MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium sp. MCS plasmid1

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008147	CACCC	2	10	1432	1441	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
2	NC_008147	CCCAC	2	10	11580	11589	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
3	NC_008147	AGCCC	2	10	56781	56790	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_008147	CGCGC	2	10	74273	74282	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5	NC_008147	ACCCC	2	10	75800	75809	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
6	NC_008147	GCACG	2	10	104387	104396	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_008147	CTCAC	2	10	137039	137048	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NC_008147	CCGCG	2	10	148291	148300	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9	NC_008147	GCTCT	2	10	150670	150679	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_008147	CGGCG	2	10	150785	150794	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11	NC_008147	CGCGA	2	10	154675	154684	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_008147	CGATG	2	10	183161	183170	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_008147	CGCGC	2	10	183286	183295	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
14	NC_008147	GCAGC	2	10	191626	191635	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_008147	GGGGT	2	10	197562	197571	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008147	TGTGA	2	10	197663	197672	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008147	CCACC	2	10	202869	202878	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
18	NC_008147	GGGGT	2	10	203372	203381	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008147	CCGGG	2	10	205627	205636	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
20	NC_008147	GGCGC	2	10	205826	205835	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
21	NC_008147	CGGCG	2	10	206003	206012	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
22	NC_008147	GCGGG	2	10	206134	206143	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
23	NC_008147	TCGCG	2	10	207407	207416	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_008147	CGCTG	2	10	207595	207604	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_008147	CTGGG	2	10	213082	213091	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.