MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium sp. MCS plasmid1

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008147	GC	3	6	312	317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008147	CA	3	6	1401	1406	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008147	CG	4	8	1831	1838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008147	CG	3	6	2710	2715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008147	GT	3	6	2736	2741	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008147	GT	3	6	3920	3925	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008147	AC	3	6	5790	5795	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_008147	GC	3	6	5976	5981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008147	CA	3	6	11541	11546	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008147	GT	3	6	11631	11636	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008147	GC	3	6	15907	15912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008147	GT	4	8	20441	20448	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008147	GC	3	6	20464	20469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008147	GC	3	6	39415	39420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008147	CA	3	6	46438	46443	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008147	CA	3	6	46527	46532	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008147	AC	3	6	51965	51970	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008147	CA	3	6	59154	59159	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_008147	CG	3	6	59181	59186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008147	CG	3	6	63192	63197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008147	GC	3	6	75478	75483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008147	CG	3	6	77737	77742	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008147	GC	3	6	90111	90116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008147	GC	3	6	90123	90128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008147	CT	3	6	93859	93864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008147	CG	4	8	93950	93957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008147	TC	3	6	96654	96659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008147	AT	3	6	96744	96749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008147	GC	3	6	104480	104485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008147	GC	3	6	104488	104493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008147	GC	3	6	104605	104610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008147	CG	3	6	107298	107303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008147	AG	4	8	109797	109804	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008147	GC	3	6	126736	126741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008147	GT	3	6	143524	143529	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008147	GC	3	6	144647	144652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008147	CA	3	6	144664	144669	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008147	CG	3	6	144766	144771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008147	GC	3	6	144875	144880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008147	AC	3	6	144983	144988	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008147	AC	4	8	148245	148252	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008147	GC	3	6	148342	148347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_008147	CG	3	6	148350	148355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008147	CG	3	6	148431	148436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_008147	CA	3	6	151878	151883	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008147	CG	3	6	151889	151894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008147	TC	3	6	161754	161759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008147	GC	3	6	164448	164453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008147	GA	3	6	170203	170208	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008147	GA	3	6	170710	170715	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008147	GT	3	6	177853	177858	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008147	GT	3	6	177941	177946	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008147	AC	3	6	180757	180762	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008147	CA	3	6	182567	182572	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008147	CG	3	6	183153	183158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008147	TG	3	6	183199	183204	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008147	TG	3	6	191600	191605	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008147	GT	3	6	205591	205596	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008147	TC	3	6	206171	206176	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008147	GC	3	6	206636	206641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008147	CG	3	6	206769	206774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_008147	GC	3	6	208379	208384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008147	GC	3	6	208579	208584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008147	TG	3	6	208831	208836	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008147	GC	3	6	208865	208870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008147	CG	4	8	209428	209435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_008147	CG	3	6	212936	212941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008147	GC	3	6	212942	212947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.