MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium sp. MCS plasmid1

Total Repeats: 4101

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008147	TGC	2	6	83	88	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008147	TAC	2	6	247	252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008147	TGC	2	6	295	300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008147	CCG	2	6	523	528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802374
5	NC_008147	CCG	2	6	548	553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802374
6	NC_008147	CCA	2	6	555	560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802374
7	NC_008147	GAC	2	6	649	654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802374
8	NC_008147	CGG	2	6	715	720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008147	GCC	2	6	797	802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802375
10	NC_008147	GCA	2	6	841	846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802375
11	NC_008147	GCC	2	6	855	860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802375
12	NC_008147	CCA	2	6	877	882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802375
13	NC_008147	CCG	2	6	929	934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802375
14	NC_008147	CGC	2	6	936	941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802375
15	NC_008147	TCG	2	6	942	947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802375
16	NC_008147	CGG	2	6	977	982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802375
17	NC_008147	ACC	2	6	1002	1007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802375
18	NC_008147	GCC	2	6	1059	1064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802375
19	NC_008147	CGC	2	6	1094	1099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802375
20	NC_008147	CCG	2	6	1105	1110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802375
21	NC_008147	GCC	2	6	1119	1124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802375
22	NC_008147	ACC	2	6	1164	1169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802375
23	NC_008147	CAC	3	9	1220	1228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802375
24	NC_008147	GCA	2	6	1293	1298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008147	CTG	2	6	1340	1345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008147	CGG	2	6	1485	1490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802376
27	NC_008147	GCG	2	6	1502	1507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802376
28	NC_008147	CGG	2	6	1521	1526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802376
29	NC_008147	TCG	2	6	1529	1534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802376
30	NC_008147	GCC	2	6	1595	1600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802376
31	NC_008147	TGG	2	6	1613	1618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802376
32	NC_008147	CGC	2	6	1793	1798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_008147	GCA	2	6	1884	1889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802377
34	NC_008147	CAC	2	6	1897	1902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802377
35	NC_008147	TCG	3	9	1931	1939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802377
36	NC_008147	GCG	2	6	2019	2024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802377
37	NC_008147	GCA	2	6	2100	2105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802377
38	NC_008147	CTG	2	6	2202	2207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802377
39	NC_008147	CGT	2	6	2214	2219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802377
40	NC_008147	CTC	2	6	2245	2250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802377
41	NC_008147	GCC	2	6	2255	2260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802377
42	NC_008147	GCT	2	6	2314	2319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802377
43	NC_008147	CGC	2	6	2328	2333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802378
44	NC_008147	GAA	2	6	2358	2363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108802378
45	NC_008147	CCG	3	9	2366	2374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802378
46	NC_008147	GTC	2	6	2472	2477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802378
47	NC_008147	TGG	2	6	2512	2517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802378
48	NC_008147	CTC	2	6	2523	2528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802378
49	NC_008147	GAT	2	6	2538	2543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802378
50	NC_008147	CGG	2	6	2642	2647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008147	AGG	2	6	2656	2661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008147	GCA	2	6	2665	2670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008147	CGG	2	6	2674	2679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008147	CCG	2	6	2680	2685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_008147	TCG	2	6	2706	2711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008147	CGA	2	6	2755	2760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_008147	TCG	2	6	2766	2771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008147	GCC	2	6	2816	2821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_008147	GCG	2	6	2863	2868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802379
60	NC_008147	CGT	3	9	2878	2886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802379
61	NC_008147	AGC	2	6	3076	3081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802379
62	NC_008147	CAC	2	6	3090	3095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802379
63	NC_008147	CGG	2	6	3098	3103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802379
64	NC_008147	CGC	2	6	3106	3111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802379
65	NC_008147	GCT	2	6	3128	3133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802379
66	NC_008147	CAG	2	6	3144	3149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802379
67	NC_008147	TGG	2	6	3160	3165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802379
68	NC_008147	GCT	2	6	3223	3228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802380
69	NC_008147	GAA	2	6	3304	3309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108802380
70	NC_008147	ACC	2	6	3371	3376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802380
71	NC_008147	TCG	2	6	3398	3403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802380
72	NC_008147	GCC	2	6	3460	3465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802380
73	NC_008147	GCA	2	6	3486	3491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802380
74	NC_008147	CGA	2	6	3582	3587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802380
75	NC_008147	CAT	2	6	3673	3678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108802380
76	NC_008147	CCA	2	6	3744	3749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802380
77	NC_008147	CGC	3	9	3799	3807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802380
78	NC_008147	AGC	2	6	3821	3826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802380
79	NC_008147	AAC	2	6	3845	3850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108802380
80	NC_008147	ACC	2	6	3872	3877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802380
81	NC_008147	TCG	2	6	3905	3910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008147	GAC	2	6	3913	3918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008147	CAG	2	6	3931	3936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008147	ACA	2	6	4018	4023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008147	ACC	3	9	4061	4069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_008147	GTG	2	6	4094	4099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008147	CGG	2	6	4132	4137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008147	GTC	2	6	4139	4144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008147	AGC	2	6	4174	4179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008147	TGC	2	6	4224	4229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008147	GCC	2	6	4236	4241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_008147	CGC	2	6	4243	4248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_008147	CTC	2	6	4259	4264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_008147	CGC	2	6	4279	4284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_008147	GCC	2	6	4287	4292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_008147	TCA	2	6	4300	4305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108802381
97	NC_008147	GCT	2	6	4365	4370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802381
98	NC_008147	CCG	3	9	4428	4436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802381
99	NC_008147	CGG	2	6	4446	4451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802381
100	NC_008147	CGC	2	6	4464	4469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802381
101	NC_008147	AGC	2	6	4475	4480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802381
102	NC_008147	CGG	2	6	4527	4532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802381
103	NC_008147	CGC	2	6	4573	4578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802381
104	NC_008147	CTC	2	6	4606	4611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802381
105	NC_008147	CGC	2	6	4659	4664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802381
106	NC_008147	GCC	2	6	4667	4672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802381
107	NC_008147	GCC	3	9	4687	4695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802381
108	NC_008147	CGC	2	6	4828	4833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_008147	TGA	2	6	4890	4895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802382
110	NC_008147	CCA	2	6	4948	4953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802382
111	NC_008147	CGA	2	6	5063	5068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802382
112	NC_008147	GGC	3	9	5188	5196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802382
113	NC_008147	GTC	3	9	5336	5344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802382
114	NC_008147	CTC	2	6	5399	5404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802382
115	NC_008147	GTC	2	6	5432	5437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802382
116	NC_008147	GCC	2	6	5460	5465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802382
117	NC_008147	GCC	2	6	5623	5628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802382
118	NC_008147	ACC	2	6	5665	5670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802382
119	NC_008147	CAC	3	9	5846	5854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_008147	GTG	5	15	5875	5889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008147	GCC	2	6	5983	5988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_008147	CCG	3	9	6151	6159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802383
123	NC_008147	CGA	2	6	6182	6187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802383
124	NC_008147	CAT	2	6	6197	6202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108802383
125	NC_008147	GTG	2	6	6243	6248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802383
126	NC_008147	CCG	2	6	6260	6265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802383
127	NC_008147	CGG	2	6	6331	6336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802383
128	NC_008147	GAC	2	6	6420	6425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802383
129	NC_008147	CTG	2	6	6458	6463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802383
130	NC_008147	GAA	2	6	6542	6547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108802383
131	NC_008147	GCC	2	6	6581	6586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802383
132	NC_008147	CGG	2	6	6592	6597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802383
133	NC_008147	GAC	2	6	6605	6610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802383
134	NC_008147	TGC	2	6	6613	6618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802383
135	NC_008147	GCC	2	6	6623	6628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802383
136	NC_008147	CGC	2	6	6656	6661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802383
137	NC_008147	GGC	2	6	6827	6832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802383
138	NC_008147	CGG	3	9	6833	6841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802384
139	NC_008147	CGT	2	6	6851	6856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802384
140	NC_008147	CGG	2	6	6871	6876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802384
141	NC_008147	CGC	2	6	6899	6904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802384
142	NC_008147	GGC	2	6	6977	6982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802384
143	NC_008147	CGG	2	6	7009	7014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802384
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147	NC_008147	CGG	2	6	7178	7183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802384
148	NC_008147	CTG	2	6	7192	7197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802384
149	NC_008147	GGT	2	6	7208	7213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802384
150	NC_008147	GCC	2	6	7238	7243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802384
151	NC_008147	TGG	2	6	7261	7266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802384
152	NC_008147	CGG	2	6	7282	7287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802384
153	NC_008147	GCC	2	6	7328	7333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802384
154	NC_008147	CTG	2	6	7426	7431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802384
155	NC_008147	GAT	2	6	7448	7453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802384
156	NC_008147	GGT	2	6	7526	7531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
157	NC_008147	CTG	2	6	7549	7554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802385
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159	NC_008147	GAG	2	6	7724	7729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802385
160	NC_008147	CGG	2	6	7737	7742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802385
161	NC_008147	CGA	2	6	7765	7770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802385
162	NC_008147	CGG	2	6	7774	7779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802385
163	NC_008147	TGA	2	6	7789	7794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802385
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166	NC_008147	CGG	2	6	7987	7992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802385
167	NC_008147	GGC	2	6	8021	8026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802385
168	NC_008147	CAG	2	6	8033	8038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802385
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172	NC_008147	CGA	2	6	8263	8268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802385
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190	NC_008147	ACG	2	6	9274	9279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
191	NC_008147	CGT	2	6	9280	9285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
192	NC_008147	ATC	2	6	9572	9577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108802386
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201	NC_008147	GGA	2	6	10057	10062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
202	NC_008147	CGT	2	6	10136	10141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802388
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223	NC_008147	CCT	2	6	11660	11665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802389
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245	NC_008147	GCC	2	6	13165	13170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802390
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247	NC_008147	ACC	2	6	13182	13187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802390
248	NC_008147	CGT	2	6	13227	13232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
249	NC_008147	GCC	2	6	13257	13262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802391
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256	NC_008147	CGA	2	6	13676	13681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802391
257	NC_008147	CCG	3	9	13683	13691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802391
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259	NC_008147	GGT	2	6	13731	13736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802391
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386	NC_008147	GTT	2	6	22471	22476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108802401
387	NC_008147	CGG	2	6	22489	22494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802401
388	NC_008147	GCA	2	6	22588	22593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802401
389	NC_008147	TGC	2	6	22632	22637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802401
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393	NC_008147	CGG	2	6	22968	22973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802401
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498	NC_008147	CCT	2	6	29581	29586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
499	NC_008147	GTC	2	6	29592	29597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
500	NC_008147	GAT	2	6	29679	29684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802409

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