MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 2759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008148	GCAGA	2	10	4	13	40 %	0 %	40 %	20 %	108802857
2	NC_008148	GCTCC	2	10	2146	2155	0 %	20 %	20 %	60 %	108802858
3	NC_008148	CCCGT	2	10	2304	2313	0 %	20 %	20 %	60 %	108802858
4	NC_008148	CCCGG	2	10	2440	2449	0 %	0 %	40 %	60 %	108802858
5	NC_008148	GCAGG	2	10	5786	5795	20 %	0 %	60 %	20 %	108802861
6	NC_008148	GGGCC	2	10	8430	8439	0 %	0 %	60 %	40 %	108802862
7	NC_008148	GACGG	2	10	9203	9212	20 %	0 %	60 %	20 %	108802863
8	NC_008148	CGCCC	2	10	9594	9603	0 %	0 %	20 %	80 %	108802863
9	NC_008148	CGTCA	2	10	11490	11499	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_008148	CGGCC	2	10	11755	11764	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11	NC_008148	AAAGA	2	10	15236	15245	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008148	CGGCG	2	10	17116	17125	0 %	0 %	60 %	40 %	108802872
13	NC_008148	CGCCC	2	10	19114	19123	0 %	0 %	20 %	80 %	108802875
14	NC_008148	GCCGG	2	10	19557	19566	0 %	0 %	60 %	40 %	108802875
15	NC_008148	GGGAG	2	10	23776	23785	20 %	0 %	80 %	0 %	108802878
16	NC_008148	CGGGG	2	10	24781	24790	0 %	0 %	80 %	20 %	108802878
17	NC_008148	GACCG	2	10	25861	25870	20 %	0 %	40 %	40 %	108802879
18	NC_008148	GGGGA	2	10	25880	25889	20 %	0 %	80 %	0 %	108802879
19	NC_008148	AGCAC	2	10	27057	27066	40 %	0 %	20 %	40 %	108802880
20	NC_008148	CGTCT	2	10	27523	27532	0 %	40 %	20 %	40 %	108802880
21	NC_008148	GCCGG	2	10	27957	27966	0 %	0 %	60 %	40 %	108802881
22	NC_008148	GCCCC	2	10	29075	29084	0 %	0 %	20 %	80 %	108802883
23	NC_008148	GCGCC	2	10	30791	30800	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
24	NC_008148	GCCAG	2	10	31630	31639	20 %	0 %	40 %	40 %	108802884
25	NC_008148	CTCGA	2	10	32720	32729	20 %	20 %	20 %	40 %	108802886
26	NC_008148	GGGCG	2	10	34798	34807	0 %	0 %	80 %	20 %	108802889
27	NC_008148	GCGCC	2	10	34861	34870	0 %	0 %	40 %	60 %	108802889
28	NC_008148	GGCGG	2	10	36061	36070	0 %	0 %	80 %	20 %	108802890
29	NC_008148	GCCTC	2	10	36674	36683	0 %	20 %	20 %	60 %	108802890
30	NC_008148	GAGGG	2	10	36766	36775	20 %	0 %	80 %	0 %	108802890
31	NC_008148	GGCCC	2	10	37295	37304	0 %	0 %	40 %	60 %	108802891
32	NC_008148	CGCCC	2	10	41742	41751	0 %	0 %	20 %	80 %	108802895
33	NC_008148	GGTGG	2	10	41979	41988	0 %	20 %	80 %	0 %	108802895
34	NC_008148	CGGGA	2	10	42704	42713	20 %	0 %	60 %	20 %	108802896
35	NC_008148	ACAGG	2	10	42850	42859	40 %	0 %	40 %	20 %	108802896
36	NC_008148	GCAGG	2	10	43343	43352	20 %	0 %	60 %	20 %	108802897
37	NC_008148	GGCGG	2	10	45181	45190	0 %	0 %	80 %	20 %	108802899
38	NC_008148	AAAGG	2	10	46133	46142	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008148	CCACC	2	10	49624	49633	20 %	0 %	0 %	80 %	108802905
40	NC_008148	CGCCC	2	10	51876	51885	0 %	0 %	20 %	80 %	108802906
41	NC_008148	CCGGG	2	10	52313	52322	0 %	0 %	60 %	40 %	108802906
42	NC_008148	TACGG	2	10	53619	53628	20 %	20 %	40 %	20 %	108802907
43	NC_008148	GCGAC	2	10	53686	53695	20 %	0 %	40 %	40 %	108802907
44	NC_008148	GCGCC	2	10	53875	53884	0 %	0 %	40 %	60 %	108802908
45	NC_008148	CGCGG	2	10	54987	54996	0 %	0 %	60 %	40 %	108802909
46	NC_008148	CCGGC	2	10	55590	55599	0 %	0 %	40 %	60 %	108802909
47	NC_008148	GCGAG	2	10	55748	55757	20 %	0 %	60 %	20 %	108802910
48	NC_008148	GACGG	2	10	55984	55993	20 %	0 %	60 %	20 %	108802910
49	NC_008148	GCCGC	2	10	58038	58047	0 %	0 %	40 %	60 %	108802912
50	NC_008148	CGGCG	2	10	58574	58583	0 %	0 %	60 %	40 %	108802912
51	NC_008148	CGAGC	2	10	58692	58701	20 %	0 %	40 %	40 %	108802913
52	NC_008148	GGGGA	2	10	59922	59931	20 %	0 %	80 %	0 %	108802914
53	NC_008148	AGGGG	2	10	61891	61900	20 %	0 %	80 %	0 %	108802915
54	NC_008148	CGGCG	2	10	62117	62126	0 %	0 %	60 %	40 %	108802916
55	NC_008148	CGGCG	2	10	62699	62708	0 %	0 %	60 %	40 %	108802916
56	NC_008148	GGGCC	2	10	62852	62861	0 %	0 %	60 %	40 %	108802916
57	NC_008148	GCCGC	2	10	64267	64276	0 %	0 %	40 %	60 %	108802918
58	NC_008148	CACCC	2	10	64735	64744	20 %	0 %	0 %	80 %	108802918
59	NC_008148	GGGAG	2	10	65769	65778	20 %	0 %	80 %	0 %	108802919
60	NC_008148	CGGGG	2	10	66081	66090	0 %	0 %	80 %	20 %	108802919
61	NC_008148	GCCGC	2	10	68085	68094	0 %	0 %	40 %	60 %	108802922
62	NC_008148	CGCGC	2	10	69816	69825	0 %	0 %	40 %	60 %	108802924
63	NC_008148	CCCGG	2	10	71970	71979	0 %	0 %	40 %	60 %	108802926
64	NC_008148	CCGGG	2	10	72245	72254	0 %	0 %	60 %	40 %	108802926
65	NC_008148	GCGCC	2	10	72326	72335	0 %	0 %	40 %	60 %	108802926
66	NC_008148	TCTCT	2	10	74580	74589	0 %	60 %	0 %	40 %	108802927
67	NC_008148	TGCGC	2	10	76184	76193	0 %	20 %	40 %	40 %	108802928
68	NC_008148	AGCGG	2	10	79331	79340	20 %	0 %	60 %	20 %	108802931
69	NC_008148	CCGGG	2	10	82323	82332	0 %	0 %	60 %	40 %	108802934
70	NC_008148	AACGC	2	10	83472	83481	40 %	0 %	20 %	40 %	108802935
71	NC_008148	CGCCC	2	10	83533	83542	0 %	0 %	20 %	80 %	108802935
72	NC_008148	CGGGA	2	10	83549	83558	20 %	0 %	60 %	20 %	108802935
73	NC_008148	CGGGC	2	10	84225	84234	0 %	0 %	60 %	40 %	108802936
74	NC_008148	GCGGG	2	10	84547	84556	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
75	NC_008148	CCACC	2	10	85573	85582	20 %	0 %	0 %	80 %	108802937
76	NC_008148	TCCCC	2	10	85662	85671	0 %	20 %	0 %	80 %	108802937
77	NC_008148	CTGCT	2	10	85694	85703	0 %	40 %	20 %	40 %	108802937
78	NC_008148	TCGCC	2	10	86112	86121	0 %	20 %	20 %	60 %	108802937
79	NC_008148	GGCCG	2	10	87417	87426	0 %	0 %	60 %	40 %	108802939
80	NC_008148	GCGGG	2	10	87935	87944	0 %	0 %	80 %	20 %	108802940
81	NC_008148	CGGGA	2	10	89622	89631	20 %	0 %	60 %	20 %	108802941
82	NC_008148	GAGCG	2	10	89869	89878	20 %	0 %	60 %	20 %	108802942
83	NC_008148	CGGCG	2	10	90516	90525	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
84	NC_008148	CGCGG	2	10	92814	92823	0 %	0 %	60 %	40 %	108802945
85	NC_008148	GCGGG	2	10	93286	93295	0 %	0 %	80 %	20 %	108802945
86	NC_008148	GGAGG	2	10	94027	94036	20 %	0 %	80 %	0 %	108802946
87	NC_008148	GACCT	2	10	97838	97847	20 %	20 %	20 %	40 %	108802948
88	NC_008148	CCGGG	2	10	99122	99131	0 %	0 %	60 %	40 %	108802949
89	NC_008148	GCCGG	2	10	102193	102202	0 %	0 %	60 %	40 %	108802953
90	NC_008148	GCGCC	2	10	102691	102700	0 %	0 %	40 %	60 %	108802953
91	NC_008148	GGCCG	2	10	102906	102915	0 %	0 %	60 %	40 %	108802953
92	NC_008148	CTCGC	2	10	103548	103557	0 %	20 %	20 %	60 %	108802954
93	NC_008148	GGGAC	2	10	104149	104158	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
94	NC_008148	TGCCG	2	10	105920	105929	0 %	20 %	40 %	40 %	108802956
95	NC_008148	CCTCC	2	10	106830	106839	0 %	20 %	0 %	80 %	108802956
96	NC_008148	AGGGG	2	10	109608	109617	20 %	0 %	80 %	0 %	108802957
97	NC_008148	CGGGG	2	10	111051	111060	0 %	0 %	80 %	20 %	108802959
98	NC_008148	CGACG	2	10	112469	112478	20 %	0 %	40 %	40 %	108802961
99	NC_008148	GGGAG	2	10	112796	112805	20 %	0 %	80 %	0 %	108802961
100	NC_008148	CGCCT	2	10	113193	113202	0 %	20 %	20 %	60 %	108802961
101	NC_008148	GCCGG	2	10	113370	113379	0 %	0 %	60 %	40 %	108802961
102	NC_008148	GCCGC	2	10	114548	114557	0 %	0 %	40 %	60 %	108802963
103	NC_008148	GGGGA	2	10	123143	123152	20 %	0 %	80 %	0 %	108802972
104	NC_008148	AGCCC	2	10	126896	126905	20 %	0 %	20 %	60 %	108802977
105	NC_008148	GCCCC	2	10	129989	129998	0 %	0 %	20 %	80 %	108802979
106	NC_008148	CGCCC	2	10	130246	130255	0 %	0 %	20 %	80 %	108802979
107	NC_008148	GAGGG	2	10	136323	136332	20 %	0 %	80 %	0 %	108802987
108	NC_008148	TGGCC	2	10	137311	137320	0 %	20 %	40 %	40 %	108802987
109	NC_008148	GGAGG	2	10	138159	138168	20 %	0 %	80 %	0 %	108802988
110	NC_008148	CGTGG	2	10	138321	138330	0 %	20 %	60 %	20 %	108802988
111	NC_008148	TCTCG	2	10	139958	139967	0 %	40 %	20 %	40 %	108802990
112	NC_008148	AGCCG	2	10	140354	140363	20 %	0 %	40 %	40 %	108802990
113	NC_008148	GCACC	2	10	140814	140823	20 %	0 %	20 %	60 %	108802990
114	NC_008148	GGAGG	2	10	145386	145395	20 %	0 %	80 %	0 %	108802994
115	NC_008148	CCGGG	2	10	145980	145989	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
116	NC_008148	GGGAA	2	10	146815	146824	40 %	0 %	60 %	0 %	108802996
117	NC_008148	CTCGC	2	10	147770	147779	0 %	20 %	20 %	60 %	108802997
118	NC_008148	TCCCC	2	10	150103	150112	0 %	20 %	0 %	80 %	108802999
119	NC_008148	CCCTC	2	10	150484	150493	0 %	20 %	0 %	80 %	108803000
120	NC_008148	GCGAG	2	10	152266	152275	20 %	0 %	60 %	20 %	108803000
121	NC_008148	CTCCG	2	10	154787	154796	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
122	NC_008148	CAGGC	2	10	154841	154850	20 %	0 %	40 %	40 %	108803003
123	NC_008148	GAAGG	2	10	155413	155422	40 %	0 %	60 %	0 %	108803003
124	NC_008148	GCCGC	2	10	156118	156127	0 %	0 %	40 %	60 %	108803003
125	NC_008148	GCGGG	2	10	156437	156446	0 %	0 %	80 %	20 %	108803003
126	NC_008148	CGGAG	2	10	158504	158513	20 %	0 %	60 %	20 %	108803005
127	NC_008148	GCCGG	2	10	158562	158571	0 %	0 %	60 %	40 %	108803005
128	NC_008148	CCGGG	2	10	160309	160318	0 %	0 %	60 %	40 %	108803007
129	NC_008148	TTGCG	2	10	160725	160734	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_008148	GTAGG	2	10	160960	160969	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008148	GGGCT	2	10	165031	165040	0 %	20 %	60 %	20 %	108803011
132	NC_008148	GGGCC	2	10	165234	165243	0 %	0 %	60 %	40 %	108803011
133	NC_008148	GGGGC	2	10	166311	166320	0 %	0 %	80 %	20 %	108803012
134	NC_008148	GGGGA	2	10	167606	167615	20 %	0 %	80 %	0 %	108803013
135	NC_008148	CCGGC	2	10	169308	169317	0 %	0 %	40 %	60 %	108803016
136	NC_008148	GCCGC	2	10	169480	169489	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
137	NC_008148	CCCGC	2	10	169594	169603	0 %	0 %	20 %	80 %	108803017
138	NC_008148	CCAGG	2	10	170019	170028	20 %	0 %	40 %	40 %	108803018
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141	NC_008148	CGGGC	2	10	173906	173915	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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247	NC_008148	TGCCC	2	10	275090	275099	0 %	20 %	20 %	60 %	108803119
248	NC_008148	CCTCC	2	10	280451	280460	0 %	20 %	0 %	80 %	108803122
249	NC_008148	GGTGG	2	10	280783	280792	0 %	20 %	80 %	0 %	108803123
250	NC_008148	TTTAC	2	10	281602	281611	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
251	NC_008148	CGAGG	2	10	282057	282066	20 %	0 %	60 %	20 %	108803124
252	NC_008148	GGGCA	2	10	287575	287584	20 %	0 %	60 %	20 %	108803129
253	NC_008148	CGCAG	2	10	287741	287750	20 %	0 %	40 %	40 %	108803129
254	NC_008148	GGCGA	2	10	287878	287887	20 %	0 %	60 %	20 %	108803129
255	NC_008148	AGGGC	2	10	288017	288026	20 %	0 %	60 %	20 %	108803129
256	NC_008148	TCGCC	2	10	288620	288629	0 %	20 %	20 %	60 %	108803129
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258	NC_008148	CCCGG	2	10	290279	290288	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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263	NC_008148	CGCGC	2	10	292836	292845	0 %	0 %	40 %	60 %	108803135
264	NC_008148	CCCGC	2	10	293696	293705	0 %	0 %	20 %	80 %	108803136
265	NC_008148	AGCCG	2	10	295347	295356	20 %	0 %	40 %	40 %	108803137
266	NC_008148	CGGGC	2	10	297263	297272	0 %	0 %	60 %	40 %	108803139
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268	NC_008148	CGGGA	2	10	299911	299920	20 %	0 %	60 %	20 %	108803143
269	NC_008148	GCAGC	2	10	300636	300645	20 %	0 %	40 %	40 %	108803143
270	NC_008148	GCCTG	2	10	301583	301592	0 %	20 %	40 %	40 %	108803143
271	NC_008148	GCGGG	2	10	302846	302855	0 %	0 %	80 %	20 %	108803144
272	NC_008148	ACCTC	2	10	303640	303649	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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393	NC_008148	GCAGC	2	10	442843	442852	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
394	NC_008148	GCCCG	2	10	443376	443385	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
395	NC_008148	GCCGC	2	10	443935	443944	0 %	0 %	40 %	60 %	108803261
396	NC_008148	CCGGC	2	10	444006	444015	0 %	0 %	40 %	60 %	108803261
397	NC_008148	CAGAT	2	10	446358	446367	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
398	NC_008148	GCTCG	2	10	446799	446808	0 %	20 %	40 %	40 %	108803263
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