MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 5640

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008148	AG	3	6	166	171	50 %	0 %	50 %	0 %	108802857
2	NC_008148	GC	3	6	262	267	0 %	0 %	50 %	50 %	108802857
3	NC_008148	AG	3	6	1187	1192	50 %	0 %	50 %	0 %	108802857
4	NC_008148	CT	3	6	1982	1987	0 %	50 %	0 %	50 %	108802858
5	NC_008148	CT	3	6	2003	2008	0 %	50 %	0 %	50 %	108802858
6	NC_008148	GC	3	6	2063	2068	0 %	0 %	50 %	50 %	108802858
7	NC_008148	GC	3	6	3123	3128	0 %	0 %	50 %	50 %	108802859
8	NC_008148	GC	3	6	3770	3775	0 %	0 %	50 %	50 %	108802860
9	NC_008148	AG	3	6	3897	3902	50 %	0 %	50 %	0 %	108802860
10	NC_008148	GC	3	6	5631	5636	0 %	0 %	50 %	50 %	108802861
11	NC_008148	GC	3	6	5946	5951	0 %	0 %	50 %	50 %	108802861
12	NC_008148	GC	3	6	6760	6765	0 %	0 %	50 %	50 %	108802862
13	NC_008148	GC	3	6	7012	7017	0 %	0 %	50 %	50 %	108802862
14	NC_008148	CA	3	6	7124	7129	50 %	0 %	0 %	50 %	108802862
15	NC_008148	AG	4	8	7307	7314	50 %	0 %	50 %	0 %	108802862
16	NC_008148	GC	3	6	7497	7502	0 %	0 %	50 %	50 %	108802862
17	NC_008148	CG	4	8	7504	7511	0 %	0 %	50 %	50 %	108802862
18	NC_008148	CG	3	6	7599	7604	0 %	0 %	50 %	50 %	108802862
19	NC_008148	CG	3	6	8195	8200	0 %	0 %	50 %	50 %	108802862
20	NC_008148	GC	3	6	8742	8747	0 %	0 %	50 %	50 %	108802862
21	NC_008148	GC	3	6	9134	9139	0 %	0 %	50 %	50 %	108802863
22	NC_008148	CG	3	6	10016	10021	0 %	0 %	50 %	50 %	108802863
23	NC_008148	AG	3	6	12209	12214	50 %	0 %	50 %	0 %	108802866
24	NC_008148	GC	4	8	12227	12234	0 %	0 %	50 %	50 %	108802866
25	NC_008148	CG	3	6	12476	12481	0 %	0 %	50 %	50 %	108802866
26	NC_008148	AT	3	6	12568	12573	50 %	50 %	0 %	0 %	108802866
27	NC_008148	GC	3	6	13906	13911	0 %	0 %	50 %	50 %	108802867
28	NC_008148	GC	3	6	14206	14211	0 %	0 %	50 %	50 %	108802867
29	NC_008148	GC	3	6	15615	15620	0 %	0 %	50 %	50 %	108802869
30	NC_008148	CG	3	6	15797	15802	0 %	0 %	50 %	50 %	108802869
31	NC_008148	GC	3	6	16042	16047	0 %	0 %	50 %	50 %	108802870
32	NC_008148	TC	3	6	16443	16448	0 %	50 %	0 %	50 %	108802870
33	NC_008148	CG	4	8	17128	17135	0 %	0 %	50 %	50 %	108802872
34	NC_008148	CG	3	6	17739	17744	0 %	0 %	50 %	50 %	108802872
35	NC_008148	CG	3	6	17997	18002	0 %	0 %	50 %	50 %	108802873
36	NC_008148	GC	3	6	20176	20181	0 %	0 %	50 %	50 %	108802875
37	NC_008148	CG	4	8	20557	20564	0 %	0 %	50 %	50 %	108802875
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40	NC_008148	GC	3	6	21464	21469	0 %	0 %	50 %	50 %	108802876
41	NC_008148	AG	3	6	21579	21584	50 %	0 %	50 %	0 %	108802876
42	NC_008148	CT	3	6	25038	25043	0 %	50 %	0 %	50 %	108802878
43	NC_008148	TC	3	6	26533	26538	0 %	50 %	0 %	50 %	108802880
44	NC_008148	CT	3	6	28202	28207	0 %	50 %	0 %	50 %	108802882
45	NC_008148	CG	3	6	28448	28453	0 %	0 %	50 %	50 %	108802882
46	NC_008148	GC	3	6	29801	29806	0 %	0 %	50 %	50 %	108802883
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49	NC_008148	GC	3	6	32037	32042	0 %	0 %	50 %	50 %	108802885
50	NC_008148	GC	3	6	32402	32407	0 %	0 %	50 %	50 %	108802886
51	NC_008148	GC	3	6	32687	32692	0 %	0 %	50 %	50 %	108802886
52	NC_008148	GC	3	6	33349	33354	0 %	0 %	50 %	50 %	108802887
53	NC_008148	GC	3	6	34835	34840	0 %	0 %	50 %	50 %	108802889
54	NC_008148	GC	3	6	35001	35006	0 %	0 %	50 %	50 %	108802889
55	NC_008148	CG	3	6	36008	36013	0 %	0 %	50 %	50 %	108802890
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60	NC_008148	GA	3	6	37163	37168	50 %	0 %	50 %	0 %	108802891
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62	NC_008148	CG	3	6	39868	39873	0 %	0 %	50 %	50 %	108802893
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64	NC_008148	GC	3	6	42042	42047	0 %	0 %	50 %	50 %	108802895
65	NC_008148	GC	4	8	42556	42563	0 %	0 %	50 %	50 %	108802896
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68	NC_008148	GC	3	6	44871	44876	0 %	0 %	50 %	50 %	108802899
69	NC_008148	CG	3	6	46679	46684	0 %	0 %	50 %	50 %	108802902
70	NC_008148	TC	3	6	46743	46748	0 %	50 %	0 %	50 %	108802902
71	NC_008148	CT	3	6	47125	47130	0 %	50 %	0 %	50 %	108802902
72	NC_008148	GC	3	6	47188	47193	0 %	0 %	50 %	50 %	108802902
73	NC_008148	GA	3	6	47492	47497	50 %	0 %	50 %	0 %	108802903
74	NC_008148	CG	3	6	47692	47697	0 %	0 %	50 %	50 %	108802903
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102	NC_008148	GC	3	6	67013	67018	0 %	0 %	50 %	50 %	108802920
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104	NC_008148	GC	3	6	67377	67382	0 %	0 %	50 %	50 %	108802921
105	NC_008148	GC	3	6	67703	67708	0 %	0 %	50 %	50 %	108802922
106	NC_008148	GC	3	6	67738	67743	0 %	0 %	50 %	50 %	108802922
107	NC_008148	TC	3	6	67786	67791	0 %	50 %	0 %	50 %	108802922
108	NC_008148	CG	3	6	68356	68361	0 %	0 %	50 %	50 %	108802922
109	NC_008148	GA	3	6	69653	69658	50 %	0 %	50 %	0 %	108802924
110	NC_008148	CG	3	6	70364	70369	0 %	0 %	50 %	50 %	108802925
111	NC_008148	CG	3	6	72514	72519	0 %	0 %	50 %	50 %	108802926
112	NC_008148	GC	3	6	73355	73360	0 %	0 %	50 %	50 %	108802926
113	NC_008148	CG	3	6	73554	73559	0 %	0 %	50 %	50 %	108802926
114	NC_008148	TC	3	6	74295	74300	0 %	50 %	0 %	50 %	108802927
115	NC_008148	CG	3	6	75700	75705	0 %	0 %	50 %	50 %	108802928
116	NC_008148	GC	3	6	76371	76376	0 %	0 %	50 %	50 %	108802929
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120	NC_008148	GC	3	6	82010	82015	0 %	0 %	50 %	50 %	108802934
121	NC_008148	TC	3	6	82584	82589	0 %	50 %	0 %	50 %	108802934
122	NC_008148	GC	3	6	83302	83307	0 %	0 %	50 %	50 %	108802935
123	NC_008148	CG	3	6	83584	83589	0 %	0 %	50 %	50 %	108802935
124	NC_008148	GC	4	8	83625	83632	0 %	0 %	50 %	50 %	108802935
125	NC_008148	CG	4	8	83742	83749	0 %	0 %	50 %	50 %	108802936
126	NC_008148	TG	3	6	85156	85161	0 %	50 %	50 %	0 %	108802937
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128	NC_008148	GA	3	6	86224	86229	50 %	0 %	50 %	0 %	108802938
129	NC_008148	TC	4	8	89837	89844	0 %	50 %	0 %	50 %	108802942
130	NC_008148	CT	3	6	90109	90114	0 %	50 %	0 %	50 %	108802942
131	NC_008148	CG	4	8	92221	92228	0 %	0 %	50 %	50 %	108802944
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133	NC_008148	GA	3	6	93667	93672	50 %	0 %	50 %	0 %	108802946
134	NC_008148	GC	3	6	93742	93747	0 %	0 %	50 %	50 %	108802946
135	NC_008148	CG	3	6	94114	94119	0 %	0 %	50 %	50 %	108802946
136	NC_008148	GC	3	6	94895	94900	0 %	0 %	50 %	50 %	108802946
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138	NC_008148	GC	3	6	95983	95988	0 %	0 %	50 %	50 %	108802948
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140	NC_008148	GC	3	6	96860	96865	0 %	0 %	50 %	50 %	108802948
141	NC_008148	GC	3	6	96937	96942	0 %	0 %	50 %	50 %	108802948
142	NC_008148	CG	3	6	97809	97814	0 %	0 %	50 %	50 %	108802948
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