MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Yersinia pestis Antiqua plasmid pMT

Total Repeats: 1250

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008120	GCC	2	6	217	222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793533
2	NC_008120	CGC	2	6	231	236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793533
3	NC_008120	CTG	2	6	240	245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793533
4	NC_008120	GAC	2	6	450	455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793533
5	NC_008120	CTT	2	6	607	612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793533
6	NC_008120	TGG	2	6	613	618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793533
7	NC_008120	AGC	2	6	972	977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793533
8	NC_008120	TGA	2	6	1027	1032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793533
9	NC_008120	CAT	2	6	1064	1069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793533
10	NC_008120	TGA	2	6	1109	1114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793533
11	NC_008120	GAA	2	6	1255	1260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793534
12	NC_008120	TCA	2	6	1272	1277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793534
13	NC_008120	CGG	2	6	1316	1321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793534
14	NC_008120	CAG	3	9	1520	1528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793534
15	NC_008120	ACG	2	6	1576	1581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793534
16	NC_008120	TCA	2	6	1613	1618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793534
17	NC_008120	TGA	2	6	1620	1625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793534
18	NC_008120	GAA	2	6	1651	1656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793534
19	NC_008120	TTC	2	6	1666	1671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793534
20	NC_008120	GCA	2	6	1762	1767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793534
21	NC_008120	TGG	2	6	1915	1920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008120	CGT	2	6	1946	1951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008120	TGA	2	6	1960	1965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008120	TCT	2	6	2046	2051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793535
25	NC_008120	TCA	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793535
26	NC_008120	TTG	2	6	2204	2209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793535
27	NC_008120	TTC	2	6	2217	2222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793535
28	NC_008120	TCT	2	6	2266	2271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793535
29	NC_008120	CTT	2	6	2275	2280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793535
30	NC_008120	GAT	2	6	2419	2424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793535
31	NC_008120	CTT	2	6	2425	2430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793535
32	NC_008120	GTC	2	6	2484	2489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793535
33	NC_008120	GGT	2	6	2490	2495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793535
34	NC_008120	CAG	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793535
35	NC_008120	CAG	2	6	3119	3124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793536
36	NC_008120	ACT	2	6	3156	3161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793536
37	NC_008120	CTG	2	6	3192	3197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793536
38	NC_008120	TGT	2	6	3396	3401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793536
39	NC_008120	ACA	2	6	3479	3484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793536
40	NC_008120	ATC	2	6	3511	3516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793536
41	NC_008120	GCC	2	6	3556	3561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793536
42	NC_008120	ATG	2	6	3601	3606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793536
43	NC_008120	GGT	2	6	3673	3678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793536
44	NC_008120	ACT	2	6	3684	3689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793536
45	NC_008120	AAC	2	6	3757	3762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793536
46	NC_008120	ATT	2	6	3774	3779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793536
47	NC_008120	CTG	2	6	3884	3889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793536
48	NC_008120	ACC	2	6	4064	4069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793536
49	NC_008120	AAT	2	6	4126	4131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793536
50	NC_008120	CAA	2	6	4200	4205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793536
51	NC_008120	GCT	2	6	4271	4276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793536
52	NC_008120	GCA	2	6	4330	4335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793536
53	NC_008120	CAA	2	6	4376	4381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793536
54	NC_008120	CAG	3	9	4430	4438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793536
55	NC_008120	ACT	2	6	4575	4580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793536
56	NC_008120	AAC	2	6	4587	4592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793536
57	NC_008120	CTG	2	6	4596	4601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793536
58	NC_008120	GTT	2	6	4606	4611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793536
59	NC_008120	TGC	2	6	4625	4630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793536
60	NC_008120	CCG	2	6	4733	4738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793536
61	NC_008120	GCT	2	6	4765	4770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793536
62	NC_008120	AGC	2	6	4833	4838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793536
63	NC_008120	CAT	2	6	4886	4891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793536
64	NC_008120	GCT	2	6	4993	4998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793536
65	NC_008120	AGC	4	12	5004	5015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793536
66	NC_008120	GAA	2	6	5074	5079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793536
67	NC_008120	GCA	2	6	5095	5100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793536
68	NC_008120	CGA	2	6	5426	5431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793536
69	NC_008120	TCA	2	6	5488	5493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793536
70	NC_008120	TGA	2	6	5597	5602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793536
71	NC_008120	TTG	2	6	5695	5700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793536
72	NC_008120	CCG	2	6	5906	5911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793537
73	NC_008120	AAC	2	6	6027	6032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793537
74	NC_008120	TTA	2	6	6090	6095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793537
75	NC_008120	AGA	2	6	6109	6114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793537
76	NC_008120	GCT	2	6	6138	6143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793537
77	NC_008120	ACC	2	6	6317	6322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793537
78	NC_008120	CAG	2	6	6493	6498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793537
79	NC_008120	ATA	2	6	6519	6524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793537
80	NC_008120	TAA	2	6	6650	6655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793538
81	NC_008120	CTG	2	6	6703	6708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793538
82	NC_008120	TCC	2	6	6764	6769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108793538
83	NC_008120	TAG	2	6	6782	6787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793538
84	NC_008120	CTG	2	6	6842	6847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793538
85	NC_008120	GCA	2	6	6959	6964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793538
86	NC_008120	GTT	2	6	6985	6990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793538
87	NC_008120	CGC	2	6	7263	7268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793538
88	NC_008120	GCA	2	6	7298	7303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793538
89	NC_008120	CTT	2	6	7309	7314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793538
90	NC_008120	TGC	2	6	7340	7345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793538
91	NC_008120	AGC	2	6	7447	7452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793538
92	NC_008120	TCT	2	6	7634	7639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793538
93	NC_008120	CGG	2	6	7644	7649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793538
94	NC_008120	GTG	2	6	7781	7786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793538
95	NC_008120	TCG	2	6	7856	7861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793538
96	NC_008120	TTC	2	6	7978	7983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793538
97	NC_008120	TCG	2	6	8009	8014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793538
98	NC_008120	TCT	2	6	8022	8027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793538
99	NC_008120	ATT	2	6	8047	8052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793538
100	NC_008120	CGG	2	6	8187	8192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793538
101	NC_008120	GGA	2	6	8209	8214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108793538
102	NC_008120	TTG	2	6	8401	8406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793538
103	NC_008120	CGT	2	6	8412	8417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793538
104	NC_008120	TCC	2	6	8600	8605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108793538
105	NC_008120	AGC	2	6	8606	8611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793538
106	NC_008120	CGG	2	6	8698	8703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793538
107	NC_008120	GTG	2	6	8783	8788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793538
108	NC_008120	GGC	2	6	8791	8796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793538
109	NC_008120	GGC	2	6	8942	8947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793538
110	NC_008120	TGA	2	6	8979	8984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793538
111	NC_008120	GTT	2	6	9106	9111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793538
112	NC_008120	ACG	2	6	9121	9126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793538
113	NC_008120	TGT	2	6	9264	9269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793538
114	NC_008120	ATT	2	6	9319	9324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793538
115	NC_008120	TCA	2	6	9432	9437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793538
116	NC_008120	CAG	2	6	9745	9750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793538
117	NC_008120	ACG	2	6	9826	9831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793538
118	NC_008120	CCT	2	6	9837	9842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108793538
119	NC_008120	TTG	3	9	9884	9892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793538
120	NC_008120	CAT	2	6	9979	9984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793538
121	NC_008120	CCA	2	6	10025	10030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793538
122	NC_008120	AGA	2	6	10035	10040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793538
123	NC_008120	TTC	2	6	10156	10161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793538
124	NC_008120	ACA	2	6	10287	10292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793538
125	NC_008120	CGA	2	6	10470	10475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793538
126	NC_008120	GCA	2	6	10542	10547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793538
127	NC_008120	GTA	2	6	10600	10605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793538
128	NC_008120	CGT	2	6	10821	10826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793538
129	NC_008120	ATC	2	6	10972	10977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793538
130	NC_008120	CCA	2	6	11001	11006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793538
131	NC_008120	TCG	2	6	11072	11077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793538
132	NC_008120	TCT	3	9	11148	11156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793538
133	NC_008120	CTT	2	6	11184	11189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_008120	GAA	2	6	11213	11218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793539
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138	NC_008120	TGT	2	6	11529	11534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793539
139	NC_008120	CAT	2	6	11545	11550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793539
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153	NC_008120	TGG	2	6	12672	12677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793541
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161	NC_008120	TTC	2	6	13258	13263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_008120	ATA	2	6	13305	13310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_008120	CAC	2	6	13422	13427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793542
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169	NC_008120	TTG	2	6	14142	14147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793543
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251	NC_008120	ATG	2	6	20686	20691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793549
252	NC_008120	CGT	2	6	20694	20699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793549
253	NC_008120	CGA	2	6	20761	20766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793550
254	NC_008120	TCA	2	6	20812	20817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793550
255	NC_008120	ACG	2	6	20941	20946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793550
256	NC_008120	TTC	2	6	20995	21000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793550
257	NC_008120	AAT	2	6	21129	21134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_008120	CAG	2	6	21187	21192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793551
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377	NC_008120	CAG	2	6	30004	30009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793561
378	NC_008120	GTT	3	9	30025	30033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793561
379	NC_008120	TTC	2	6	30141	30146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793562
380	NC_008120	GTC	2	6	30159	30164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793562
381	NC_008120	CCA	2	6	30166	30171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793562
382	NC_008120	TCG	2	6	30258	30263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793562
383	NC_008120	CAG	2	6	30386	30391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793562
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385	NC_008120	TTG	2	6	30444	30449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793562
386	NC_008120	GCA	2	6	30514	30519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793562
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402	NC_008120	CTG	2	6	31291	31296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793563
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500	NC_008120	AAC	2	6	41661	41666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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