MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Yersinia pestis Antiqua plasmid pMT

Total Repeats: 153

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008120	TC	4	8	395	402	0 %	50 %	0 %	50 %	108793533
2	NC_008120	CG	3	6	624	629	0 %	0 %	50 %	50 %	108793533
3	NC_008120	TC	3	6	738	743	0 %	50 %	0 %	50 %	108793533
4	NC_008120	TA	3	6	2000	2005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008120	GA	3	6	2329	2334	50 %	0 %	50 %	0 %	108793535
6	NC_008120	AT	3	6	2559	2564	50 %	50 %	0 %	0 %	108793535
7	NC_008120	AT	3	6	2754	2759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008120	TG	3	6	3014	3019	0 %	50 %	50 %	0 %	108793536
9	NC_008120	TG	3	6	3196	3201	0 %	50 %	50 %	0 %	108793536
10	NC_008120	AC	3	6	3536	3541	50 %	0 %	0 %	50 %	108793536
11	NC_008120	AC	3	6	3572	3577	50 %	0 %	0 %	50 %	108793536
12	NC_008120	AT	3	6	3695	3700	50 %	50 %	0 %	0 %	108793536
13	NC_008120	GC	3	6	5335	5340	0 %	0 %	50 %	50 %	108793536
14	NC_008120	CA	3	6	5962	5967	50 %	0 %	0 %	50 %	108793537
15	NC_008120	TC	3	6	6686	6691	0 %	50 %	0 %	50 %	108793538
16	NC_008120	AT	3	6	6697	6702	50 %	50 %	0 %	0 %	108793538
17	NC_008120	CG	3	6	7424	7429	0 %	0 %	50 %	50 %	108793538
18	NC_008120	CT	3	6	8540	8545	0 %	50 %	0 %	50 %	108793538
19	NC_008120	CG	3	6	8728	8733	0 %	0 %	50 %	50 %	108793538
20	NC_008120	AG	3	6	8924	8929	50 %	0 %	50 %	0 %	108793538
21	NC_008120	TG	3	6	10330	10335	0 %	50 %	50 %	0 %	108793538
22	NC_008120	GT	3	6	11824	11829	0 %	50 %	50 %	0 %	108793540
23	NC_008120	AC	3	6	13104	13109	50 %	0 %	0 %	50 %	108793541
24	NC_008120	CG	3	6	13476	13481	0 %	0 %	50 %	50 %	108793542
25	NC_008120	GA	3	6	15224	15229	50 %	0 %	50 %	0 %	108793543
26	NC_008120	AG	3	6	15474	15479	50 %	0 %	50 %	0 %	108793544
27	NC_008120	GA	3	6	16907	16912	50 %	0 %	50 %	0 %	108793544
28	NC_008120	AC	3	6	17590	17595	50 %	0 %	0 %	50 %	108793544
29	NC_008120	AG	3	6	18993	18998	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008120	CA	3	6	19178	19183	50 %	0 %	0 %	50 %	108793547
31	NC_008120	GA	3	6	19266	19271	50 %	0 %	50 %	0 %	108793547
32	NC_008120	TA	3	6	19835	19840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008120	CT	3	6	20316	20321	0 %	50 %	0 %	50 %	108793549
34	NC_008120	AG	3	6	23245	23250	50 %	0 %	50 %	0 %	108793554
35	NC_008120	AT	3	6	25016	25021	50 %	50 %	0 %	0 %	108793556
36	NC_008120	AG	3	6	25267	25272	50 %	0 %	50 %	0 %	108793556
37	NC_008120	CG	4	8	25979	25986	0 %	0 %	50 %	50 %	108793556
38	NC_008120	GC	4	8	26074	26081	0 %	0 %	50 %	50 %	108793556
39	NC_008120	AT	3	6	26849	26854	50 %	50 %	0 %	0 %	108793557
40	NC_008120	CA	3	6	26957	26962	50 %	0 %	0 %	50 %	108793557
41	NC_008120	CG	3	6	27672	27677	0 %	0 %	50 %	50 %	108793557
42	NC_008120	CA	3	6	27725	27730	50 %	0 %	0 %	50 %	108793557
43	NC_008120	GT	3	6	28369	28374	0 %	50 %	50 %	0 %	108793558
44	NC_008120	TA	3	6	28585	28590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008120	TA	4	8	28612	28619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008120	TA	3	6	32076	32081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008120	CG	3	6	32626	32631	0 %	0 %	50 %	50 %	108793565
48	NC_008120	AG	3	6	33691	33696	50 %	0 %	50 %	0 %	108793565
49	NC_008120	GA	3	6	34245	34250	50 %	0 %	50 %	0 %	108793567
50	NC_008120	CG	3	6	34516	34521	0 %	0 %	50 %	50 %	108793568
51	NC_008120	TC	3	6	34563	34568	0 %	50 %	0 %	50 %	108793568
52	NC_008120	AT	3	6	35087	35092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008120	GC	3	6	36195	36200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008120	CA	3	6	36671	36676	50 %	0 %	0 %	50 %	108793570
55	NC_008120	AG	3	6	38606	38611	50 %	0 %	50 %	0 %	108793572
56	NC_008120	TG	3	6	38826	38831	0 %	50 %	50 %	0 %	108793572
57	NC_008120	GT	3	6	39924	39929	0 %	50 %	50 %	0 %	108793572
58	NC_008120	AG	3	6	41268	41273	50 %	0 %	50 %	0 %	108793573
59	NC_008120	AC	3	6	42219	42224	50 %	0 %	0 %	50 %	108793574
60	NC_008120	TC	4	8	43184	43191	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008120	AG	3	6	44167	44172	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008120	AG	3	6	44276	44281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008120	CT	3	6	44312	44317	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008120	AT	3	6	44415	44420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008120	CA	3	6	44455	44460	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008120	AG	3	6	44638	44643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008120	AG	3	6	44680	44685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008120	AG	3	6	45868	45873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008120	CT	3	6	46070	46075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008120	CT	3	6	46275	46280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_008120	CG	4	8	46382	46389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008120	TG	3	6	46913	46918	0 %	50 %	50 %	0 %	108793578
73	NC_008120	TA	3	6	47166	47171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008120	GT	3	6	47674	47679	0 %	50 %	50 %	0 %	108793580
75	NC_008120	TC	4	8	48311	48318	0 %	50 %	0 %	50 %	108793581
76	NC_008120	CG	3	6	48540	48545	0 %	0 %	50 %	50 %	108793581
77	NC_008120	TC	3	6	48654	48659	0 %	50 %	0 %	50 %	108793581
78	NC_008120	TA	3	6	51483	51488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008120	CG	4	8	52041	52048	0 %	0 %	50 %	50 %	108793584
80	NC_008120	AG	3	6	52153	52158	50 %	0 %	50 %	0 %	108793584
81	NC_008120	CG	3	6	53287	53292	0 %	0 %	50 %	50 %	108793586
82	NC_008120	GA	3	6	53460	53465	50 %	0 %	50 %	0 %	108793586
83	NC_008120	GT	4	8	54078	54085	0 %	50 %	50 %	0 %	108793587
84	NC_008120	CA	3	6	54648	54653	50 %	0 %	0 %	50 %	108793587
85	NC_008120	GA	3	6	55115	55120	50 %	0 %	50 %	0 %	108793588
86	NC_008120	TA	3	6	55481	55486	50 %	50 %	0 %	0 %	108793588
87	NC_008120	CT	3	6	56027	56032	0 %	50 %	0 %	50 %	108793589
88	NC_008120	CA	3	6	56435	56440	50 %	0 %	0 %	50 %	108793589
89	NC_008120	CG	3	6	58283	58288	0 %	0 %	50 %	50 %	108793591
90	NC_008120	CT	3	6	58797	58802	0 %	50 %	0 %	50 %	108793591
91	NC_008120	GT	3	6	59572	59577	0 %	50 %	50 %	0 %	108793591
92	NC_008120	TC	3	6	60308	60313	0 %	50 %	0 %	50 %	108793591
93	NC_008120	TC	3	6	60477	60482	0 %	50 %	0 %	50 %	108793591
94	NC_008120	AG	3	6	60712	60717	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008120	AC	3	6	61216	61221	50 %	0 %	0 %	50 %	108793592
96	NC_008120	GT	3	6	61564	61569	0 %	50 %	50 %	0 %	108793592
97	NC_008120	GA	3	6	61774	61779	50 %	0 %	50 %	0 %	108793592
98	NC_008120	TA	3	6	62015	62020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008120	AT	3	6	62022	62027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008120	GA	3	6	65144	65149	50 %	0 %	50 %	0 %	108793595
101	NC_008120	CG	3	6	65258	65263	0 %	0 %	50 %	50 %	108793595
102	NC_008120	GA	4	8	65485	65492	50 %	0 %	50 %	0 %	108793595
103	NC_008120	TG	3	6	66003	66008	0 %	50 %	50 %	0 %	108793596
104	NC_008120	CT	3	6	66109	66114	0 %	50 %	0 %	50 %	108793596
105	NC_008120	TG	3	6	66435	66440	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008120	TC	3	6	67116	67121	0 %	50 %	0 %	50 %	108793599
107	NC_008120	CG	3	6	68031	68036	0 %	0 %	50 %	50 %	108793600
108	NC_008120	CT	3	6	69023	69028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_008120	GA	3	6	69384	69389	50 %	0 %	50 %	0 %	108793627
110	NC_008120	AT	3	6	69743	69748	50 %	50 %	0 %	0 %	108793627
111	NC_008120	AG	3	6	69787	69792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008120	TC	3	6	69922	69927	0 %	50 %	0 %	50 %	108793601
113	NC_008120	TC	3	6	70211	70216	0 %	50 %	0 %	50 %	108793601
114	NC_008120	AC	3	6	70556	70561	50 %	0 %	0 %	50 %	108793601
115	NC_008120	GT	3	6	71327	71332	0 %	50 %	50 %	0 %	108793601
116	NC_008120	CT	3	6	72214	72219	0 %	50 %	0 %	50 %	108793601
117	NC_008120	CA	3	6	72299	72304	50 %	0 %	0 %	50 %	108793601
118	NC_008120	AT	3	6	72731	72736	50 %	50 %	0 %	0 %	108793602
119	NC_008120	CT	3	6	72781	72786	0 %	50 %	0 %	50 %	108793602
120	NC_008120	CA	3	6	73280	73285	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_008120	AT	3	6	73490	73495	50 %	50 %	0 %	0 %	108793628
122	NC_008120	AT	3	6	73613	73618	50 %	50 %	0 %	0 %	108793628
123	NC_008120	AG	3	6	73856	73861	50 %	0 %	50 %	0 %	108793628
124	NC_008120	CA	3	6	75008	75013	50 %	0 %	0 %	50 %	108793603
125	NC_008120	GT	3	6	76249	76254	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008120	CG	3	6	77528	77533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_008120	TC	3	6	77591	77596	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_008120	TC	3	6	78996	79001	0 %	50 %	0 %	50 %	108793606
129	NC_008120	TG	3	6	80681	80686	0 %	50 %	50 %	0 %	108793607
130	NC_008120	TA	3	6	81176	81181	50 %	50 %	0 %	0 %	108793607
131	NC_008120	GA	3	6	81729	81734	50 %	0 %	50 %	0 %	108793608
132	NC_008120	TA	3	6	82213	82218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008120	AG	3	6	83175	83180	50 %	0 %	50 %	0 %	108793610
134	NC_008120	GT	3	6	85464	85469	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008120	AT	3	6	85499	85504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008120	AT	4	8	85807	85814	50 %	50 %	0 %	0 %	108793613
137	NC_008120	AT	3	6	86714	86719	50 %	50 %	0 %	0 %	108793613
138	NC_008120	CG	3	6	86943	86948	0 %	0 %	50 %	50 %	108793614
139	NC_008120	TC	4	8	87247	87254	0 %	50 %	0 %	50 %	108793614
140	NC_008120	GA	3	6	87547	87552	50 %	0 %	50 %	0 %	108793614
141	NC_008120	CA	3	6	88289	88294	50 %	0 %	0 %	50 %	108793615
142	NC_008120	TA	3	6	89515	89520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008120	GC	3	6	89941	89946	0 %	0 %	50 %	50 %	108793631
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145	NC_008120	GC	3	6	90971	90976	0 %	0 %	50 %	50 %	108793616
146	NC_008120	TG	3	6	91080	91085	0 %	50 %	50 %	0 %	108793617
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148	NC_008120	GC	3	6	92141	92146	0 %	0 %	50 %	50 %	108793619
149	NC_008120	CG	3	6	92169	92174	0 %	0 %	50 %	50 %	108793619
150	NC_008120	CG	3	6	93447	93452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_008120	CG	3	6	93883	93888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_008120	GC	3	6	94828	94833	0 %	0 %	50 %	50 %	108793622
153	NC_008120	TG	3	6	96454	96459	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.