MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium sp. MCS chromosome

Total Repeats: 381

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008146	CACGG	2	10	13170	13179	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_008146	CTCGC	2	10	20018	20027	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_008146	TTCAT	2	10	39801	39810	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_008146	AGACG	2	10	49911	49920	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_008146	CGTCT	2	10	49924	49933	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_008146	TGGGG	2	10	92623	92632	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008146	CGGCG	2	10	124106	124115	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8	NC_008146	ACGGT	2	10	161848	161857	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_008146	GCGCA	2	10	161904	161913	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_008146	GCTGT	2	10	179880	179889	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_008146	TCAGA	2	10	179917	179926	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_008146	GAGCG	2	10	186732	186741	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_008146	GTTCC	2	10	209412	209421	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_008146	GGGCG	2	10	229644	229653	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
15	NC_008146	GCGCC	2	10	291407	291416	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
16	NC_008146	CGGGA	2	10	312372	312381	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_008146	GGCGC	2	10	388730	388739	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
18	NC_008146	CCGGT	2	10	412023	412032	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_008146	TAGCC	2	10	412086	412095	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_008146	CGCAA	2	10	437253	437262	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_008146	TTCCG	2	10	456801	456810	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_008146	CCGCA	2	10	462177	462186	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_008146	ACGCC	2	10	471007	471016	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
24	NC_008146	ACGCG	2	10	506378	506387	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_008146	CTCGT	2	10	519359	519368	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_008146	GAGCG	2	10	575388	575397	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_008146	GCAAC	2	10	615558	615567	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_008146	TCGAG	2	10	639684	639693	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_008146	CGCTG	2	10	704647	704656	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_008146	ACCGA	2	10	716984	716993	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_008146	GTCGC	2	10	742684	742693	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_008146	GGACG	2	10	775983	775992	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_008146	CCGGG	2	10	786370	786379	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
34	NC_008146	CGAAA	2	10	827788	827797	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_008146	CGATT	2	10	829478	829487	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_008146	ACGTA	2	10	866233	866242	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_008146	TTGTC	2	10	873665	873674	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_008146	CGAAT	2	10	888720	888729	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_008146	GGTCG	2	10	904973	904982	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_008146	CTCGA	2	10	912079	912088	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_008146	GATGA	2	10	912138	912147	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008146	CCGCG	2	10	913006	913015	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
43	NC_008146	GTCGG	2	10	924488	924497	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
44	NC_008146	GCGAC	2	10	926650	926659	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_008146	ATGCC	2	10	927841	927850	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_008146	GCCGC	2	10	928422	928431	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
47	NC_008146	GGCGC	2	10	933221	933230	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
48	NC_008146	CTCAC	2	10	933648	933657	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
49	NC_008146	TGACC	2	10	936994	937003	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_008146	CGCGG	2	10	992088	992097	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
51	NC_008146	CCACC	2	10	1012855	1012864	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
52	NC_008146	CACGG	2	10	1015507	1015516	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_008146	GGGCG	2	10	1020845	1020854	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
54	NC_008146	GCGCA	2	10	1024169	1024178	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_008146	GGCCG	2	10	1025099	1025108	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
56	NC_008146	GGCGC	2	10	1027470	1027479	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
57	NC_008146	TGCGC	2	10	1027480	1027489	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_008146	ACTGC	2	10	1041113	1041122	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_008146	AGTCG	2	10	1046058	1046067	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_008146	ACAGA	2	10	1051525	1051534	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_008146	CACCT	2	10	1071761	1071770	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
62	NC_008146	TCCGC	2	10	1082083	1082092	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
63	NC_008146	GCTCG	2	10	1082117	1082126	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_008146	TTCGG	2	10	1103155	1103164	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_008146	CCGCG	2	10	1103203	1103212	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
66	NC_008146	GCCGG	2	10	1132017	1132026	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
67	NC_008146	CGTGA	2	10	1132252	1132261	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_008146	GGTTG	2	10	1151223	1151232	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008146	CGCTT	2	10	1153617	1153626	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_008146	GCGGT	2	10	1186689	1186698	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
71	NC_008146	CGGTG	2	10	1208790	1208799	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
72	NC_008146	GGGAG	2	10	1230287	1230296	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008146	GTGTG	2	10	1240680	1240689	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008146	GGTCA	2	10	1245118	1245127	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_008146	GCCGC	2	10	1245591	1245600	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
76	NC_008146	AGCGC	2	10	1257171	1257180	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_008146	CGAGC	2	10	1259102	1259111	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_008146	CGAGA	2	10	1294326	1294335	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_008146	GTTTC	2	10	1322530	1322539	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_008146	CGACC	2	10	1372172	1372181	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
81	NC_008146	CCGGC	2	10	1389947	1389956	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
82	NC_008146	TGCTG	2	10	1424349	1424358	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_008146	AGTCA	2	10	1440924	1440933	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_008146	ACTGC	2	10	1450065	1450074	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_008146	CGGTG	2	10	1456532	1456541	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_008146	GCCGT	2	10	1464615	1464624	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
87	NC_008146	GGCTC	2	10	1468117	1468126	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
88	NC_008146	CGGAT	2	10	1474523	1474532	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_008146	GTCCT	2	10	1491604	1491613	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_008146	GGCCG	2	10	1498631	1498640	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
91	NC_008146	GGCCG	2	10	1498657	1498666	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
92	NC_008146	GAATT	2	10	1498702	1498711	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008146	TCGGT	2	10	1510056	1510065	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_008146	CGGGC	2	10	1524944	1524953	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
95	NC_008146	AGCGC	2	10	1544056	1544065	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
96	NC_008146	TGCGT	2	10	1553344	1553353	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_008146	GCATC	2	10	1566923	1566932	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_008146	CGGTG	2	10	1575628	1575637	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
99	NC_008146	CGGTC	2	10	1577282	1577291	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_008146	CCGCA	2	10	1578500	1578509	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
101	NC_008146	CCAGG	2	10	1585804	1585813	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_008146	TGCGA	2	10	1591821	1591830	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_008146	ACGGC	2	10	1602223	1602232	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
104	NC_008146	CAAGG	2	10	1606154	1606163	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_008146	GCCCG	2	10	1608657	1608666	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
106	NC_008146	GCCGC	2	10	1608956	1608965	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
107	NC_008146	GACGG	2	10	1617298	1617307	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
108	NC_008146	ACTTC	2	10	1655838	1655847	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_008146	CCTCG	2	10	1658351	1658360	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
110	NC_008146	TCGCT	2	10	1728032	1728041	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_008146	CACCG	2	10	1730922	1730931	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
112	NC_008146	CGGCG	2	10	1740428	1740437	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
113	NC_008146	AGCCC	2	10	1743069	1743078	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
114	NC_008146	TCGCG	2	10	1749493	1749502	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
115	NC_008146	TTTTC	2	10	1753159	1753168	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_008146	CCGGT	2	10	1756420	1756429	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
117	NC_008146	GTGGG	2	10	1756950	1756959	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008146	TCGGA	2	10	1758634	1758643	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_008146	GGAGT	2	10	1770553	1770562	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008146	CGGCG	2	10	1771075	1771084	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
121	NC_008146	AATCG	2	10	1771191	1771200	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_008146	TGGTC	2	10	1778975	1778984	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_008146	GTCGG	2	10	1801579	1801588	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
124	NC_008146	TGAGT	2	10	1815839	1815848	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008146	GTACT	2	10	1817367	1817376	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_008146	CCGAT	2	10	1829809	1829818	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_008146	GTGCA	2	10	1835991	1836000	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_008146	GCACG	2	10	1845548	1845557	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
129	NC_008146	CGGCG	2	10	1848886	1848895	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
130	NC_008146	CCGGT	2	10	1857952	1857961	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
131	NC_008146	ACCGC	2	10	1857983	1857992	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
132	NC_008146	AGGCT	2	10	1862235	1862244	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_008146	GGCTC	2	10	1870841	1870850	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
134	NC_008146	ACCCG	2	10	1871275	1871284	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
135	NC_008146	GGTGG	2	10	1888898	1888907	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008146	GGAGA	2	10	1889537	1889546	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008146	GGGCG	2	10	1947010	1947019	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
138	NC_008146	GGGGC	2	10	1963525	1963534	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
139	NC_008146	TCTCG	2	10	1969111	1969120	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_008146	GGGTG	2	10	2031861	2031870	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008146	TGGGC	2	10	2032479	2032488	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
142	NC_008146	CGGGC	2	10	2108681	2108690	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
143	NC_008146	CCGGC	2	10	2117754	2117763	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
144	NC_008146	CCGGG	2	10	2122300	2122309	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
145	NC_008146	CCGCC	2	10	2190655	2190664	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
146	NC_008146	TGACC	2	10	2227429	2227438	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
147	NC_008146	GGCGC	2	10	2232501	2232510	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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152	NC_008146	CGCAG	2	10	2309882	2309891	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
153	NC_008146	TACGG	2	10	2317084	2317093	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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158	NC_008146	GGCGC	2	10	2367245	2367254	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
159	NC_008146	CGAAA	2	10	2413068	2413077	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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162	NC_008146	TCGCT	2	10	2431199	2431208	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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167	NC_008146	TGCGC	2	10	2578060	2578069	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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169	NC_008146	GGTGA	2	10	2628141	2628150	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_008146	GGTGG	2	10	2652106	2652115	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
172	NC_008146	CCCGG	2	10	2672004	2672013	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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181	NC_008146	ACACA	2	10	2793874	2793883	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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186	NC_008146	GTCCG	2	10	2858062	2858071	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
187	NC_008146	CGGTC	2	10	2865041	2865050	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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198	NC_008146	CTGCG	2	10	3047288	3047297	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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273	NC_008146	TACTG	2	10	4125633	4125642	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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276	NC_008146	CAGCG	2	10	4241062	4241071	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
277	NC_008146	GTCGG	2	10	4256157	4256166	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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280	NC_008146	CGAGA	2	10	4291272	4291281	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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282	NC_008146	GTCGC	2	10	4303397	4303406	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
283	NC_008146	CACCG	2	10	4324795	4324804	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
284	NC_008146	CATCT	2	10	4324854	4324863	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
285	NC_008146	ACCGC	2	10	4357041	4357050	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
286	NC_008146	GGTCA	2	10	4363301	4363310	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
287	NC_008146	TGCGT	2	10	4427051	4427060	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
288	NC_008146	GGCCG	2	10	4427149	4427158	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
289	NC_008146	TGCGC	2	10	4427557	4427566	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
290	NC_008146	CGGGA	2	10	4439238	4439247	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
291	NC_008146	GGTCG	2	10	4439252	4439261	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
292	NC_008146	TCCGA	2	10	4444138	4444147	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
293	NC_008146	CCCGG	2	10	4457418	4457427	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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301	NC_008146	TGAGA	2	10	4563709	4563718	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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332	NC_008146	CCGTT	2	10	5121588	5121597	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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344	NC_008146	GTTCT	2	10	5342669	5342678	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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379	NC_008146	GCTGC	2	10	5651330	5651339	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
380	NC_008146	CGTGT	2	10	5654399	5654408	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.