MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium sp. MCS plasmid1

Total Repeats: 491

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008147	TGC	2	6	83	88	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008147	TAC	2	6	247	252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008147	TGC	2	6	295	300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008147	CGG	2	6	715	720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008147	GCA	2	6	1293	1298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008147	CTG	2	6	1340	1345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008147	CGC	2	6	1793	1798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_008147	CGG	2	6	2642	2647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008147	AGG	2	6	2656	2661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008147	GCA	2	6	2665	2670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008147	CGG	2	6	2674	2679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008147	CCG	2	6	2680	2685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_008147	TCG	2	6	2706	2711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008147	CGA	2	6	2755	2760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008147	TCG	2	6	2766	2771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008147	GCC	2	6	2816	2821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_008147	TCG	2	6	3905	3910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008147	GAC	2	6	3913	3918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008147	CAG	2	6	3931	3936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008147	ACA	2	6	4018	4023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008147	ACC	3	9	4061	4069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_008147	GTG	2	6	4094	4099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008147	CGG	2	6	4132	4137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008147	GTC	2	6	4139	4144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008147	AGC	2	6	4174	4179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008147	TGC	2	6	4224	4229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008147	GCC	2	6	4236	4241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_008147	CGC	2	6	4243	4248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_008147	CTC	2	6	4259	4264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_008147	CGC	2	6	4279	4284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_008147	GCC	2	6	4287	4292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_008147	CGC	2	6	4828	4833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_008147	CAC	3	9	5846	5854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_008147	GTG	5	15	5875	5889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008147	GCC	2	6	5983	5988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_008147	GGT	2	6	7526	7531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008147	TCC	2	6	9260	9265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_008147	ACG	2	6	9274	9279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008147	CGT	2	6	9280	9285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008147	GGA	2	6	10057	10062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008147	CCG	2	6	11593	11598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_008147	CGT	2	6	13227	13232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008147	CAC	2	6	14463	14468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_008147	ATC	2	6	15949	15954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008147	TCG	2	6	16121	16126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008147	CGA	2	6	16165	16170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008147	CGC	2	6	16200	16205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_008147	GCT	2	6	20285	20290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008147	GCA	2	6	20293	20298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008147	ACG	2	6	20341	20346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008147	TCA	2	6	20420	20425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008147	CGC	3	9	20467	20475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_008147	GTC	2	6	23723	23728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008147	GAG	2	6	24993	24998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008147	CCG	2	6	26038	26043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_008147	CGG	2	6	26054	26059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_008147	CGA	2	6	26105	26110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008147	GAC	2	6	26138	26143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008147	GGC	2	6	26177	26182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008147	CGA	2	6	26198	26203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008147	CAG	2	6	29037	29042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008147	CCT	2	6	29581	29586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_008147	GTC	2	6	29592	29597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008147	CAC	2	6	31700	31705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_008147	CGA	2	6	31822	31827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008147	CCA	2	6	31840	31845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_008147	CCT	2	6	32094	32099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_008147	TGG	2	6	36073	36078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008147	GGC	2	6	36079	36084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008147	CGG	2	6	37211	37216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008147	GCC	2	6	37221	37226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_008147	ATG	2	6	37230	37235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008147	GAT	2	6	39221	39226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008147	TAT	2	6	39241	39246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008147	CGG	2	6	39264	39269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008147	GAT	2	6	39373	39378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008147	TTC	2	6	40828	40833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008147	CCA	2	6	40855	40860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_008147	GGT	2	6	43280	43285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008147	CAC	2	6	45674	45679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_008147	CCG	2	6	45712	45717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_008147	CAC	2	6	45785	45790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_008147	AGG	2	6	45841	45846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008147	ACC	2	6	45868	45873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_008147	GCT	2	6	46425	46430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008147	CAC	2	6	46454	46459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_008147	CGT	2	6	46485	46490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008147	GCA	2	6	46609	46614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008147	GGA	2	6	46730	46735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008147	GCC	2	6	46751	46756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_008147	CTG	2	6	48369	48374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008147	CGG	2	6	48376	48381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008147	CGT	2	6	48398	48403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008147	CCT	2	6	48427	48432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_008147	GCT	2	6	49289	49294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008147	CGA	2	6	49300	49305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008147	CGA	2	6	49348	49353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008147	GAC	2	6	49374	49379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008147	TCG	2	6	49419	49424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008147	TCG	2	6	49524	49529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008147	CCG	2	6	49564	49569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_008147	GAC	2	6	49579	49584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008147	TTG	2	6	49731	49736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008147	GCG	2	6	49753	49758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_008147	GAG	2	6	49902	49907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008147	CTT	2	6	49910	49915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008147	CCT	2	6	50021	50026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_008147	CAG	2	6	50147	50152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_008147	TCG	2	6	50199	50204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008147	ACG	2	6	50209	50214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008147	CCG	2	6	50249	50254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_008147	GCC	2	6	50292	50297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_008147	CCG	2	6	55127	55132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_008147	CAC	2	6	55335	55340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_008147	CCG	2	6	55349	55354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_008147	CTC	2	6	56108	56113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_008147	CTG	2	6	56126	56131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008147	GAC	2	6	56151	56156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008147	AAT	2	6	56691	56696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008147	TCG	2	6	56723	56728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008147	CGA	2	6	56732	56737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008147	CCT	2	6	56834	56839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_008147	CAG	2	6	56889	56894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008147	CGC	2	6	57054	57059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_008147	GCA	2	6	57080	57085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_008147	CGC	2	6	57687	57692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_008147	ACC	2	6	57708	57713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_008147	ACG	2	6	57721	57726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_008147	CGA	2	6	58892	58897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008147	CCG	2	6	58909	58914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_008147	GCC	2	6	58982	58987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_008147	CGC	2	6	59123	59128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_008147	TGC	2	6	59129	59134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_008147	GCC	2	6	62270	62275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_008147	ACG	2	6	62311	62316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_008147	ACC	2	6	62334	62339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_008147	CCG	2	6	63076	63081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_008147	TCC	2	6	66803	66808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_008147	AGC	2	6	66826	66831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_008147	GCC	2	6	72800	72805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.