MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Roseobacter denitrificans OCh 114 chromosome

Total Repeats: 49674

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008209	CGG	2	6	1773	1778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677422
2	NC_008209	AAG	2	6	1900	1905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110677422
3	NC_008209	CCA	2	6	1949	1954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110677422
4	NC_008209	CGA	2	6	2028	2033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677422
5	NC_008209	AAC	2	6	2059	2064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110677422
6	NC_008209	GCC	2	6	2113	2118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677422
7	NC_008209	GAT	2	6	2136	2141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677422
8	NC_008209	GAC	2	6	2146	2151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677422
9	NC_008209	CAT	2	6	2241	2246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677422
10	NC_008209	CTG	2	6	2416	2421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677422
11	NC_008209	CTG	2	6	2437	2442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677422
12	NC_008209	GCC	2	6	2488	2493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677422
13	NC_008209	CCG	2	6	2633	2638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677422
14	NC_008209	GCA	2	6	2943	2948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677423
15	NC_008209	GCC	2	6	2982	2987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677423
16	NC_008209	CGC	2	6	3006	3011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677423
17	NC_008209	CCG	2	6	3220	3225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677423
18	NC_008209	TGA	2	6	3408	3413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677423
19	NC_008209	ATT	2	6	3465	3470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110677423
20	NC_008209	GCC	2	6	3482	3487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677423
21	NC_008209	GCC	2	6	3559	3564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677424
22	NC_008209	CGC	2	6	3658	3663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677424
23	NC_008209	CGT	2	6	3705	3710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677424
24	NC_008209	CGG	2	6	3767	3772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677424
25	NC_008209	CGA	2	6	3804	3809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677424
26	NC_008209	GAT	2	6	3963	3968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677424
27	NC_008209	GAT	2	6	4090	4095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677424
28	NC_008209	CGG	2	6	4169	4174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677424
29	NC_008209	CCG	2	6	4199	4204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677424
30	NC_008209	GAA	2	6	4240	4245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110677424
31	NC_008209	CTG	2	6	4330	4335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677424
32	NC_008209	GCG	2	6	4352	4357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677424
33	NC_008209	CGG	2	6	4380	4385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677424
34	NC_008209	AAG	3	9	4457	4465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110677424
35	NC_008209	CGA	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677425
36	NC_008209	AGC	2	6	4675	4680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677425
37	NC_008209	CGG	2	6	4685	4690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677425
38	NC_008209	GGA	2	6	4775	4780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110677425
39	NC_008209	CAA	2	6	4916	4921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110677425
40	NC_008209	ACG	2	6	5070	5075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677425
41	NC_008209	CAG	2	6	5196	5201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677425
42	NC_008209	CGG	2	6	5214	5219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677425
43	NC_008209	GAC	2	6	5294	5299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677425
44	NC_008209	GCT	2	6	5381	5386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677425
45	NC_008209	GCC	2	6	5446	5451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677425
46	NC_008209	GAC	2	6	5550	5555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677425
47	NC_008209	TGA	2	6	5883	5888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677426
48	NC_008209	ATT	2	6	5914	5919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110677426
49	NC_008209	ACA	2	6	6126	6131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110677426
50	NC_008209	TTC	2	6	6241	6246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110677426
51	NC_008209	ATG	2	6	6305	6310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677426
52	NC_008209	CCA	2	6	6438	6443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110677427
53	NC_008209	AAC	2	6	6576	6581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110677427
54	NC_008209	GCG	2	6	6718	6723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677427
55	NC_008209	GCG	2	6	6759	6764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677427
56	NC_008209	GCG	2	6	6786	6791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677427
57	NC_008209	CGG	2	6	6843	6848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677427
58	NC_008209	GCC	4	12	6917	6928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677427
59	NC_008209	GAT	2	6	7009	7014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677427
60	NC_008209	GCG	2	6	7202	7207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677427
61	NC_008209	CGA	2	6	7218	7223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677427
62	NC_008209	GGC	2	6	7249	7254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677427
63	NC_008209	GGC	2	6	7297	7302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677427
64	NC_008209	GCG	2	6	7547	7552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677428
65	NC_008209	ATG	2	6	7573	7578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677428
66	NC_008209	TGC	2	6	7797	7802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677428
67	NC_008209	ATC	2	6	7859	7864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677428
68	NC_008209	CTG	2	6	7962	7967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677428
69	NC_008209	GAC	2	6	8138	8143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677429
70	NC_008209	GGC	2	6	8291	8296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677429
71	NC_008209	CGG	2	6	8332	8337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677429
72	NC_008209	CGC	2	6	8507	8512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677429
73	NC_008209	GGT	2	6	8822	8827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110677429
74	NC_008209	GTG	2	6	8913	8918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110677429
75	NC_008209	ACG	2	6	8922	8927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677429
76	NC_008209	TCC	2	6	8934	8939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110677429
77	NC_008209	CAT	2	6	8959	8964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677429
78	NC_008209	GCA	2	6	8986	8991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677429
79	NC_008209	CGA	2	6	9220	9225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677429
80	NC_008209	ATG	2	6	9393	9398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677429
81	NC_008209	CGT	2	6	9449	9454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677429
82	NC_008209	CTG	2	6	9530	9535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677429
83	NC_008209	CGG	2	6	9601	9606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677429
84	NC_008209	CCG	2	6	9718	9723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677429
85	NC_008209	GCC	2	6	9762	9767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677429
86	NC_008209	TCG	2	6	9771	9776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677429
87	NC_008209	GCC	2	6	9787	9792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677429
88	NC_008209	ACC	2	6	9830	9835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110677429
89	NC_008209	GAC	2	6	9929	9934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677429
90	NC_008209	CGC	2	6	9937	9942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677429
91	NC_008209	CCG	2	6	10030	10035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677429
92	NC_008209	CGT	3	9	10045	10053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677429
93	NC_008209	ATG	2	6	10131	10136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677429
94	NC_008209	GTT	2	6	10148	10153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110677429
95	NC_008209	GAT	2	6	10258	10263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677429
96	NC_008209	TGC	2	6	10318	10323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677429
97	NC_008209	GCG	2	6	10494	10499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677429
98	NC_008209	AGA	2	6	10530	10535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110677429
99	NC_008209	CGG	2	6	10600	10605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677429
100	NC_008209	CGG	2	6	10608	10613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677429
101	NC_008209	TGT	2	6	10784	10789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110677429
102	NC_008209	CGG	2	6	10858	10863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677429
103	NC_008209	TGG	2	6	10993	10998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110677429
104	NC_008209	CCG	2	6	11016	11021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677429
105	NC_008209	GTG	3	9	11105	11113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110677430
106	NC_008209	CAC	2	6	11122	11127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110677430
107	NC_008209	CCG	2	6	11178	11183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677430
108	NC_008209	CGT	2	6	11226	11231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677430
109	NC_008209	ACG	2	6	11259	11264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677430
110	NC_008209	GCG	2	6	11288	11293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677430
111	NC_008209	AAT	2	6	11320	11325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110677430
112	NC_008209	TCG	2	6	11375	11380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677431
113	NC_008209	CAG	2	6	11449	11454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677431
114	NC_008209	CAC	2	6	11504	11509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110677431
115	NC_008209	GAT	2	6	11548	11553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677431
116	NC_008209	ATG	2	6	11579	11584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677431
117	NC_008209	GCA	2	6	11784	11789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677431
118	NC_008209	GCA	2	6	11820	11825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677431
119	NC_008209	GAT	2	6	11876	11881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677431
120	NC_008209	GAT	2	6	11989	11994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677431
121	NC_008209	CTG	2	6	12004	12009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677431
122	NC_008209	CCG	2	6	12012	12017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677431
123	NC_008209	CAT	2	6	12042	12047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677431
124	NC_008209	GCT	2	6	12129	12134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677431
125	NC_008209	CAG	2	6	12151	12156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677431
126	NC_008209	ATC	2	6	12179	12184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677431
127	NC_008209	CGG	2	6	12194	12199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677431
128	NC_008209	AAG	2	6	12337	12342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110677431
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133	NC_008209	GAT	2	6	12481	12486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677431
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246	NC_008209	AAC	2	6	20057	20062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110677436
247	NC_008209	CGC	2	6	20069	20074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677436
248	NC_008209	ATA	2	6	20080	20085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110677436
249	NC_008209	AGG	2	6	20103	20108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110677436
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251	NC_008209	GCA	2	6	20216	20221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677437
252	NC_008209	GCC	2	6	20222	20227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677437
253	NC_008209	TGG	2	6	20233	20238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110677437
254	NC_008209	CGG	2	6	20242	20247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677437
255	NC_008209	GCC	2	6	20372	20377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677437
256	NC_008209	TGC	2	6	20563	20568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677437
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276	NC_008209	GCA	2	6	21582	21587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677438
277	NC_008209	GCC	2	6	21590	21595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677438
278	NC_008209	TCC	2	6	21821	21826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110677438
279	NC_008209	CTC	2	6	22078	22083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110677438
280	NC_008209	ATC	2	6	22090	22095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677438
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283	NC_008209	GCG	2	6	22303	22308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677438
284	NC_008209	CGC	2	6	22380	22385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677438
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289	NC_008209	TCC	2	6	22616	22621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110677438
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370	NC_008209	GGT	2	6	30214	30219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110677449
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372	NC_008209	TGC	2	6	30607	30612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677449
373	NC_008209	TGT	2	6	30636	30641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110677449
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375	NC_008209	GCA	2	6	30808	30813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677450
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499	NC_008209	CCG	3	9	40174	40182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677458
500	NC_008209	CAC	2	6	40262	40267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110677458

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