MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium sp. MCS chromosome

Total Repeats: 1097

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008146	TCAC	2	8	1618	1625	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008146	CCGC	2	8	1722	1729	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_008146	GTCC	2	8	1732	1739	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008146	CGAT	2	8	1919	1926	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_008146	GATA	2	8	6051	6058	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008146	GAAT	2	8	14922	14929	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008146	TCGT	2	8	26431	26438	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_008146	AGCG	2	8	26739	26746	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_008146	CGCT	2	8	26902	26909	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008146	CAGC	2	8	33383	33390	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008146	TTCG	2	8	33443	33450	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008146	TGGT	2	8	33539	33546	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008146	CTCG	2	8	33712	33719	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008146	GGCA	2	8	37504	37511	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_008146	TACC	2	8	38302	38309	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008146	ATCC	2	8	39616	39623	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008146	TCCG	2	8	39729	39736	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008146	CCGC	2	8	44920	44927	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19	NC_008146	GCTG	2	8	47049	47056	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_008146	CGGT	2	8	49085	49092	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_008146	ACGA	2	8	49254	49261	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_008146	CGGG	2	8	72123	72130	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_008146	GCGG	2	8	72180	72187	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_008146	CGGT	2	8	72354	72361	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008146	GACG	2	8	72391	72398	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_008146	GGTA	2	8	81595	81602	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008146	CCAC	2	8	81995	82002	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
28	NC_008146	GCCG	2	8	84077	84084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_008146	CGGC	2	8	89399	89406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008146	TCGG	2	8	94661	94668	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_008146	GAAT	2	8	98211	98218	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008146	GGGC	2	8	104641	104648	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_008146	GGTT	2	8	104654	104661	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008146	AGGA	2	8	104682	104689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008146	GCCG	2	8	108646	108653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_008146	CGGC	2	8	113019	113026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008146	TCCT	2	8	117935	117942	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008146	GACC	2	8	122764	122771	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008146	CTGA	2	8	127131	127138	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_008146	CCGG	2	8	145296	145303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008146	CCCG	2	8	145336	145343	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_008146	GCCG	2	8	166433	166440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_008146	CGGC	2	8	167525	167532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008146	AGGC	2	8	175484	175491	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_008146	TCCG	2	8	179861	179868	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008146	GCGG	2	8	182834	182841	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_008146	ACGC	2	8	186715	186722	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008146	CTTC	2	8	213643	213650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008146	CGCA	2	8	220816	220823	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008146	CGGT	2	8	227305	227312	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008146	GAGG	2	8	231383	231390	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008146	CGGC	2	8	231409	231416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008146	CGCA	2	8	231532	231539	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008146	TGGG	2	8	234861	234868	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008146	TCGC	2	8	236984	236991	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008146	GCCC	2	8	237204	237211	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
57	NC_008146	CGAC	2	8	239585	239592	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_008146	GAGG	2	8	247486	247493	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008146	CCAC	2	8	253238	253245	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
60	NC_008146	GATT	2	8	260928	260935	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008146	CGGG	2	8	264864	264871	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_008146	CGCC	2	8	268605	268612	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
63	NC_008146	CGTG	2	8	294916	294923	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_008146	GCGG	2	8	295828	295835	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
65	NC_008146	GACC	2	8	297587	297594	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008146	GACG	2	8	311396	311403	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_008146	TTCA	2	8	338124	338131	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_008146	CGTC	2	8	338168	338175	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_008146	GTCA	2	8	342919	342926	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_008146	GGAC	2	8	358412	358419	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_008146	CCGG	2	8	365554	365561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008146	TCGC	2	8	366884	366891	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_008146	GATC	3	12	368733	368744	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_008146	GATC	3	12	369435	369446	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_008146	CAGC	2	8	400488	400495	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_008146	TTGG	2	8	409459	409466	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008146	ACAG	2	8	421389	421396	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_008146	CAGG	2	8	422761	422768	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_008146	ACCC	2	8	422832	422839	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
80	NC_008146	CGGG	2	8	423526	423533	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
81	NC_008146	GGGC	2	8	431542	431549	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
82	NC_008146	CCGA	2	8	432771	432778	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_008146	GCAG	2	8	439723	439730	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_008146	TGGG	2	8	443379	443386	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008146	CGTT	2	8	448909	448916	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_008146	AAGA	2	8	456470	456477	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008146	GGGT	2	8	461399	461406	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008146	GTCA	2	8	462097	462104	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_008146	CGCA	2	8	462140	462147	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008146	TCGC	2	8	466060	466067	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_008146	TCCT	2	8	472350	472357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_008146	GTCG	2	8	472362	472369	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_008146	CCGA	2	8	475778	475785	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_008146	GCCC	2	8	475800	475807	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
95	NC_008146	GGCT	2	8	476820	476827	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_008146	ACGA	2	8	478322	478329	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_008146	GGCC	2	8	478337	478344	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_008146	GTGC	2	8	490247	490254	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_008146	GACT	2	8	498073	498080	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_008146	CACT	2	8	498664	498671	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_008146	GGCG	2	8	505502	505509	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
102	NC_008146	CCGA	2	8	505510	505517	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_008146	GCGT	2	8	506083	506090	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_008146	GAGG	2	8	506211	506218	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008146	GGGC	2	8	506264	506271	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_008146	AGCG	2	8	519402	519409	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_008146	CCGC	2	8	519827	519834	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
108	NC_008146	GGTC	2	8	530112	530119	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_008146	CGGG	2	8	544803	544810	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
110	NC_008146	GGCG	2	8	579980	579987	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
111	NC_008146	GTAA	2	8	593994	594001	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008146	GTGC	2	8	594028	594035	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_008146	TAGT	2	8	594048	594055	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008146	AGGG	2	8	604231	604238	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008146	TCGC	2	8	608870	608877	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_008146	TCGG	2	8	608947	608954	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_008146	GGGC	2	8	615312	615319	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
118	NC_008146	TCCG	2	8	616964	616971	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_008146	CCGA	2	8	625288	625295	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_008146	CGGA	2	8	639440	639447	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_008146	CGAT	2	8	648858	648865	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_008146	GGGC	2	8	664475	664482	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_008146	CGTG	2	8	664500	664507	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_008146	CGCT	2	8	668540	668547	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_008146	CCGT	2	8	669277	669284	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_008146	CGAC	2	8	669300	669307	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_008146	GGCG	2	8	671063	671070	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
128	NC_008146	GCCG	2	8	678678	678685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_008146	CATT	2	8	687867	687874	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_008146	GCTA	2	8	705997	706004	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_008146	CCCG	2	8	723061	723068	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
132	NC_008146	GTAG	2	8	729482	729489	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008146	GCCG	2	8	729603	729610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_008146	ACGC	2	8	742640	742647	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_008146	GTCC	2	8	754593	754600	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_008146	ACTG	2	8	757308	757315	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_008146	GGCG	2	8	763769	763776	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
138	NC_008146	CGGT	2	8	763899	763906	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_008146	ATTG	2	8	772799	772806	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008146	GCGG	2	8	786409	786416	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
141	NC_008146	CCCG	2	8	793233	793240	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
142	NC_008146	GGAG	2	8	798580	798587	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008146	TTCC	2	8	800958	800965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_008146	CGGT	2	8	832734	832741	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_008146	GGTC	2	8	833855	833862	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_008146	CAAA	2	8	834199	834206	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_008146	GTCC	2	8	849829	849836	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_008146	CCAG	2	8	851468	851475	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_008146	GAAA	2	8	852832	852839	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008146	CTGA	2	8	865543	865550	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_008146	CGTG	2	8	865985	865992	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_008146	GTGC	2	8	881897	881904	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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159	NC_008146	TACG	2	8	912641	912648	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
160	NC_008146	GGCC	2	8	912908	912915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
161	NC_008146	GTCG	2	8	919192	919199	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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169	NC_008146	GTCT	2	8	928827	928834	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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172	NC_008146	GCCC	2	8	933065	933072	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
173	NC_008146	CCTG	2	8	936035	936042	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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185	NC_008146	TGCG	2	8	1012217	1012224	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
186	NC_008146	TGCG	2	8	1012580	1012587	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
187	NC_008146	TCGG	2	8	1015929	1015936	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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189	NC_008146	TCCG	2	8	1020724	1020731	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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191	NC_008146	GCCC	2	8	1021087	1021094	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
192	NC_008146	TTGC	2	8	1021717	1021724	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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198	NC_008146	CGAG	2	8	1026769	1026776	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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201	NC_008146	CTGG	2	8	1027524	1027531	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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274	NC_008146	CTGT	2	8	1288321	1288328	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
275	NC_008146	ATGA	2	8	1288439	1288446	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_008146	ATCG	2	8	1326715	1326722	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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285	NC_008146	CCTG	2	8	1392870	1392877	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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289	NC_008146	GTAA	2	8	1395480	1395487	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_008146	GCCG	2	8	1409450	1409457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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431	NC_008146	GCCC	2	8	2055193	2055200	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
432	NC_008146	GGCG	2	8	2079429	2079436	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
433	NC_008146	CCGG	2	8	2079992	2079999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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437	NC_008146	ACCC	2	8	2102788	2102795	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
438	NC_008146	GCCG	2	8	2104243	2104250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
439	NC_008146	GCCC	2	8	2117781	2117788	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
440	NC_008146	GCAA	2	8	2117794	2117801	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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450	NC_008146	ACGC	2	8	2176248	2176255	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
451	NC_008146	CTGC	2	8	2176319	2176326	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
452	NC_008146	ACGG	2	8	2189120	2189127	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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464	NC_008146	CTGC	2	8	2360787	2360794	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
465	NC_008146	TCCC	2	8	2362861	2362868	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
466	NC_008146	GGTG	2	8	2362965	2362972	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
467	NC_008146	GGTC	2	8	2370325	2370332	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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473	NC_008146	CAGC	2	8	2412907	2412914	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
474	NC_008146	TTTC	2	8	2436314	2436321	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
475	NC_008146	TACG	2	8	2436326	2436333	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
476	NC_008146	CGCC	2	8	2446117	2446124	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
477	NC_008146	CTCG	2	8	2481812	2481819	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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480	NC_008146	CGGC	2	8	2515538	2515545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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482	NC_008146	ACCG	2	8	2527951	2527958	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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485	NC_008146	CTGA	2	8	2550345	2550352	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
486	NC_008146	GTGG	2	8	2550356	2550363	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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493	NC_008146	CGCT	2	8	2578084	2578091	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
494	NC_008146	CCGT	2	8	2579847	2579854	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
495	NC_008146	GCGA	2	8	2586862	2586869	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
496	NC_008146	CCCA	2	8	2593759	2593766	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
497	NC_008146	CGAC	2	8	2624002	2624009	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
498	NC_008146	CGGT	2	8	2628185	2628192	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
499	NC_008146	AGCC	2	8	2628253	2628260	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
500	NC_008146	TGCG	2	8	2628347	2628354	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

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