MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium sp. MCS plasmid1

Total Repeats: 508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008147	CGCC	2	8	1963	1970	0 %	0 %	25 %	75 %	108802377
2	NC_008147	CCGG	2	8	2046	2053	0 %	0 %	50 %	50 %	108802377
3	NC_008147	GGTG	2	8	2085	2092	0 %	25 %	75 %	0 %	108802377
4	NC_008147	TGGC	2	8	2186	2193	0 %	25 %	50 %	25 %	108802377
5	NC_008147	AGCC	2	8	3242	3249	25 %	0 %	25 %	50 %	108802380
6	NC_008147	GCCG	3	12	4433	4444	0 %	0 %	50 %	50 %	108802381
7	NC_008147	TGGG	2	8	4536	4543	0 %	25 %	75 %	0 %	108802381
8	NC_008147	CCGA	2	8	5211	5218	25 %	0 %	25 %	50 %	108802382
9	NC_008147	GACC	2	8	5476	5483	25 %	0 %	25 %	50 %	108802382
10	NC_008147	CGGT	2	8	6163	6170	0 %	25 %	50 %	25 %	108802383
11	NC_008147	GCCA	2	8	6204	6211	25 %	0 %	25 %	50 %	108802383
12	NC_008147	CCGG	2	8	6891	6898	0 %	0 %	50 %	50 %	108802384
13	NC_008147	CGGC	2	8	6925	6932	0 %	0 %	50 %	50 %	108802384
14	NC_008147	GGCT	2	8	7148	7155	0 %	25 %	50 %	25 %	108802384
15	NC_008147	GCGG	2	8	7293	7300	0 %	0 %	75 %	25 %	108802384
16	NC_008147	GGTA	2	8	7657	7664	25 %	25 %	50 %	0 %	108802385
17	NC_008147	CATG	2	8	7695	7702	25 %	25 %	25 %	25 %	108802385
18	NC_008147	TGCC	2	8	8332	8339	0 %	25 %	25 %	50 %	108802385
19	NC_008147	GCGG	2	8	8535	8542	0 %	0 %	75 %	25 %	108802385
20	NC_008147	ACGA	2	8	8595	8602	50 %	0 %	25 %	25 %	108802385
21	NC_008147	GGAC	2	8	8692	8699	25 %	0 %	50 %	25 %	108802385
22	NC_008147	ACTG	2	8	9202	9209	25 %	25 %	25 %	25 %	108802385
23	NC_008147	CGCC	2	8	9778	9785	0 %	0 %	25 %	75 %	108802387
24	NC_008147	ATCA	2	8	10079	10086	50 %	25 %	0 %	25 %	108802388
25	NC_008147	ACGC	2	8	10445	10452	25 %	0 %	25 %	50 %	108802388
26	NC_008147	CACC	2	8	11169	11176	25 %	0 %	0 %	75 %	108802388
27	NC_008147	CCGA	2	8	11887	11894	25 %	0 %	25 %	50 %	108802389
28	NC_008147	GAGT	2	8	11995	12002	25 %	25 %	50 %	0 %	108802390
29	NC_008147	ACCG	2	8	13277	13284	25 %	0 %	25 %	50 %	108802391
30	NC_008147	CCAC	2	8	13649	13656	25 %	0 %	0 %	75 %	108802391
31	NC_008147	GCAC	2	8	13755	13762	25 %	0 %	25 %	50 %	108802391
32	NC_008147	CCGC	2	8	14362	14369	0 %	0 %	25 %	75 %	108802392
33	NC_008147	GCTT	2	8	15066	15073	0 %	50 %	25 %	25 %	108802393
34	NC_008147	CTGG	2	8	15410	15417	0 %	25 %	50 %	25 %	108802393
35	NC_008147	CGAC	2	8	15824	15831	25 %	0 %	25 %	50 %	108802393
36	NC_008147	TCGG	2	8	16728	16735	0 %	25 %	50 %	25 %	108802395
37	NC_008147	TGGC	2	8	16760	16767	0 %	25 %	50 %	25 %	108802395
38	NC_008147	ATCC	2	8	17226	17233	25 %	25 %	0 %	50 %	108802395
39	NC_008147	CGAG	2	8	17270	17277	25 %	0 %	50 %	25 %	108802395
40	NC_008147	GCTC	2	8	17481	17488	0 %	25 %	25 %	50 %	108802396
41	NC_008147	ACGA	2	8	17710	17717	50 %	0 %	25 %	25 %	108802396
42	NC_008147	TGGC	2	8	18070	18077	0 %	25 %	50 %	25 %	108802396
43	NC_008147	CGAG	2	8	18230	18237	25 %	0 %	50 %	25 %	108802396
44	NC_008147	ATGC	2	8	19271	19278	25 %	25 %	25 %	25 %	108802398
45	NC_008147	GTGC	2	8	19763	19770	0 %	25 %	50 %	25 %	108802398
46	NC_008147	GGGC	2	8	19911	19918	0 %	0 %	75 %	25 %	108802398
47	NC_008147	GCTT	2	8	21013	21020	0 %	50 %	25 %	25 %	108802400
48	NC_008147	CAGG	2	8	21072	21079	25 %	0 %	50 %	25 %	108802400
49	NC_008147	GTCA	2	8	21243	21250	25 %	25 %	25 %	25 %	108802400
50	NC_008147	CTAC	2	8	22299	22306	25 %	25 %	0 %	50 %	108802401
51	NC_008147	TGCT	2	8	22321	22328	0 %	50 %	25 %	25 %	108802401
52	NC_008147	CCAG	2	8	23210	23217	25 %	0 %	25 %	50 %	108802402
53	NC_008147	GGCT	2	8	23441	23448	0 %	25 %	50 %	25 %	108802402
54	NC_008147	GCTC	2	8	23454	23461	0 %	25 %	25 %	50 %	108802402
55	NC_008147	CACG	2	8	23474	23481	25 %	0 %	25 %	50 %	108802402
56	NC_008147	CTCG	2	8	23892	23899	0 %	25 %	25 %	50 %	108802403
57	NC_008147	TCGA	2	8	24073	24080	25 %	25 %	25 %	25 %	108802403
58	NC_008147	GGCC	2	8	24132	24139	0 %	0 %	50 %	50 %	108802403
59	NC_008147	GCGA	2	8	24165	24172	25 %	0 %	50 %	25 %	108802403
60	NC_008147	CGTG	2	8	24357	24364	0 %	25 %	50 %	25 %	108802403
61	NC_008147	GTGG	2	8	24495	24502	0 %	25 %	75 %	0 %	108802403
62	NC_008147	TCAG	2	8	24566	24573	25 %	25 %	25 %	25 %	108802403
63	NC_008147	TGAG	2	8	25392	25399	25 %	25 %	50 %	0 %	108802404
64	NC_008147	GACG	2	8	26440	26447	25 %	0 %	50 %	25 %	108802405
65	NC_008147	GCTT	2	8	26625	26632	0 %	50 %	25 %	25 %	108802405
66	NC_008147	CCGA	2	8	26946	26953	25 %	0 %	25 %	50 %	108802405
67	NC_008147	GCGG	2	8	27132	27139	0 %	0 %	75 %	25 %	108802405
68	NC_008147	GTCG	2	8	27486	27493	0 %	25 %	50 %	25 %	108802406
69	NC_008147	GCAA	2	8	27532	27539	50 %	0 %	25 %	25 %	108802406
70	NC_008147	GCCT	2	8	27693	27700	0 %	25 %	25 %	50 %	108802406
71	NC_008147	GGCT	2	8	27728	27735	0 %	25 %	50 %	25 %	108802406
72	NC_008147	CCGA	2	8	27861	27868	25 %	0 %	25 %	50 %	108802406
73	NC_008147	CTTT	2	8	28070	28077	0 %	75 %	0 %	25 %	108802406
74	NC_008147	GGCC	2	8	28779	28786	0 %	0 %	50 %	50 %	108802407
75	NC_008147	AAAC	2	8	28946	28953	75 %	0 %	0 %	25 %	108802407
76	NC_008147	CCGG	2	8	29316	29323	0 %	0 %	50 %	50 %	108802408
77	NC_008147	CACC	2	8	29338	29345	25 %	0 %	0 %	75 %	108802408
78	NC_008147	GCCA	2	8	29751	29758	25 %	0 %	25 %	50 %	108802409
79	NC_008147	AAAG	2	8	30146	30153	75 %	0 %	25 %	0 %	108802409
80	NC_008147	CTGG	2	8	30443	30450	0 %	25 %	50 %	25 %	108802410
81	NC_008147	TCGG	2	8	30597	30604	0 %	25 %	50 %	25 %	108802410
82	NC_008147	ACTC	2	8	30751	30758	25 %	25 %	0 %	50 %	108802410
83	NC_008147	TCAC	2	8	31886	31893	25 %	25 %	0 %	50 %	108802411
84	NC_008147	GCCT	2	8	32217	32224	0 %	25 %	25 %	50 %	108802412
85	NC_008147	ACCG	2	8	32517	32524	25 %	0 %	25 %	50 %	108802412
86	NC_008147	ACCC	2	8	32751	32758	25 %	0 %	0 %	75 %	108802412
87	NC_008147	CAGC	2	8	33449	33456	25 %	0 %	25 %	50 %	108802413
88	NC_008147	CGCC	2	8	33882	33889	0 %	0 %	25 %	75 %	108802414
89	NC_008147	CCGG	2	8	34098	34105	0 %	0 %	50 %	50 %	108802414
90	NC_008147	CTGA	2	8	36181	36188	25 %	25 %	25 %	25 %	108802416
91	NC_008147	CCGG	2	8	36347	36354	0 %	0 %	50 %	50 %	108802416
92	NC_008147	GACG	2	8	37624	37631	25 %	0 %	50 %	25 %	108802417
93	NC_008147	ATGA	2	8	38242	38249	50 %	25 %	25 %	0 %	108802418
94	NC_008147	CGCC	2	8	38373	38380	0 %	0 %	25 %	75 %	108802418
95	NC_008147	GCCC	2	8	38385	38392	0 %	0 %	25 %	75 %	108802418
96	NC_008147	GGCC	2	8	38565	38572	0 %	0 %	50 %	50 %	108802418
97	NC_008147	CTGC	2	8	38739	38746	0 %	25 %	25 %	50 %	108802418
98	NC_008147	GGTC	2	8	39495	39502	0 %	25 %	50 %	25 %	108802419
99	NC_008147	CCAG	2	8	39910	39917	25 %	0 %	25 %	50 %	108802419
100	NC_008147	AAGC	2	8	40254	40261	50 %	0 %	25 %	25 %	108802419
101	NC_008147	TCGT	2	8	40939	40946	0 %	50 %	25 %	25 %	108802420
102	NC_008147	TTCA	2	8	40967	40974	25 %	50 %	0 %	25 %	108802420
103	NC_008147	GGCG	2	8	40981	40988	0 %	0 %	75 %	25 %	108802420
104	NC_008147	TCGC	2	8	41317	41324	0 %	25 %	25 %	50 %	108802420
105	NC_008147	CGGT	2	8	41671	41678	0 %	25 %	50 %	25 %	108802421
106	NC_008147	GGTC	2	8	42726	42733	0 %	25 %	50 %	25 %	108802422
107	NC_008147	GGGT	2	8	42776	42783	0 %	25 %	75 %	0 %	108802422
108	NC_008147	ATCG	2	8	42866	42873	25 %	25 %	25 %	25 %	108802422
109	NC_008147	CGGC	2	8	43434	43441	0 %	0 %	50 %	50 %	108802424
110	NC_008147	GTGC	2	8	43486	43493	0 %	25 %	50 %	25 %	108802424
111	NC_008147	CAGC	2	8	43552	43559	25 %	0 %	25 %	50 %	108802424
112	NC_008147	CCGC	2	8	44536	44543	0 %	0 %	25 %	75 %	108802425
113	NC_008147	CCGA	2	8	45112	45119	25 %	0 %	25 %	50 %	108802426
114	NC_008147	ACCC	2	8	45632	45639	25 %	0 %	0 %	75 %	108802426
115	NC_008147	GCTG	2	8	47270	47277	0 %	25 %	50 %	25 %	108802429
116	NC_008147	GTCG	2	8	48338	48345	0 %	25 %	50 %	25 %	108802429
117	NC_008147	CGGC	2	8	48735	48742	0 %	0 %	50 %	50 %	108802430
118	NC_008147	CGCC	2	8	50379	50386	0 %	0 %	25 %	75 %	108802431
119	NC_008147	CGGC	2	8	50510	50517	0 %	0 %	50 %	50 %	108802431
120	NC_008147	CCGG	2	8	50893	50900	0 %	0 %	50 %	50 %	108802432
121	NC_008147	GCCA	2	8	51111	51118	25 %	0 %	25 %	50 %	108802432
122	NC_008147	GCTG	2	8	51157	51164	0 %	25 %	50 %	25 %	108802432
123	NC_008147	ACCG	2	8	53213	53220	25 %	0 %	25 %	50 %	108802435
124	NC_008147	CCGC	2	8	53634	53641	0 %	0 %	25 %	75 %	108802436
125	NC_008147	CCGG	2	8	53994	54001	0 %	0 %	50 %	50 %	108802437
126	NC_008147	CGGC	2	8	54197	54204	0 %	0 %	50 %	50 %	108802437
127	NC_008147	CCGC	2	8	54253	54260	0 %	0 %	25 %	75 %	108802437
128	NC_008147	GCTG	2	8	54322	54329	0 %	25 %	50 %	25 %	108802438
129	NC_008147	ACCG	2	8	54464	54471	25 %	0 %	25 %	50 %	108802438
130	NC_008147	ACGC	2	8	54858	54865	25 %	0 %	25 %	50 %	108802439
131	NC_008147	GCAC	2	8	54890	54897	25 %	0 %	25 %	50 %	108802439
132	NC_008147	CACC	2	8	55660	55667	25 %	0 %	0 %	75 %	108802440
133	NC_008147	GCGG	2	8	55690	55697	0 %	0 %	75 %	25 %	108802440
134	NC_008147	GATC	2	8	56385	56392	25 %	25 %	25 %	25 %	108802441
135	NC_008147	CCGC	2	8	57158	57165	0 %	0 %	25 %	75 %	108802442
136	NC_008147	GGCC	2	8	57291	57298	0 %	0 %	50 %	50 %	108802442
137	NC_008147	CTCA	2	8	57568	57575	25 %	25 %	0 %	50 %	108802442
138	NC_008147	CCGC	2	8	57630	57637	0 %	0 %	25 %	75 %	108802442
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140	NC_008147	ACGC	2	8	58586	58593	25 %	0 %	25 %	50 %	108802444
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