTCT	2	8	17692	17699	0 %	75 %	0 %	25 %	110666989
39	NC_008212	GATA	2	8	18600	18607	50 %	25 %	25 %	0 %	110666990
40	NC_008212	GACA	2	8	19058	19065	50 %	0 %	25 %	25 %	110666991
41	NC_008212	AATG	2	8	19968	19975	50 %	25 %	25 %	0 %	110666992
42	NC_008212	TCGT	2	8	20408	20415	0 %	50 %	25 %	25 %	110666993
43	NC_008212	TTCT	2	8	22559	22566	0 %	75 %	0 %	25 %	110666994
44	NC_008212	GAGC	2	8	23086	23093	25 %	0 %	50 %	25 %	110666995
45	NC_008212	CACT	2	8	23425	23432	25 %	25 %	0 %	50 %	110666995
46	NC_008212	TTCG	2	8	23518	23525	0 %	50 %	25 %	25 %	110666995
47	NC_008212	ATGG	2	8	23676	23683	25 %	25 %	50 %	0 %	110666995
48	NC_008212	GCAG	2	8	23691	23698	25 %	0 %	50 %	25 %	110666995
49	NC_008212	AAGG	2	8	24426	24433	50 %	0 %	50 %	0 %	110666996
50	NC_008212	ATAC	2	8	24511	24518	50 %	25 %	0 %	25 %	110666996
51	NC_008212	ACGC	2	8	24741	24748	25 %	0 %	25 %	50 %	110666996
52	NC_008212	TCAG	2	8	24791	24798	25 %	25 %	25 %	25 %	110666996
53	NC_008212	TCAA	2	8	24899	24906	50 %	25 %	0 %	25 %	110666996
54	NC_008212	CAAA	2	8	25577	25584	75 %	0 %	0 %	25 %	110666996
55	NC_008212	AATT	2	8	26960	26967	50 %	50 %	0 %	0 %	110666997
56	NC_008212	AGAA	2	8	27260	27267	75 %	0 %	25 %	0 %	110666997
57	NC_008212	CGAC	2	8	27437	27444	25 %	0 %	25 %	50 %	110666997
58	NC_008212	TTCA	2	8	29543	29550	25 %	50 %	0 %	25 %	110666999
59	NC_008212	TGAT	2	8	29591	29598	25 %	50 %	25 %	0 %	110666999
60	NC_008212	GCTG	2	8	30559	30566	0 %	25 %	50 %	25 %	110667000
61	NC_008212	AACC	2	8	30615	30622	50 %	0 %	0 %	50 %	110667000
62	NC_008212	GACG	2	8	30991	30998	25 %	0 %	50 %	25 %	110667000
63	NC_008212	GACT	2	8	31486	31493	25 %	25 %	25 %	25 %	110667000
64	NC_008212	GAAT	2	8	32068	32075	50 %	25 %	25 %	0 %	110667001
65	NC_008212	TCAA	2	8	32420	32427	50 %	25 %	0 %	25 %	110667001
66	NC_008212	CCGA	2	8	34226	34233	25 %	0 %	25 %	50 %	110667003
67	NC_008212	CGGT	2	8	34793	34800	0 %	25 %	50 %	25 %	110667004
68	NC_008212	CCCG	2	8	34835	34842	0 %	0 %	25 %	75 %	110667004
69	NC_008212	GACC	2	8	34899	34906	25 %	0 %	25 %	50 %	110667005
70	NC_008212	CCAA	2	8	35503	35510	50 %	0 %	0 %	50 %	110667005
71	NC_008212	ACTT	2	8	36499	36506	25 %	50 %	0 %	25 %	110667006
72	NC_008212	GATT	2	8	37716	37723	25 %	50 %	25 %	0 %	110667009
73	NC_008212	GCTC	2	8	38574	38581	0 %	25 %	25 %	50 %	110667010
74	NC_008212	GATT	2	8	38605	38612	25 %	50 %	25 %	0 %	110667010
75	NC_008212	TTAT	2	8	38733	38740	25 %	75 %	0 %	0 %	110667010
76	NC_008212	GCAC	2	8	39828	39835	25 %	0 %	25 %	50 %	110667012
77	NC_008212	GGAT	2	8	40215	40222	25 %	25 %	50 %	0 %	110667012
78	NC_008212	ATGG	2	8	40305	40312	25 %	25 %	50 %	0 %	110667012
79	NC_008212	GGGT	2	8	41065	41072	0 %	25 %	75 %	0 %	110667013
80	NC_008212	AACC	2	8	41710	41717	50 %	0 %	0 %	50 %	110667013
81	NC_008212	TCAC	2	8	41823	41830	25 %	25 %	0 %	50 %	110667013
82	NC_008212	CTTC	2	8	42084	42091	0 %	50 %	0 %	50 %	110667013
83	NC_008212	TGGT	2	8	42383	42390	0 %	50 %	50 %	0 %	110667013
84	NC_008212	GCTT	2	8	42414	42421	0 %	50 %	25 %	25 %	110667013
85	NC_008212	ATGG	2	8	42459	42466	25 %	25 %	50 %	0 %	110667013
86	NC_008212	CTGT	2	8	43579	43586	0 %	50 %	25 %	25 %	110667014
87	NC_008212	AATT	2	8	43831	43838	50 %	50 %	0 %	0 %	110667015
88	NC_008212	AGAC	2	8	44339	44346	50 %	0 %	25 %	25 %	110667016
89	NC_008212	CGAC	2	8	44408	44415	25 %	0 %	25 %	50 %	110667016
90	NC_008212	GAAT	2	8	44767	44774	50 %	25 %	25 %	0 %	110667017
91	NC_008212	AGCG	2	8	44833	44840	25 %	0 %	50 %	25 %	110667017
92	NC_008212	ATGG	2	8	46902	46909	25 %	25 %	50 %	0 %	110667019
93	NC_008212	ATCA	2	8	47644	47651	50 %	25 %	0 %	25 %	110667020
94	NC_008212	ATCC	2	8	48709	48716	25 %	25 %	0 %	50 %	110667020
95	NC_008212	TTCA	2	8	49036	49043	25 %	50 %	0 %	25 %	110667020
96	NC_008212	AATG	2	8	49507	49514	50 %	25 %	25 %	0 %	110667021
97	NC_008212	GTCC	2	8	49952	49959	0 %	25 %	25 %	50 %	110667021
98	NC_008212	CATG	2	8	49996	50003	25 %	25 %	25 %	25 %	110667021
99	NC_008212	CCCG	2	8	51142	51149	0 %	0 %	25 %	75 %	110667022
100	NC_008212	GCTC	2	8	53491	53498	0 %	25 %	25 %	50 %	110667023
101	NC_008212	TTGA	2	8	53754	53761	25 %	50 %	25 %	0 %	110667023
102	NC_008212	CTTG	2	8	54762	54769	0 %	50 %	25 %	25 %	110667024
103	NC_008212	ACTC	2	8	55673	55680	25 %	25 %	0 %	50 %	110667024
104	NC_008212	AGTT	2	8	56323	56330	25 %	50 %	25 %	0 %	110667025
105	NC_008212	GGTT	2	8	58033	58040	0 %	50 %	50 %	0 %	110667026
106	NC_008212	AATT	2	8	58340	58347	50 %	50 %	0 %	0 %	110667026
107	NC_008212	ACAG	2	8	58463	58470	50 %	0 %	25 %	25 %	110667026
108	NC_008212	CAGA	2	8	58661	58668	50 %	0 %	25 %	25 %	110667026
109	NC_008212	ATGG	2	8	58716	58723	25 %	25 %	50 %	0 %	110667026
110	NC_008212	CCAG	2	8	58782	58789	25 %	0 %	25 %	50 %	110667026
111	NC_008212	TCAC	2	8	58907	58914	25 %	25 %	0 %	50 %	110667026
112	NC_008212	GACT	2	8	60007	60014	25 %	25 %	25 %	25 %	110667027
113	NC_008212	TACA	2	8	60031	60038	50 %	25 %	0 %	25 %	110667027
114	NC_008212	CTAT	2	8	60174	60181	25 %	50 %	0 %	25 %	110667027
115	NC_008212	TCCA	2	8	60618	60625	25 %	25 %	0 %	50 %	110667027
116	NC_008212	GTCG	2	8	60644	60651	0 %	25 %	50 %	25 %	110667027
117	NC_008212	TTCA	2	8	61189	61196	25 %	50 %	0 %	25 %	110667027
118	NC_008212	ATGC	2	8	62942	62949	25 %	25 %	25 %	25 %	110667028
119	NC_008212	CATT	2	8	63044	63051	25 %	50 %	0 %	25 %	110667028
120	NC_008212	CGGT	2	8	63404	63411	0 %	25 %	50 %	25 %	110667028
121	NC_008212	ATCG	2	8	63589	63596	25 %	25 %	25 %	25 %	110667028
122	NC_008212	GACG	2	8	63852	63859	25 %	0 %	50 %	25 %	110667028
123	NC_008212	CGAG	2	8	63866	63873	25 %	0 %	50 %	25 %	110667028
124	NC_008212	CATC	2	8	63876	63883	25 %	25 %	0 %	50 %	110667028
125	NC_008212	GTCA	2	8	63884	63891	25 %	25 %	25 %	25 %	110667028
126	NC_008212	GTCG	2	8	63945	63952	0 %	25 %	50 %	25 %	110667028
127	NC_008212	AGTG	2	8	64089	64096	25 %	25 %	50 %	0 %	110667028
128	NC_008212	AACT	2	8	64750	64757	50 %	25 %	0 %	25 %	110667029
129	NC_008212	AGTG	2	8	64966	64973	25 %	25 %	50 %	0 %	110667029
130	NC_008212	TCCA	2	8	66532	66539	25 %	25 %	0 %	50 %	110667031
131	NC_008212	CCAT	2	8	66566	66573	25 %	25 %	0 %	50 %	110667031
132	NC_008212	CATG	2	8	66577	66584	25 %	25 %	25 %	25 %	110667031
133	NC_008212	CTGC	2	8	66704	66711	0 %	25 %	25 %	50 %	110667031
134	NC_008212	TTGT	2	8	75992	75999	0 %	75 %	25 %	0 %	110667033
135	NC_008212	TATT	2	8	77298	77305	25 %	75 %	0 %	0 %	110667034
136	NC_008212	GCTC	2	8	77336	77343	0 %	25 %	25 %	50 %	110667034
137	NC_008212	GTAT	2	8	77821	77828	25 %	50 %	25 %	0 %	110667034
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