MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790

Total Repeats: 9834

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008212	ATA	2	6	17	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008212	AAG	2	6	83	88	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008212	TCT	2	6	126	131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008212	ACA	2	6	150	155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008212	ACT	2	6	174	179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008212	TGA	2	6	350	355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008212	CAT	2	6	380	385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008212	TTG	2	6	494	499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008212	TAA	2	6	3324	3329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008212	CGT	2	6	3334	3339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008212	GAG	2	6	3401	3406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008212	TCT	2	6	3477	3482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008212	ATC	2	6	3487	3492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008212	ATC	2	6	3503	3508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008212	AAT	2	6	5246	5251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008212	GTG	2	6	5321	5326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008212	TAT	3	9	5900	5908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008212	ACG	2	6	5941	5946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008212	TAT	2	6	6160	6165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008212	ACA	2	6	7466	7471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008212	GCA	2	6	7575	7580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008212	AAT	2	6	7674	7679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008212	CAT	2	6	7714	7719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008212	CGA	2	6	7907	7912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008212	GGC	2	6	7914	7919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008212	CTG	2	6	8052	8057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008212	CAG	2	6	8147	8152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008212	TCC	2	6	8256	8261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_008212	GTA	2	6	8266	8271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008212	GGA	3	9	8380	8388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008212	ACT	2	6	8399	8404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008212	CAA	2	6	8416	8421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008212	TGT	2	6	8501	8506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008212	CGA	2	6	9228	9233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008212	ATT	2	6	9318	9323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008212	TGG	2	6	9393	9398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008212	ACT	2	6	9400	9405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008212	CTC	2	6	9428	9433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_008212	ATA	2	6	9443	9448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008212	ATT	2	6	9468	9473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008212	TCG	2	6	9477	9482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008212	TTG	2	6	12598	12603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008212	CGG	2	6	12630	12635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008212	TAC	2	6	12640	12645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008212	TCG	2	6	13047	13052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008212	ATT	2	6	13098	13103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008212	ATT	2	6	13165	13170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008212	ATT	2	6	13312	13317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008212	ACA	2	6	13335	13340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008212	GAG	2	6	15985	15990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008212	CCA	2	6	16041	16046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_008212	GGA	2	6	17465	17470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008212	CAA	2	6	17733	17738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008212	GAT	2	6	17796	17801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008212	GTG	2	6	17984	17989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008212	CAA	2	6	18002	18007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_008212	TTG	2	6	18015	18020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008212	CTC	2	6	18815	18820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_008212	TTA	2	6	19381	19386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008212	CTT	2	6	19525	19530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008212	CTT	2	6	19550	19555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008212	CTT	2	6	19589	19594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008212	ATC	2	6	19626	19631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008212	CGT	2	6	19691	19696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008212	CAC	2	6	19884	19889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_008212	TCG	2	6	19902	19907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008212	TGA	2	6	20212	20217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008212	TGT	2	6	21145	21150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008212	TCA	2	6	21211	21216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008212	ACA	2	6	21265	21270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008212	ACT	2	6	21324	21329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008212	CTG	2	6	21490	21495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008212	TTC	2	6	21529	21534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_008212	GAT	2	6	21557	21562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008212	ATA	2	6	21712	21717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008212	AAG	2	6	21768	21773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008212	TAT	2	6	21802	21807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008212	CAC	2	6	23823	23828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_008212	TGA	2	6	26450	26455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008212	ACT	2	6	27568	27573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008212	AGC	2	6	27599	27604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008212	CAA	2	6	27624	27629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008212	TTC	2	6	27706	27711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008212	TCC	2	6	27742	27747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_008212	ATA	2	6	27891	27896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008212	AAC	2	6	28081	28086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_008212	CTA	2	6	28168	28173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008212	TGG	2	6	28174	28179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008212	GCC	2	6	28210	28215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_008212	CTC	2	6	28228	28233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_008212	CCG	2	6	28363	28368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_008212	ATC	2	6	28519	28524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008212	TGT	2	6	30170	30175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008212	ATT	2	6	31692	31697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008212	ACC	2	6	31735	31740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_008212	ATA	2	6	31809	31814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008212	GAT	2	6	33017	33022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008212	CTG	2	6	33778	33783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008212	ATT	2	6	33799	33804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008212	AAT	2	6	33871	33876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008212	GAG	2	6	34394	34399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008212	ATA	2	6	35645	35650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008212	TAT	2	6	35652	35657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008212	AGT	2	6	35673	35678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008212	TAG	2	6	35723	35728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008212	CTC	2	6	35789	35794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_008212	CAC	2	6	35971	35976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_008212	CAT	2	6	35983	35988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_008212	CAT	3	9	36742	36750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008212	CCT	2	6	37632	37637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_008212	CAT	2	6	39350	39355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_008212	ATC	2	6	40762	40767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008212	GCT	2	6	42675	42680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008212	ACT	2	6	42698	42703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008212	GTT	2	6	42731	42736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008212	CTG	2	6	43708	43713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_008212	CTT	2	6	43746	43751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008212	ATA	2	6	44281	44286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008212	AAT	2	6	44318	44323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008212	ATA	2	6	44328	44333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008212	GTA	2	6	44605	44610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008212	TAT	3	9	45337	45345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008212	TTA	2	6	45386	45391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008212	TGT	2	6	45849	45854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008212	AAC	2	6	45940	45945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_008212	CAC	2	6	45996	46001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_008212	CAT	2	6	47305	47310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008212	GAG	2	6	47498	47503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008212	TTC	2	6	49236	49241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008212	CAA	2	6	50054	50059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_008212	TAT	2	6	50102	50107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008212	ATT	2	6	50124	50129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008212	ACA	2	6	50248	50253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_008212	CAG	2	6	50305	50310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_008212	TGG	2	6	50387	50392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008212	CGG	2	6	50505	50510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_008212	GAG	2	6	50560	50565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008212	TGA	2	6	50594	50599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008212	ACG	2	6	53873	53878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_008212	TAT	2	6	53941	53946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008212	CAC	3	9	53955	53963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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