MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Antiqua plasmid pMT

Total Repeats: 160

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008120	TGG	2	6	1915	1920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008120	CGT	2	6	1946	1951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008120	TGA	2	6	1960	1965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008120	CTT	2	6	11184	11189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008120	TTC	2	6	13258	13263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008120	ATA	2	6	13305	13310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008120	CAG	2	6	18555	18560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008120	AAT	2	6	21129	21134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008120	GGC	2	6	22431	22436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008120	GCC	2	6	22440	22445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_008120	AAC	2	6	28501	28506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008120	TAA	2	6	28593	28598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008120	ATA	2	6	32096	32101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008120	TAA	2	6	35006	35011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008120	TTA	2	6	35026	35031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008120	GAA	2	6	35176	35181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008120	AGT	2	6	36141	36146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008120	CGA	2	6	36147	36152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008120	TCC	2	6	36289	36294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_008120	TTG	2	6	36868	36873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008120	TCT	2	6	40470	40475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008120	AAC	2	6	41661	41666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008120	ACA	2	6	41671	41676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008120	AGA	2	6	41683	41688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008120	CAG	2	6	41825	41830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008120	TAT	2	6	41961	41966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008120	CGG	2	6	42082	42087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008120	TAT	2	6	43099	43104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008120	TCT	2	6	43158	43163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008120	ACT	2	6	43168	43173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008120	GCC	3	9	43298	43306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_008120	ATT	2	6	44132	44137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008120	AAT	2	6	44152	44157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008120	AGA	2	6	44180	44185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008120	ATA	2	6	44283	44288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008120	AGG	2	6	44348	44353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008120	CCA	2	6	44451	44456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_008120	TGA	2	6	44721	44726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008120	CCA	2	6	44756	44761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_008120	AAC	3	9	45943	45951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008120	GTT	2	6	46246	46251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008120	CAC	2	6	46305	46310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_008120	TTG	2	6	47474	47479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008120	GCC	2	6	49058	49063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_008120	CTT	2	6	50260	50265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008120	TTG	2	6	50339	50344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008120	ATA	2	6	50348	50353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008120	ATA	2	6	51467	51472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008120	ATA	2	6	54990	54995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008120	ATC	2	6	55011	55016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008120	TGA	2	6	55559	55564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008120	GGA	2	6	55670	55675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008120	CAG	2	6	55751	55756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008120	CAC	2	6	55819	55824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_008120	TAG	2	6	55927	55932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008120	GCC	2	6	55948	55953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_008120	CCG	2	6	56572	56577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_008120	TGG	2	6	60649	60654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008120	CCA	2	6	63967	63972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_008120	TTA	2	6	66411	66416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008120	TAC	3	9	66764	66772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008120	TTA	2	6	66980	66985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008120	GCT	2	6	68682	68687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008120	TTG	2	6	68688	68693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008120	GAT	2	6	68704	68709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008120	CTC	2	6	68726	68731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_008120	ATT	2	6	68791	68796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008120	TAA	2	6	68801	68806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008120	AAC	2	6	68821	68826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008120	AAT	2	6	68841	68846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008120	AAT	2	6	68862	68867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008120	ATA	2	6	68948	68953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008120	TAT	2	6	69006	69011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008120	TAT	2	6	69046	69051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008120	AGG	2	6	69190	69195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008120	ATA	2	6	69198	69203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008120	CCT	2	6	69206	69211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_008120	TAT	2	6	69217	69222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008120	AAT	2	6	69760	69765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008120	CCT	2	6	73136	73141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_008120	ACA	2	6	73154	73159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008120	CAT	2	6	73177	73182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008120	CGA	2	6	73190	73195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008120	TAT	2	6	73430	73435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008120	CGC	2	6	74520	74525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_008120	GAT	2	6	74600	74605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008120	CAA	2	6	74687	74692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008120	TAA	2	6	76004	76009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008120	ACG	2	6	76093	76098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008120	GAT	2	6	76161	76166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008120	AAT	2	6	76167	76172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008120	AGT	2	6	77416	77421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008120	TGA	2	6	77446	77451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008120	TCA	2	6	77538	77543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_008120	TCA	2	6	77564	77569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008120	AAG	2	6	77969	77974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008120	CAA	2	6	78202	78207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008120	GAT	2	6	78316	78321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008120	GAA	2	6	78347	78352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008120	CAC	2	6	78391	78396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_008120	CCT	2	6	78570	78575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_008120	TAG	2	6	78672	78677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008120	TTA	2	6	79289	79294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008120	AAG	2	6	79311	79316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008120	ACC	2	6	79368	79373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_008120	CGA	2	6	79393	79398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008120	GAT	2	6	79405	79410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008120	CAT	2	6	79414	79419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_008120	ATT	2	6	79421	79426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008120	ATG	2	6	79430	79435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008120	ATT	2	6	79456	79461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008120	TAA	2	6	81274	81279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008120	GCA	2	6	81291	81296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008120	CTT	2	6	82032	82037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008120	GTC	2	6	82370	82375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008120	GGA	2	6	82540	82545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008120	ATG	2	6	83811	83816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008120	AGT	2	6	84503	84508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008120	TTA	2	6	84749	84754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008120	TCC	2	6	84760	84765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_008120	ATG	2	6	84895	84900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008120	ATC	2	6	84954	84959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_008120	AAC	2	6	85232	85237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008120	TTG	2	6	85279	85284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008120	CAA	2	6	85285	85290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_008120	ACC	2	6	85341	85346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_008120	ATG	2	6	85405	85410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008120	AAT	2	6	85424	85429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008120	TGT	2	6	85449	85454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008120	CAC	2	6	87748	87753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_008120	CAC	2	6	87816	87821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_008120	ATC	2	6	88067	88072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_008120	CAT	2	6	89547	89552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_008120	CTC	2	6	90051	90056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_008120	CTG	2	6	90069	90074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_008120	CGT	2	6	90184	90189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_008120	CGC	2	6	91682	91687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_008120	GCG	2	6	91692	91697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_008120	CAG	2	6	92511	92516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_008120	GCG	2	6	92520	92525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_008120	TCC	2	6	92577	92582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_008120	GTT	2	6	92585	92590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008120	TTC	2	6	92730	92735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_008120	CGT	2	6	92737	92742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_008120	ACA	2	6	92879	92884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_008120	GGA	2	6	92893	92898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008120	GCC	2	6	93433	93438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_008120	CGC	2	6	93488	93493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_008120	GCG	2	6	93498	93503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_008120	GGT	2	6	93534	93539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008120	TTG	2	6	93560	93565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008120	TTC	2	6	93671	93676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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159	NC_008120	ATC	2	6	94399	94404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_008120	GCC	2	6	96446	96451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.