MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis Antiqua plasmid pMT

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008120	CAGGAG	2	12	410	421	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	108793533
2	NC_008120	ATAGTG	2	12	3004	3015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793536
3	NC_008120	GCTGAA	2	12	5263	5274	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	108793536
4	NC_008120	GTGCCA	2	12	5758	5769	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	108793536
5	NC_008120	CGAGTT	2	12	11314	11325	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	108793539
6	NC_008120	AGTGAT	2	12	19591	19602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793547
7	NC_008120	GTTACG	2	12	22697	22708	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	108793553
8	NC_008120	AACGGT	2	12	24273	24284	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	108793555
9	NC_008120	GGCTGC	2	12	27022	27033	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	108793557
10	NC_008120	GACGCC	2	12	29453	29464	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	108793560
11	NC_008120	GGTGGC	2	12	33466	33477	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	108793565
12	NC_008120	CGCGCC	2	12	39017	39028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793572
13	NC_008120	TGTGGT	2	12	40990	41001	0 %	50 %	50 %	0 %	108793573
14	NC_008120	TGGATA	2	12	45065	45076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793576
15	NC_008120	CAGGAG	2	12	48326	48337	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	108793581
16	NC_008120	AGGGTT	2	12	49941	49952	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	108793625
17	NC_008120	GCCAGT	2	12	52573	52584	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	108793584
18	NC_008120	TCAGCA	2	12	52867	52878	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	108793585
19	NC_008120	TGCTTG	2	12	53339	53350	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	108793586
20	NC_008120	TCGCCA	2	12	53405	53416	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	108793586
21	NC_008120	CGCCAG	2	12	56883	56894	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	108793590
22	NC_008120	ACACGC	2	12	57743	57754	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	108793591
23	NC_008120	CGCCAG	2	12	61283	61294	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	108793592
24	NC_008120	CGTCCA	2	12	61825	61836	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	108793592
25	NC_008120	GCTCCT	2	12	65465	65476	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	108793595
26	NC_008120	TACGGT	2	12	69244	69255	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	108793627
27	NC_008120	TAATTG	2	12	69588	69599	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	108793627
28	NC_008120	AATTCA	2	12	70460	70471	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	108793601
29	NC_008120	TTCTTT	2	12	72891	72902	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	108793602
30	NC_008120	CATGTT	2	12	80624	80635	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	108793607
31	NC_008120	CGCTTT	2	12	84014	84025	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	108793611
32	NC_008120	ACCCCT	2	12	86349	86360	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	108793613
33	NC_008120	GTTATT	2	12	88577	88588	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	108793615
34	NC_008120	CCAGGA	2	12	93075	93086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793620
35	NC_008120	TCGGCT	2	12	94917	94928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793622

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.