MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Antiqua plasmid pMT

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008120	TA	3	6	2000	2005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008120	AT	3	6	2754	2759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008120	AG	3	6	18993	18998	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008120	TA	3	6	19835	19840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008120	TA	3	6	28585	28590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008120	TA	4	8	28612	28619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008120	TA	3	6	32076	32081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008120	AT	3	6	35087	35092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008120	GC	3	6	36195	36200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008120	TC	4	8	43184	43191	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008120	AG	3	6	44167	44172	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008120	AG	3	6	44276	44281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008120	CT	3	6	44312	44317	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008120	AT	3	6	44415	44420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008120	CA	3	6	44455	44460	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008120	AG	3	6	44638	44643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008120	AG	3	6	44680	44685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008120	AG	3	6	45868	45873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008120	CT	3	6	46070	46075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008120	CT	3	6	46275	46280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008120	CG	4	8	46382	46389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008120	TA	3	6	47166	47171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008120	TA	3	6	51483	51488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008120	AG	3	6	60712	60717	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008120	TA	3	6	62015	62020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008120	AT	3	6	62022	62027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008120	TG	3	6	66435	66440	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008120	CT	3	6	69023	69028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_008120	AG	3	6	69787	69792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008120	CA	3	6	73280	73285	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008120	GT	3	6	76249	76254	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008120	CG	3	6	77528	77533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008120	TC	3	6	77591	77596	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008120	TA	3	6	82213	82218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008120	GT	3	6	85464	85469	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008120	AT	3	6	85499	85504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008120	TA	3	6	89515	89520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008120	CG	3	6	93447	93452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008120	CG	3	6	93883	93888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008120	TG	3	6	96454	96459	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.