MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 6642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008148	AG	3	6	166	171	50 %	0 %	50 %	0 %	108802857
2	NC_008148	GC	3	6	262	267	0 %	0 %	50 %	50 %	108802857
3	NC_008148	AG	3	6	1187	1192	50 %	0 %	50 %	0 %	108802857
4	NC_008148	CG	3	6	1531	1536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008148	AT	3	6	1810	1815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008148	CT	3	6	1982	1987	0 %	50 %	0 %	50 %	108802858
7	NC_008148	CT	3	6	2003	2008	0 %	50 %	0 %	50 %	108802858
8	NC_008148	GC	3	6	2063	2068	0 %	0 %	50 %	50 %	108802858
9	NC_008148	GC	3	6	3123	3128	0 %	0 %	50 %	50 %	108802859
10	NC_008148	GC	3	6	3770	3775	0 %	0 %	50 %	50 %	108802860
11	NC_008148	AG	3	6	3897	3902	50 %	0 %	50 %	0 %	108802860
12	NC_008148	CA	3	6	4395	4400	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008148	GA	3	6	4434	4439	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008148	GC	3	6	5631	5636	0 %	0 %	50 %	50 %	108802861
15	NC_008148	GC	3	6	5946	5951	0 %	0 %	50 %	50 %	108802861
16	NC_008148	GC	3	6	6760	6765	0 %	0 %	50 %	50 %	108802862
17	NC_008148	GC	3	6	7012	7017	0 %	0 %	50 %	50 %	108802862
18	NC_008148	CA	3	6	7124	7129	50 %	0 %	0 %	50 %	108802862
19	NC_008148	AG	4	8	7307	7314	50 %	0 %	50 %	0 %	108802862
20	NC_008148	GC	3	6	7497	7502	0 %	0 %	50 %	50 %	108802862
21	NC_008148	CG	4	8	7504	7511	0 %	0 %	50 %	50 %	108802862
22	NC_008148	CG	3	6	7599	7604	0 %	0 %	50 %	50 %	108802862
23	NC_008148	CG	3	6	8195	8200	0 %	0 %	50 %	50 %	108802862
24	NC_008148	GC	3	6	8742	8747	0 %	0 %	50 %	50 %	108802862
25	NC_008148	GC	3	6	9134	9139	0 %	0 %	50 %	50 %	108802863
26	NC_008148	CG	3	6	10016	10021	0 %	0 %	50 %	50 %	108802863
27	NC_008148	AG	3	6	11508	11513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008148	AG	3	6	11861	11866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008148	GA	3	6	11868	11873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008148	AG	3	6	12209	12214	50 %	0 %	50 %	0 %	108802866
31	NC_008148	GC	4	8	12227	12234	0 %	0 %	50 %	50 %	108802866
32	NC_008148	CG	3	6	12476	12481	0 %	0 %	50 %	50 %	108802866
33	NC_008148	AT	3	6	12568	12573	50 %	50 %	0 %	0 %	108802866
34	NC_008148	GC	3	6	13906	13911	0 %	0 %	50 %	50 %	108802867
35	NC_008148	GC	3	6	14206	14211	0 %	0 %	50 %	50 %	108802867
36	NC_008148	GC	3	6	15615	15620	0 %	0 %	50 %	50 %	108802869
37	NC_008148	CG	3	6	15797	15802	0 %	0 %	50 %	50 %	108802869
38	NC_008148	GC	3	6	16042	16047	0 %	0 %	50 %	50 %	108802870
39	NC_008148	TC	3	6	16443	16448	0 %	50 %	0 %	50 %	108802870
40	NC_008148	AG	3	6	16743	16748	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008148	CG	4	8	17128	17135	0 %	0 %	50 %	50 %	108802872
42	NC_008148	CG	3	6	17739	17744	0 %	0 %	50 %	50 %	108802872
43	NC_008148	CG	3	6	17997	18002	0 %	0 %	50 %	50 %	108802873
44	NC_008148	GC	3	6	20176	20181	0 %	0 %	50 %	50 %	108802875
45	NC_008148	CG	4	8	20557	20564	0 %	0 %	50 %	50 %	108802875
46	NC_008148	CT	3	6	20786	20791	0 %	50 %	0 %	50 %	108802875
47	NC_008148	CG	3	6	21345	21350	0 %	0 %	50 %	50 %	108802876
48	NC_008148	GC	3	6	21464	21469	0 %	0 %	50 %	50 %	108802876
49	NC_008148	AG	3	6	21579	21584	50 %	0 %	50 %	0 %	108802876
50	NC_008148	CT	3	6	25038	25043	0 %	50 %	0 %	50 %	108802878
51	NC_008148	TC	3	6	26533	26538	0 %	50 %	0 %	50 %	108802880
52	NC_008148	CT	3	6	28202	28207	0 %	50 %	0 %	50 %	108802882
53	NC_008148	CG	3	6	28448	28453	0 %	0 %	50 %	50 %	108802882
54	NC_008148	GA	3	6	28944	28949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008148	GC	3	6	29801	29806	0 %	0 %	50 %	50 %	108802883
56	NC_008148	GC	3	6	29970	29975	0 %	0 %	50 %	50 %	108802883
57	NC_008148	GC	3	6	31109	31114	0 %	0 %	50 %	50 %	108802884
58	NC_008148	GC	3	6	32037	32042	0 %	0 %	50 %	50 %	108802885
59	NC_008148	GC	3	6	32402	32407	0 %	0 %	50 %	50 %	108802886
60	NC_008148	GC	3	6	32687	32692	0 %	0 %	50 %	50 %	108802886
61	NC_008148	GC	3	6	33349	33354	0 %	0 %	50 %	50 %	108802887
62	NC_008148	GC	3	6	34835	34840	0 %	0 %	50 %	50 %	108802889
63	NC_008148	GC	3	6	35001	35006	0 %	0 %	50 %	50 %	108802889
64	NC_008148	CG	3	6	36008	36013	0 %	0 %	50 %	50 %	108802890
65	NC_008148	GC	3	6	36055	36060	0 %	0 %	50 %	50 %	108802890
66	NC_008148	GC	3	6	36329	36334	0 %	0 %	50 %	50 %	108802890
67	NC_008148	CG	4	8	36576	36583	0 %	0 %	50 %	50 %	108802890
68	NC_008148	GC	3	6	36603	36608	0 %	0 %	50 %	50 %	108802890
69	NC_008148	GA	3	6	37163	37168	50 %	0 %	50 %	0 %	108802891
70	NC_008148	CG	3	6	37952	37957	0 %	0 %	50 %	50 %	108802892
71	NC_008148	CG	3	6	39868	39873	0 %	0 %	50 %	50 %	108802893
72	NC_008148	CT	3	6	41058	41063	0 %	50 %	0 %	50 %	108802895
73	NC_008148	GC	3	6	42042	42047	0 %	0 %	50 %	50 %	108802895
74	NC_008148	GC	4	8	42556	42563	0 %	0 %	50 %	50 %	108802896
75	NC_008148	CG	3	6	43190	43195	0 %	0 %	50 %	50 %	108802897
76	NC_008148	GC	3	6	44273	44278	0 %	0 %	50 %	50 %	108802898
77	NC_008148	GC	3	6	44871	44876	0 %	0 %	50 %	50 %	108802899
78	NC_008148	GA	3	6	46120	46125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008148	CG	3	6	46679	46684	0 %	0 %	50 %	50 %	108802902
80	NC_008148	TC	3	6	46743	46748	0 %	50 %	0 %	50 %	108802902
81	NC_008148	CT	3	6	47125	47130	0 %	50 %	0 %	50 %	108802902
82	NC_008148	GC	3	6	47188	47193	0 %	0 %	50 %	50 %	108802902
83	NC_008148	GA	3	6	47492	47497	50 %	0 %	50 %	0 %	108802903
84	NC_008148	CG	3	6	47692	47697	0 %	0 %	50 %	50 %	108802903
85	NC_008148	GC	3	6	47911	47916	0 %	0 %	50 %	50 %	108802903
86	NC_008148	CG	3	6	48184	48189	0 %	0 %	50 %	50 %	108802903
87	NC_008148	CT	3	6	48296	48301	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_008148	GC	3	6	48323	48328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008148	AG	3	6	48383	48388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008148	CG	3	6	48854	48859	0 %	0 %	50 %	50 %	108802904
91	NC_008148	TC	3	6	49508	49513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_008148	CG	3	6	49598	49603	0 %	0 %	50 %	50 %	108802905
93	NC_008148	GC	3	6	49673	49678	0 %	0 %	50 %	50 %	108802905
94	NC_008148	CG	3	6	52584	52589	0 %	0 %	50 %	50 %	108802907
95	NC_008148	GC	3	6	53753	53758	0 %	0 %	50 %	50 %	108802907
96	NC_008148	CG	3	6	54018	54023	0 %	0 %	50 %	50 %	108802908
97	NC_008148	CG	3	6	54199	54204	0 %	0 %	50 %	50 %	108802908
98	NC_008148	GC	3	6	54484	54489	0 %	0 %	50 %	50 %	108802908
99	NC_008148	GC	3	6	54623	54628	0 %	0 %	50 %	50 %	108802908
100	NC_008148	GC	3	6	55015	55020	0 %	0 %	50 %	50 %	108802909
101	NC_008148	CG	3	6	55260	55265	0 %	0 %	50 %	50 %	108802909
102	NC_008148	GC	3	6	55527	55532	0 %	0 %	50 %	50 %	108802909
103	NC_008148	GA	3	6	56293	56298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008148	TA	3	6	56388	56393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008148	GC	3	6	57936	57941	0 %	0 %	50 %	50 %	108802912
106	NC_008148	AG	3	6	59156	59161	50 %	0 %	50 %	0 %	108802913
107	NC_008148	GC	4	8	59934	59941	0 %	0 %	50 %	50 %	108802914
108	NC_008148	GC	3	6	60308	60313	0 %	0 %	50 %	50 %	108802914
109	NC_008148	GC	3	6	60320	60325	0 %	0 %	50 %	50 %	108802914
110	NC_008148	CG	3	6	60358	60363	0 %	0 %	50 %	50 %	108802914
111	NC_008148	GC	3	6	61151	61156	0 %	0 %	50 %	50 %	108802915
112	NC_008148	GC	3	6	62921	62926	0 %	0 %	50 %	50 %	108802917
113	NC_008148	CG	3	6	63860	63865	0 %	0 %	50 %	50 %	108802917
114	NC_008148	GC	3	6	65286	65291	0 %	0 %	50 %	50 %	108802918
115	NC_008148	CA	4	8	65371	65378	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_008148	GA	3	6	65379	65384	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008148	GC	3	6	65867	65872	0 %	0 %	50 %	50 %	108802919
118	NC_008148	GC	4	8	66316	66323	0 %	0 %	50 %	50 %	108802920
119	NC_008148	GC	3	6	66420	66425	0 %	0 %	50 %	50 %	108802920
120	NC_008148	GC	3	6	67013	67018	0 %	0 %	50 %	50 %	108802920
121	NC_008148	TC	3	6	67200	67205	0 %	50 %	0 %	50 %	108802921
122	NC_008148	GC	3	6	67377	67382	0 %	0 %	50 %	50 %	108802921
123	NC_008148	GC	3	6	67703	67708	0 %	0 %	50 %	50 %	108802922
124	NC_008148	GC	3	6	67738	67743	0 %	0 %	50 %	50 %	108802922
125	NC_008148	TC	3	6	67786	67791	0 %	50 %	0 %	50 %	108802922
126	NC_008148	CG	3	6	68356	68361	0 %	0 %	50 %	50 %	108802922
127	NC_008148	GA	3	6	69653	69658	50 %	0 %	50 %	0 %	108802924
128	NC_008148	CG	3	6	70364	70369	0 %	0 %	50 %	50 %	108802925
129	NC_008148	CG	3	6	72514	72519	0 %	0 %	50 %	50 %	108802926
130	NC_008148	GC	3	6	73355	73360	0 %	0 %	50 %	50 %	108802926
131	NC_008148	CG	3	6	73554	73559	0 %	0 %	50 %	50 %	108802926
132	NC_008148	TC	3	6	74295	74300	0 %	50 %	0 %	50 %	108802927
133	NC_008148	CT	3	6	74890	74895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_008148	CT	3	6	75126	75131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_008148	CG	3	6	75700	75705	0 %	0 %	50 %	50 %	108802928
136	NC_008148	GC	3	6	76371	76376	0 %	0 %	50 %	50 %	108802929
137	NC_008148	GC	3	6	78105	78110	0 %	0 %	50 %	50 %	108802930
138	NC_008148	GC	3	6	81044	81049	0 %	0 %	50 %	50 %	108802932
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141	NC_008148	TC	3	6	82584	82589	0 %	50 %	0 %	50 %	108802934
142	NC_008148	GC	3	6	83302	83307	0 %	0 %	50 %	50 %	108802935
143	NC_008148	CG	3	6	83584	83589	0 %	0 %	50 %	50 %	108802935
144	NC_008148	GC	4	8	83625	83632	0 %	0 %	50 %	50 %	108802935
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