MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium sp. MCS chromosome

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008146	CGGGTC	2	12	39431	39442	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008146	CGCATG	2	12	39817	39828	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008146	TAGCGG	2	12	68005	68016	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_008146	ACGTCA	2	12	123813	123824	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008146	CAGCGC	2	12	242434	242445	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008146	CCGGAT	2	12	283214	283225	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008146	TTTCAC	2	12	388611	388622	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008146	CGGGCG	2	12	388710	388721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008146	ACGGTG	2	12	464440	464451	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_008146	CCCGAG	2	12	475848	475859	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008146	CGTGGT	2	12	506279	506290	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_008146	CCGGGC	4	24	508208	508231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008146	GGACAC	2	12	511030	511041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008146	CGTGCT	2	12	574001	574012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008146	GTGCTT	2	12	615450	615461	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_008146	CAGCCG	2	12	729627	729638	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008146	GCACCG	2	12	763855	763866	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008146	TTTTGG	2	12	776488	776499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008146	TCGCGC	2	12	824453	824464	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008146	CAGTGC	2	12	833167	833178	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008146	CTTGAC	2	12	853731	853742	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008146	GGGCCA	2	12	932774	932785	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008146	GTGATC	2	12	973367	973378	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_008146	CGATCA	2	12	974977	974988	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008146	CCGGCG	2	12	1012481	1012492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008146	GGCCGC	2	12	1021866	1021877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008146	GCCGAC	2	12	1081764	1081775	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008146	GATGAC	2	12	1132269	1132280	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_008146	AGCTGC	2	12	1132333	1132344	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008146	CGGTGA	2	12	1134599	1134610	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_008146	CTCAGA	3	18	1134611	1134628	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008146	TGCACG	2	12	1189273	1189284	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008146	AGACCG	2	12	1189670	1189681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008146	TCGAAG	2	12	1231654	1231665	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_008146	AGCGTG	2	12	1245379	1245390	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_008146	GAAGTA	2	12	1253811	1253822	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008146	GACGCC	2	12	1254733	1254744	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008146	GTCGCC	2	12	1412210	1412221	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008146	TACCGC	2	12	1527400	1527411	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008146	GACGCG	2	12	1547602	1547613	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008146	TGACGG	2	12	1547932	1547943	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_008146	TCGCGT	3	18	1591852	1591869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008146	GGCGAA	2	12	1611518	1611529	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_008146	GCGAAG	2	12	1628128	1628139	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_008146	GGCCCG	2	12	1659007	1659018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008146	CGAAGT	2	12	1755590	1755601	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_008146	AAGGGC	2	12	1756253	1756264	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_008146	CCGGTC	2	12	1770987	1770998	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008146	CTCGCC	4	24	1771503	1771526	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_008146	CTCGAT	2	12	1771893	1771904	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008146	AGATCG	2	12	1777471	1777482	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_008146	TCCACT	2	12	1811242	1811253	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008146	GTGCGG	2	12	1830255	1830266	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_008146	ACCGCG	2	12	1946231	1946242	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008146	CCGGGT	2	12	1974669	1974680	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008146	ACGCGA	2	12	2112242	2112253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_008146	TCTGGC	2	12	2175780	2175791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008146	TTCGAC	2	12	2176187	2176198	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008146	CAGTGA	2	12	2182955	2182966	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_008146	CGGCCG	2	12	2248477	2248488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008146	GACGGC	2	12	2477551	2477562	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008146	GTGGCG	2	12	2515360	2515371	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_008146	CCGGAA	2	12	2724594	2724605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008146	CGCGAC	2	12	2747692	2747703	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008146	CGCCCT	2	12	2763055	2763066	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_008146	GGCGCC	2	12	2774630	2774641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_008146	CATCAG	2	12	2785883	2785894	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008146	CGAACA	2	12	2836593	2836604	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008146	GTTTCA	2	12	2862847	2862858	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_008146	TCCCTC	2	12	3007129	3007140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_008146	GACGTC	2	12	3047522	3047533	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008146	GTGGGA	2	12	3147185	3147196	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008146	TCGCAG	2	12	3167487	3167498	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_008146	GCCTCG	2	12	3363175	3363186	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_008146	CCCGGG	2	12	3374438	3374449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_008146	GATGCC	2	12	3415015	3415026	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008146	AATTTC	2	12	3444193	3444204	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_008146	CTCAAC	2	12	3448120	3448131	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_008146	GTACCG	2	12	3603127	3603138	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008146	ACGCGG	2	12	3720791	3720802	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008146	CGCGGT	2	12	3780951	3780962	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008146	CACCGG	2	12	3795303	3795314	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
83	NC_008146	ACCGGA	2	12	3799775	3799786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008146	GCCGGG	2	12	3848145	3848156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008146	TGCCAC	2	12	3893001	3893012	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_008146	GGTCAC	2	12	3958437	3958448	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_008146	GAACCG	2	12	4140636	4140647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008146	GATCAT	2	12	4288647	4288658	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_008146	GACGCG	2	12	4320600	4320611	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008146	CGGCGC	2	12	4362292	4362303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_008146	GGGCCG	2	12	4396610	4396621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008146	CGTCTC	2	12	4446839	4446850	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_008146	GTCAGG	2	12	4477459	4477470	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_008146	TCGGCC	2	12	4498385	4498396	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
95	NC_008146	ACGGGT	2	12	4569756	4569767	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_008146	CACCGA	2	12	4642808	4642819	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
97	NC_008146	GACGTG	2	12	4653918	4653929	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_008146	ACCCGA	2	12	4757699	4757710	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_008146	ACTGGC	2	12	4824825	4824836	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008146	AGAACG	2	12	4841319	4841330	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_008146	CGCGCC	2	12	4869874	4869885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_008146	TGCGAG	2	12	5082713	5082724	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_008146	CACCGA	2	12	5082821	5082832	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
104	NC_008146	CGGCCA	2	12	5086795	5086806	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
105	NC_008146	GCAGCG	2	12	5119097	5119108	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008146	TGGCGG	2	12	5251756	5251767	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_008146	GACGGC	2	12	5314582	5314593	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_008146	GGGCGC	2	12	5348667	5348678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_008146	TGCCCG	2	12	5422694	5422705	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
110	NC_008146	TCCGCC	2	12	5501956	5501967	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_008146	AAGGAG	2	12	5581591	5581602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008146	CGACGG	2	12	5601819	5601830	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008146	GGAGAG	2	12	5662728	5662739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008146	GCCAAA	2	12	5674014	5674025	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.