MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Antiqua plasmid pMT

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008120	AACG	2	8	6	13	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008120	CTAC	3	12	2011	2022	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008120	CCAA	2	8	2712	2719	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008120	ACTT	2	8	5869	5876	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_008120	AAAG	2	8	5891	5898	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008120	TTAC	2	8	23173	23180	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_008120	TAGG	2	8	26544	26551	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008120	TACT	3	12	32084	32095	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_008120	ATTT	2	8	35116	35123	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008120	ATAA	3	12	35268	35279	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008120	ACCT	2	8	37035	37042	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008120	TAAG	2	8	41722	41729	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008120	CCTG	2	8	42151	42158	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008120	TCGT	2	8	43264	43271	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_008120	GTTT	2	8	44443	44450	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008120	ACCA	2	8	44668	44675	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008120	AATG	2	8	45992	45999	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008120	TGAA	2	8	46257	46264	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008120	TGGT	2	8	46412	46419	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008120	TTAT	2	8	47488	47495	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008120	TCAT	2	8	50246	50253	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_008120	AGTA	2	8	51473	51480	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008120	CGAG	2	8	54978	54985	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_008120	TACT	2	8	55002	55009	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008120	GAAA	2	8	55500	55507	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008120	GAAG	2	8	55526	55533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008120	TCGT	2	8	61996	62003	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_008120	AGTA	2	8	62038	62045	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008120	TAGG	2	8	66491	66498	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008120	GAAA	2	8	66896	66903	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008120	CACT	2	8	68477	68484	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008120	GAAA	2	8	68750	68757	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008120	AGGG	2	8	68767	68774	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008120	TTTA	2	8	73266	73273	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008120	CTTG	2	8	73310	73317	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008120	AGCC	2	8	74503	74510	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008120	GCTG	2	8	74585	74592	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008120	AACC	2	8	74621	74628	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008120	GATA	2	8	78439	78446	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008120	GCAA	2	8	78540	78547	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008120	CAGG	2	8	78591	78598	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_008120	GCTG	2	8	78652	78659	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_008120	CATA	2	8	82149	82156	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_008120	CCTG	2	8	84719	84726	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_008120	ATCT	2	8	85514	85521	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_008120	TTTG	2	8	87770	87777	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008120	AATG	2	8	89493	89500	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008120	CCAG	2	8	90220	90227	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008120	TCGC	2	8	92758	92765	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008120	CTGC	2	8	93470	93477	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.