MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium sp. MCS plasmid1

Total Repeats: 151

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008147	GCAGC	2	10	1581	1590	20 %	0 %	40 %	40 %	108802376
2	NC_008147	CGGGC	2	10	3334	3343	0 %	0 %	60 %	40 %	108802380
3	NC_008147	GTCGT	2	10	6738	6747	0 %	40 %	40 %	20 %	108802383
4	NC_008147	TCGTG	2	10	10166	10175	0 %	40 %	40 %	20 %	108802388
5	NC_008147	CCGGG	2	10	10359	10368	0 %	0 %	60 %	40 %	108802388
6	NC_008147	ACCCC	2	10	12385	12394	20 %	0 %	0 %	80 %	108802390
7	NC_008147	CCACA	2	10	13386	13395	40 %	0 %	0 %	60 %	108802391
8	NC_008147	TCGAC	2	10	14015	14024	20 %	20 %	20 %	40 %	108802391
9	NC_008147	GCCCG	2	10	14215	14224	0 %	0 %	40 %	60 %	108802392
10	NC_008147	ATCGA	2	10	17063	17072	40 %	20 %	20 %	20 %	108802395
11	NC_008147	TGATC	2	10	17526	17535	20 %	40 %	20 %	20 %	108802396
12	NC_008147	GCACA	2	10	19580	19589	40 %	0 %	20 %	40 %	108802398
13	NC_008147	CCGGC	2	10	21906	21915	0 %	0 %	40 %	60 %	108802401
14	NC_008147	TTCGC	2	10	29164	29173	0 %	40 %	20 %	40 %	108802408
15	NC_008147	ATTTG	2	10	30998	31007	20 %	60 %	20 %	0 %	108802410
16	NC_008147	GAACT	2	10	32535	32544	40 %	20 %	20 %	20 %	108802412
17	NC_008147	CGGAC	2	10	34999	35008	20 %	0 %	40 %	40 %	108802415
18	NC_008147	CCGCT	2	10	35606	35615	0 %	20 %	20 %	60 %	108802415
19	NC_008147	GGACC	2	10	35902	35911	20 %	0 %	40 %	40 %	108802415
20	NC_008147	TCGGG	2	10	37086	37095	0 %	20 %	60 %	20 %	108802416
21	NC_008147	TTCAA	2	10	39011	39020	40 %	40 %	0 %	20 %	108802418
22	NC_008147	ATCGC	2	10	41004	41013	20 %	20 %	20 %	40 %	108802420
23	NC_008147	AGCGC	2	10	41459	41468	20 %	0 %	40 %	40 %	108802421
24	NC_008147	GCCCA	2	10	42160	42169	20 %	0 %	20 %	60 %	108802421
25	NC_008147	GTGGC	2	10	43856	43865	0 %	20 %	60 %	20 %	108802424
26	NC_008147	ACTCA	2	10	45147	45156	40 %	20 %	0 %	40 %	108802426
27	NC_008147	CTGGG	2	10	45914	45923	0 %	20 %	60 %	20 %	108802427
28	NC_008147	AGCGG	2	10	46244	46253	20 %	0 %	60 %	20 %	108802427
29	NC_008147	CTGCC	2	10	50762	50771	0 %	20 %	20 %	60 %	108802432
30	NC_008147	CCTCA	2	10	53679	53688	20 %	20 %	0 %	60 %	108802436
31	NC_008147	CGAAG	2	10	55914	55923	40 %	0 %	40 %	20 %	108802440
32	NC_008147	GACGC	2	10	56238	56247	20 %	0 %	40 %	40 %	108802441
33	NC_008147	GCAGC	2	10	57980	57989	20 %	0 %	40 %	40 %	108802443
34	NC_008147	CCGGC	2	10	58559	58568	0 %	0 %	40 %	60 %	108802444
35	NC_008147	ACCGC	2	10	60217	60226	20 %	0 %	20 %	60 %	108802447
36	NC_008147	TCGCA	2	10	61822	61831	20 %	20 %	20 %	40 %	108802448
37	NC_008147	CGGAT	2	10	62709	62718	20 %	20 %	40 %	20 %	108802449
38	NC_008147	GACGC	2	10	63563	63572	20 %	0 %	40 %	40 %	108802450
39	NC_008147	CGCGG	2	10	64392	64401	0 %	0 %	60 %	40 %	108802451
40	NC_008147	CGGCG	2	10	64710	64719	0 %	0 %	60 %	40 %	108802451
41	NC_008147	TTGAG	2	10	66848	66857	20 %	40 %	40 %	0 %	108802452
42	NC_008147	GAAGG	2	10	69127	69136	40 %	0 %	60 %	0 %	108802452
43	NC_008147	TCGCG	2	10	69360	69369	0 %	20 %	40 %	40 %	108802452
44	NC_008147	CACCG	2	10	70312	70321	20 %	0 %	20 %	60 %	108802453
45	NC_008147	CGATC	2	10	71489	71498	20 %	20 %	20 %	40 %	108802453
46	NC_008147	GCGAA	2	10	72706	72715	40 %	0 %	40 %	20 %	108802453
47	NC_008147	GCGCC	2	10	73374	73383	0 %	0 %	40 %	60 %	108802454
48	NC_008147	CCTGC	2	10	75060	75069	0 %	20 %	20 %	60 %	108802457
49	NC_008147	TTCCC	2	10	75183	75192	0 %	40 %	0 %	60 %	108802457
50	NC_008147	CGTCG	2	10	76765	76774	0 %	20 %	40 %	40 %	108802458
51	NC_008147	GGTGT	2	10	79928	79937	0 %	40 %	60 %	0 %	108802465
52	NC_008147	GGGGT	2	10	80931	80940	0 %	20 %	80 %	0 %	108802465
53	NC_008147	TCGAC	2	10	81739	81748	20 %	20 %	20 %	40 %	108802466
54	NC_008147	CCGCC	2	10	82124	82133	0 %	0 %	20 %	80 %	108802466
55	NC_008147	GTCGA	2	10	83750	83759	20 %	20 %	40 %	20 %	108802470
56	NC_008147	TGACT	2	10	86514	86523	20 %	40 %	20 %	20 %	108802473
57	NC_008147	CGCGA	2	10	90508	90517	20 %	0 %	40 %	40 %	108802478
58	NC_008147	CGTCG	2	10	91258	91267	0 %	20 %	40 %	40 %	108802479
59	NC_008147	CAGCT	2	10	91910	91919	20 %	20 %	20 %	40 %	108802480
60	NC_008147	GCGCC	2	10	91930	91939	0 %	0 %	40 %	60 %	108802480
61	NC_008147	CCGCG	2	10	92569	92578	0 %	0 %	40 %	60 %	108802481
62	NC_008147	CGCGG	2	10	96400	96409	0 %	0 %	60 %	40 %	108802483
63	NC_008147	GTGTG	2	10	97349	97358	0 %	40 %	60 %	0 %	108802486
64	NC_008147	GCGCC	2	10	98241	98250	0 %	0 %	40 %	60 %	108802486
65	NC_008147	GTGCT	2	10	99251	99260	0 %	40 %	40 %	20 %	108802487
66	NC_008147	GCTGC	2	10	99777	99786	0 %	20 %	40 %	40 %	108802488
67	NC_008147	CGGGC	2	10	101573	101582	0 %	0 %	60 %	40 %	108802490
68	NC_008147	GCGCC	2	10	103488	103497	0 %	0 %	40 %	60 %	108802493
69	NC_008147	GTCTT	2	10	105410	105419	0 %	60 %	20 %	20 %	108802495
70	NC_008147	CGTTG	2	10	105858	105867	0 %	40 %	40 %	20 %	108802495
71	NC_008147	CGGCG	2	10	106372	106381	0 %	0 %	60 %	40 %	108802495
72	NC_008147	CGCAG	2	10	109747	109756	20 %	0 %	40 %	40 %	108802500
73	NC_008147	ACGCG	2	10	111182	111191	20 %	0 %	40 %	40 %	108802501
74	NC_008147	GCCGG	2	10	114559	114568	0 %	0 %	60 %	40 %	108802503
75	NC_008147	GCTGG	2	10	118056	118065	0 %	20 %	60 %	20 %	108802507
76	NC_008147	GTCGT	2	10	118339	118348	0 %	40 %	40 %	20 %	108802507
77	NC_008147	GCCGC	2	10	119556	119565	0 %	0 %	40 %	60 %	108802507
78	NC_008147	TGGTG	2	10	124744	124753	0 %	40 %	60 %	0 %	108802512
79	NC_008147	CTGGA	2	10	125633	125642	20 %	20 %	40 %	20 %	108802513
80	NC_008147	TCCGC	2	10	126947	126956	0 %	20 %	20 %	60 %	108802514
81	NC_008147	CCACC	2	10	127979	127988	20 %	0 %	0 %	80 %	108802515
82	NC_008147	GCCGC	2	10	129037	129046	0 %	0 %	40 %	60 %	108802516
83	NC_008147	CACGC	2	10	129611	129620	20 %	0 %	20 %	60 %	108802516
84	NC_008147	CGCGG	2	10	133171	133180	0 %	0 %	60 %	40 %	108802517
85	NC_008147	GGCCA	2	10	133781	133790	20 %	0 %	40 %	40 %	108802517
86	NC_008147	CTGGG	2	10	134273	134282	0 %	20 %	60 %	20 %	108802517
87	NC_008147	GCTCG	2	10	134578	134587	0 %	20 %	40 %	40 %	108802517
88	NC_008147	CAGCG	2	10	137903	137912	20 %	0 %	40 %	40 %	108802522
89	NC_008147	ACCAC	2	10	137925	137934	40 %	0 %	0 %	60 %	108802522
90	NC_008147	CGGCG	2	10	139514	139523	0 %	0 %	60 %	40 %	108802523
91	NC_008147	AGCGC	2	10	139759	139768	20 %	0 %	40 %	40 %	108802523
92	NC_008147	CGGCG	2	10	140800	140809	0 %	0 %	60 %	40 %	108802524
93	NC_008147	CGGGG	2	10	140956	140965	0 %	0 %	80 %	20 %	108802524
94	NC_008147	CGCGG	2	10	141215	141224	0 %	0 %	60 %	40 %	108802524
95	NC_008147	GCCGC	2	10	141391	141400	0 %	0 %	40 %	60 %	108802524
96	NC_008147	CCGCT	2	10	142808	142817	0 %	20 %	20 %	60 %	108802525
97	NC_008147	TCGCT	2	10	143993	144002	0 %	40 %	20 %	40 %	108802526
98	NC_008147	CGGCG	2	10	146004	146013	0 %	0 %	60 %	40 %	108802528
99	NC_008147	CGGGG	2	10	146707	146716	0 %	0 %	80 %	20 %	108802528
100	NC_008147	CCGCC	2	10	147869	147878	0 %	0 %	20 %	80 %	108802529
101	NC_008147	GTGGC	2	10	148657	148666	0 %	20 %	60 %	20 %	108802531
102	NC_008147	GCGGT	2	10	150070	150079	0 %	20 %	60 %	20 %	108802532
103	NC_008147	ACCGA	2	10	152129	152138	40 %	0 %	20 %	40 %	108802534
104	NC_008147	AGCTG	2	10	152448	152457	20 %	20 %	40 %	20 %	108802534
105	NC_008147	CCAGG	2	10	153129	153138	20 %	0 %	40 %	40 %	108802534
106	NC_008147	GGCCG	2	10	153622	153631	0 %	0 %	60 %	40 %	108802534
107	NC_008147	TGCGA	2	10	155715	155724	20 %	20 %	40 %	20 %	108802536
108	NC_008147	TCGTG	2	10	156590	156599	0 %	40 %	40 %	20 %	108802537
109	NC_008147	CCCTG	2	10	157673	157682	0 %	20 %	20 %	60 %	108802538
110	NC_008147	GTCAC	2	10	171574	171583	20 %	20 %	20 %	40 %	108802554
111	NC_008147	CCGAC	2	10	174691	174700	20 %	0 %	20 %	60 %	108802559
112	NC_008147	GCCGC	2	10	174951	174960	0 %	0 %	40 %	60 %	108802559
113	NC_008147	GGCCG	2	10	176165	176174	0 %	0 %	60 %	40 %	108802559
114	NC_008147	ACCTC	2	10	177284	177293	20 %	20 %	0 %	60 %	108802560
115	NC_008147	CGGGC	2	10	178169	178178	0 %	0 %	60 %	40 %	108802561
116	NC_008147	GTCGA	2	10	178369	178378	20 %	20 %	40 %	20 %	108802562
117	NC_008147	GGTGT	2	10	178996	179005	0 %	40 %	60 %	0 %	108802562
118	NC_008147	GGGGT	2	10	179999	180008	0 %	20 %	80 %	0 %	108802563
119	NC_008147	TCGGT	2	10	180494	180503	0 %	40 %	40 %	20 %	108802564
120	NC_008147	CGGTG	2	10	181665	181674	0 %	20 %	60 %	20 %	108802566
121	NC_008147	GCGAC	2	10	183492	183501	20 %	0 %	40 %	40 %	108802568
122	NC_008147	TGTCG	2	10	184272	184281	0 %	40 %	40 %	20 %	108802569
123	NC_008147	ACTCG	2	10	185068	185077	20 %	20 %	20 %	40 %	108802569
124	NC_008147	CCGGC	2	10	185354	185363	0 %	0 %	40 %	60 %	108802569
125	NC_008147	CCCCA	2	10	185853	185862	20 %	0 %	0 %	80 %	108802569
126	NC_008147	GCACT	2	10	185899	185908	20 %	20 %	20 %	40 %	108802569
127	NC_008147	AATTC	2	10	186288	186297	40 %	40 %	0 %	20 %	108802569
128	NC_008147	CGGCG	2	10	187311	187320	0 %	0 %	60 %	40 %	108802570
129	NC_008147	CCTCG	2	10	187900	187909	0 %	20 %	20 %	60 %	108802571
130	NC_008147	CGTGC	2	10	188651	188660	0 %	20 %	40 %	40 %	108802572
131	NC_008147	GTGTG	2	10	190246	190255	0 %	40 %	60 %	0 %	108802574
132	NC_008147	AGCTG	2	10	190297	190306	20 %	20 %	40 %	20 %	108802575
133	NC_008147	GCCAG	2	10	191873	191882	20 %	0 %	40 %	40 %	108802577
134	NC_008147	GACGG	2	10	194448	194457	20 %	0 %	60 %	20 %	108802580
135	NC_008147	GATCG	2	10	196094	196103	20 %	20 %	40 %	20 %	108802582
136	NC_008147	CGCTG	2	10	197217	197226	0 %	20 %	40 %	40 %	108802584
137	NC_008147	GCGCC	2	10	198273	198282	0 %	0 %	40 %	60 %	108802585
138	NC_008147	GCGCC	2	10	199598	199607	0 %	0 %	40 %	60 %	108802586
139	NC_008147	ACCGA	2	10	199649	199658	40 %	0 %	20 %	40 %	108802586
140	NC_008147	CGGTC	2	10	199852	199861	0 %	20 %	40 %	40 %	108802586
141	NC_008147	CGCGG	2	10	199928	199937	0 %	0 %	60 %	40 %	108802586
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143	NC_008147	GCGTG	2	10	200782	200791	0 %	20 %	60 %	20 %	108802587
144	NC_008147	GGCCG	2	10	201624	201633	0 %	0 %	60 %	40 %	108802588
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146	NC_008147	GCTGC	2	10	202193	202202	0 %	20 %	40 %	40 %	108802588
147	NC_008147	TCACG	2	10	202314	202323	20 %	20 %	20 %	40 %	108802588
148	NC_008147	CGGCG	2	10	202472	202481	0 %	0 %	60 %	40 %	108802588
149	NC_008147	GGTGC	2	10	204122	204131	0 %	20 %	60 %	20 %	108802589
150	NC_008147	TGACG	2	10	205180	205189	20 %	20 %	40 %	20 %	108802590
151	NC_008147	GGACG	2	10	213263	213272	20 %	0 %	60 %	20 %	108802594

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.