MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis Antiqua plasmid pCD

Total Repeats: 692

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008122	GCC	2	6	216	221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793643
2	NC_008122	CGC	2	6	230	235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793643
3	NC_008122	CTG	2	6	239	244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793643
4	NC_008122	GAC	2	6	449	454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793643
5	NC_008122	CTT	2	6	606	611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793643
6	NC_008122	TGG	2	6	612	617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793643
7	NC_008122	AGC	2	6	971	976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793643
8	NC_008122	TGA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793643
9	NC_008122	CAT	2	6	1063	1068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793643
10	NC_008122	TGA	2	6	1108	1113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793643
11	NC_008122	GAA	2	6	1254	1259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793644
12	NC_008122	TCA	2	6	1271	1276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793644
13	NC_008122	CGG	2	6	1315	1320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793644
14	NC_008122	CAG	3	9	1519	1527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793644
15	NC_008122	ACG	2	6	1575	1580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793644
16	NC_008122	TCA	2	6	1612	1617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793644
17	NC_008122	TGA	2	6	1619	1624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793644
18	NC_008122	GAA	2	6	1650	1655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793644
19	NC_008122	TTC	2	6	1665	1670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793644
20	NC_008122	GCA	2	6	1761	1766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793644
21	NC_008122	TGG	2	6	1914	1919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793722
22	NC_008122	CGT	2	6	1945	1950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793722
23	NC_008122	TCG	2	6	1980	1985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793722
24	NC_008122	CCA	2	6	2035	2040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793722
25	NC_008122	GTA	2	6	2058	2063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793722
26	NC_008122	CCG	2	6	2077	2082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793722
27	NC_008122	CTT	2	6	2123	2128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793722
28	NC_008122	TTC	2	6	2167	2172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793722
29	NC_008122	GCC	2	6	2732	2737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793645
30	NC_008122	GGC	2	6	2752	2757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793645
31	NC_008122	AAT	2	6	2765	2770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793645
32	NC_008122	GTT	2	6	2790	2795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793645
33	NC_008122	TAA	2	6	2866	2871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793645
34	NC_008122	GAC	2	6	2886	2891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793645
35	NC_008122	CGG	2	6	2943	2948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793645
36	NC_008122	TGA	2	6	2957	2962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793645
37	NC_008122	GAC	2	6	2994	2999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793645
38	NC_008122	TTG	2	6	3031	3036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793645
39	NC_008122	TTA	2	6	3039	3044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793645
40	NC_008122	AAT	2	6	3375	3380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793646
41	NC_008122	TGT	2	6	3646	3651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793646
42	NC_008122	TTG	2	6	3756	3761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793646
43	NC_008122	GTT	2	6	3832	3837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793646
44	NC_008122	TAT	2	6	3903	3908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793646
45	NC_008122	TGC	2	6	4073	4078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793647
46	NC_008122	AGC	2	6	4170	4175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793647
47	NC_008122	AAT	2	6	4187	4192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793647
48	NC_008122	AAT	2	6	4224	4229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793647
49	NC_008122	TGT	2	6	4230	4235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793647
50	NC_008122	AGC	2	6	4394	4399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793647
51	NC_008122	ATG	2	6	4456	4461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793647
52	NC_008122	CAT	2	6	4529	4534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793647
53	NC_008122	CTT	2	6	4537	4542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793648
54	NC_008122	ACA	2	6	4602	4607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793648
55	NC_008122	TAT	2	6	4749	4754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793648
56	NC_008122	CTG	2	6	4800	4805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793648
57	NC_008122	TGC	2	6	4831	4836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793648
58	NC_008122	CTT	2	6	4843	4848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793648
59	NC_008122	CTC	2	6	5083	5088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108793648
60	NC_008122	CTT	2	6	5142	5147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793648
61	NC_008122	TTC	2	6	5338	5343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793649
62	NC_008122	CCT	2	6	5469	5474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108793649
63	NC_008122	GAG	2	6	5476	5481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108793649
64	NC_008122	TCT	2	6	5504	5509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793649
65	NC_008122	ATT	2	6	5531	5536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793649
66	NC_008122	GTT	2	6	5543	5548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793649
67	NC_008122	TCC	2	6	5567	5572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108793649
68	NC_008122	CTG	2	6	5815	5820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793650
69	NC_008122	ACA	2	6	5858	5863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793650
70	NC_008122	AGG	2	6	5941	5946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108793650
71	NC_008122	ATA	2	6	5956	5961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793650
72	NC_008122	TGC	2	6	5963	5968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793650
73	NC_008122	TTG	2	6	6282	6287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793651
74	NC_008122	TCA	2	6	6314	6319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793651
75	NC_008122	CTT	2	6	6350	6355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793651
76	NC_008122	CTT	2	6	6392	6397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793651
77	NC_008122	TTA	2	6	6551	6556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793652
78	NC_008122	TGT	2	6	6563	6568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793652
79	NC_008122	TGC	2	6	6610	6615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793652
80	NC_008122	CTG	2	6	6648	6653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793652
81	NC_008122	CTT	2	6	6655	6660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793652
82	NC_008122	AAT	2	6	6757	6762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793723
83	NC_008122	CAC	2	6	6822	6827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793723
84	NC_008122	CAT	2	6	6832	6837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793723
85	NC_008122	CTC	2	6	6913	6918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108793723
86	NC_008122	TGA	2	6	7054	7059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793653
87	NC_008122	TGT	2	6	7195	7200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793653
88	NC_008122	TCA	2	6	7225	7230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793653
89	NC_008122	AGC	2	6	7366	7371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793653
90	NC_008122	GCA	2	6	7388	7393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793653
91	NC_008122	TTC	2	6	7530	7535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793653
92	NC_008122	TGC	2	6	7538	7543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793653
93	NC_008122	TAA	2	6	7629	7634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793653
94	NC_008122	AGC	2	6	7683	7688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793653
95	NC_008122	CTT	2	6	7709	7714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793653
96	NC_008122	CAA	2	6	7718	7723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793653
97	NC_008122	AGC	2	6	7765	7770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793653
98	NC_008122	CAA	2	6	7788	7793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793653
99	NC_008122	AAG	2	6	7953	7958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793653
100	NC_008122	CTT	2	6	7982	7987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793653
101	NC_008122	GTA	2	6	7988	7993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793653
102	NC_008122	CTT	2	6	8024	8029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793653
103	NC_008122	GAT	2	6	8295	8300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793654
104	NC_008122	CTT	2	6	8329	8334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793654
105	NC_008122	TAA	2	6	8369	8374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793654
106	NC_008122	TCA	2	6	8406	8411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793654
107	NC_008122	ATG	2	6	8459	8464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793654
108	NC_008122	AAT	2	6	8480	8485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793654
109	NC_008122	GAT	2	6	8495	8500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793654
110	NC_008122	CGG	2	6	8538	8543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793654
111	NC_008122	ACC	2	6	8621	8626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793654
112	NC_008122	AAT	2	6	8627	8632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793654
113	NC_008122	GCA	2	6	8800	8805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793654
114	NC_008122	CTT	2	6	8839	8844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793654
115	NC_008122	AAC	2	6	8927	8932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793654
116	NC_008122	GTT	2	6	9048	9053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793654
117	NC_008122	ACC	2	6	9060	9065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793654
118	NC_008122	TGA	2	6	9066	9071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793654
119	NC_008122	TTG	2	6	9072	9077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793654
120	NC_008122	TAT	2	6	9236	9241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793654
121	NC_008122	TTG	2	6	9329	9334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793654
122	NC_008122	AGC	2	6	9383	9388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793654
123	NC_008122	TCA	2	6	9396	9401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793654
124	NC_008122	TGT	2	6	9495	9500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793654
125	NC_008122	GAG	2	6	9541	9546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108793654
126	NC_008122	CAT	2	6	9715	9720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793654
127	NC_008122	TAC	2	6	9821	9826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793654
128	NC_008122	CAT	2	6	9835	9840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793654
129	NC_008122	TAA	2	6	9860	9865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793654
130	NC_008122	GTT	2	6	10083	10088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793655
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256	NC_008122	CAT	2	6	20911	20916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793667
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259	NC_008122	GGT	2	6	21141	21146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793667
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383	NC_008122	TAA	2	6	30606	30611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793679
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409	NC_008122	GTC	2	6	33205	33210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793682
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