MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Roseobacter denitrificans OCh 114 chromosome

Total Repeats: 54144

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008209	TAG	2	6	80	85	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008209	GAA	2	6	290	295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008209	ATG	2	6	297	302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008209	ACG	2	6	458	463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008209	CAC	2	6	494	499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_008209	GAT	2	6	532	537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008209	ACA	2	6	615	620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008209	GCC	2	6	624	629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_008209	CCG	2	6	735	740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_008209	GGA	2	6	843	848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008209	GCA	2	6	1014	1019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008209	CCA	2	6	1028	1033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_008209	GCC	2	6	1140	1145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_008209	CGC	2	6	1208	1213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_008209	CCA	2	6	1271	1276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_008209	TCA	2	6	1327	1332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008209	TAA	2	6	1425	1430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008209	TAT	2	6	1502	1507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008209	AGA	2	6	1702	1707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008209	CGG	2	6	1773	1778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677422
21	NC_008209	AAG	2	6	1900	1905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110677422
22	NC_008209	CCA	2	6	1949	1954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110677422
23	NC_008209	CGA	2	6	2028	2033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677422
24	NC_008209	AAC	2	6	2059	2064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110677422
25	NC_008209	GCC	2	6	2113	2118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677422
26	NC_008209	GAT	2	6	2136	2141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677422
27	NC_008209	GAC	2	6	2146	2151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677422
28	NC_008209	CAT	2	6	2241	2246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677422
29	NC_008209	CTG	2	6	2416	2421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677422
30	NC_008209	CTG	2	6	2437	2442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677422
31	NC_008209	GCC	2	6	2488	2493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677422
32	NC_008209	CCG	2	6	2633	2638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677422
33	NC_008209	GCA	2	6	2943	2948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677423
34	NC_008209	GCC	2	6	2982	2987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677423
35	NC_008209	CGC	2	6	3006	3011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677423
36	NC_008209	CCG	2	6	3220	3225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677423
37	NC_008209	TGA	2	6	3408	3413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677423
38	NC_008209	ATT	2	6	3465	3470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110677423
39	NC_008209	GCC	2	6	3482	3487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677423
40	NC_008209	GCC	2	6	3559	3564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677424
41	NC_008209	CGC	2	6	3658	3663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677424
42	NC_008209	CGT	2	6	3705	3710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677424
43	NC_008209	CGG	2	6	3767	3772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677424
44	NC_008209	CGA	2	6	3804	3809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677424
45	NC_008209	GAT	2	6	3963	3968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677424
46	NC_008209	GAT	2	6	4090	4095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677424
47	NC_008209	CGG	2	6	4169	4174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677424
48	NC_008209	CCG	2	6	4199	4204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677424
49	NC_008209	GAA	2	6	4240	4245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110677424
50	NC_008209	CTG	2	6	4330	4335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677424
51	NC_008209	GCG	2	6	4352	4357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677424
52	NC_008209	CGG	2	6	4380	4385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677424
53	NC_008209	AAG	3	9	4457	4465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110677424
54	NC_008209	CGA	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677425
55	NC_008209	AGC	2	6	4675	4680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677425
56	NC_008209	CGG	2	6	4685	4690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677425
57	NC_008209	GGA	2	6	4775	4780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110677425
58	NC_008209	CAA	2	6	4916	4921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110677425
59	NC_008209	ACG	2	6	5070	5075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677425
60	NC_008209	CAG	2	6	5196	5201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677425
61	NC_008209	CGG	2	6	5214	5219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677425
62	NC_008209	GAC	2	6	5294	5299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677425
63	NC_008209	GCT	2	6	5381	5386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677425
64	NC_008209	GCC	2	6	5446	5451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677425
65	NC_008209	GAC	2	6	5550	5555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677425
66	NC_008209	TGA	2	6	5883	5888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677426
67	NC_008209	ATT	2	6	5914	5919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110677426
68	NC_008209	ACA	2	6	6126	6131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110677426
69	NC_008209	TTC	2	6	6241	6246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110677426
70	NC_008209	ATG	2	6	6305	6310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677426
71	NC_008209	CCA	2	6	6438	6443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110677427
72	NC_008209	AAC	2	6	6576	6581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110677427
73	NC_008209	GCG	2	6	6718	6723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677427
74	NC_008209	GCG	2	6	6759	6764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677427
75	NC_008209	GCG	2	6	6786	6791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677427
76	NC_008209	CGG	2	6	6843	6848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677427
77	NC_008209	GCC	4	12	6917	6928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677427
78	NC_008209	GAT	2	6	7009	7014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677427
79	NC_008209	GCG	2	6	7202	7207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677427
80	NC_008209	CGA	2	6	7218	7223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677427
81	NC_008209	GGC	2	6	7249	7254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677427
82	NC_008209	GGC	2	6	7297	7302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677427
83	NC_008209	GCA	2	6	7460	7465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008209	GCG	2	6	7547	7552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677428
85	NC_008209	ATG	2	6	7573	7578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677428
86	NC_008209	TGC	2	6	7797	7802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677428
87	NC_008209	ATC	2	6	7859	7864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677428
88	NC_008209	CTG	2	6	7962	7967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677428
89	NC_008209	GAC	2	6	8138	8143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677429
90	NC_008209	GGC	2	6	8291	8296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677429
91	NC_008209	CGG	2	6	8332	8337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677429
92	NC_008209	CGC	2	6	8507	8512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677429
93	NC_008209	GGT	2	6	8822	8827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110677429
94	NC_008209	GTG	2	6	8913	8918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110677429
95	NC_008209	ACG	2	6	8922	8927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677429
96	NC_008209	TCC	2	6	8934	8939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110677429
97	NC_008209	CAT	2	6	8959	8964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677429
98	NC_008209	GCA	2	6	8986	8991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677429
99	NC_008209	CGA	2	6	9220	9225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677429
100	NC_008209	ATG	2	6	9393	9398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677429
101	NC_008209	CGT	2	6	9449	9454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677429
102	NC_008209	CTG	2	6	9530	9535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677429
103	NC_008209	CGG	2	6	9601	9606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677429
104	NC_008209	CCG	2	6	9718	9723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677429
105	NC_008209	GCC	2	6	9762	9767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677429
106	NC_008209	TCG	2	6	9771	9776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677429
107	NC_008209	GCC	2	6	9787	9792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677429
108	NC_008209	ACC	2	6	9830	9835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110677429
109	NC_008209	GAC	2	6	9929	9934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677429
110	NC_008209	CGC	2	6	9937	9942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677429
111	NC_008209	CCG	2	6	10030	10035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677429
112	NC_008209	CGT	3	9	10045	10053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677429
113	NC_008209	ATG	2	6	10131	10136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677429
114	NC_008209	GTT	2	6	10148	10153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110677429
115	NC_008209	GAT	2	6	10258	10263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677429
116	NC_008209	TGC	2	6	10318	10323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677429
117	NC_008209	GCG	2	6	10494	10499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677429
118	NC_008209	AGA	2	6	10530	10535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110677429
119	NC_008209	CGG	2	6	10600	10605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677429
120	NC_008209	CGG	2	6	10608	10613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677429
121	NC_008209	TGT	2	6	10784	10789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110677429
122	NC_008209	CGG	2	6	10858	10863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677429
123	NC_008209	TGG	2	6	10993	10998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110677429
124	NC_008209	CCG	2	6	11016	11021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677429
125	NC_008209	GTG	3	9	11105	11113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110677430
126	NC_008209	CAC	2	6	11122	11127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110677430
127	NC_008209	CCG	2	6	11178	11183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677430
128	NC_008209	CGT	2	6	11226	11231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677430
129	NC_008209	ACG	2	6	11259	11264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677430
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131	NC_008209	AAT	2	6	11320	11325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110677430
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