MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis Antiqua plasmid pMT

Total Repeats: 113

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008120	TC	4	8	395	402	0 %	50 %	0 %	50 %	108793533
2	NC_008120	CG	3	6	624	629	0 %	0 %	50 %	50 %	108793533
3	NC_008120	TC	3	6	738	743	0 %	50 %	0 %	50 %	108793533
4	NC_008120	GA	3	6	2329	2334	50 %	0 %	50 %	0 %	108793535
5	NC_008120	AT	3	6	2559	2564	50 %	50 %	0 %	0 %	108793535
6	NC_008120	TG	3	6	3014	3019	0 %	50 %	50 %	0 %	108793536
7	NC_008120	TG	3	6	3196	3201	0 %	50 %	50 %	0 %	108793536
8	NC_008120	AC	3	6	3536	3541	50 %	0 %	0 %	50 %	108793536
9	NC_008120	AC	3	6	3572	3577	50 %	0 %	0 %	50 %	108793536
10	NC_008120	AT	3	6	3695	3700	50 %	50 %	0 %	0 %	108793536
11	NC_008120	GC	3	6	5335	5340	0 %	0 %	50 %	50 %	108793536
12	NC_008120	CA	3	6	5962	5967	50 %	0 %	0 %	50 %	108793537
13	NC_008120	TC	3	6	6686	6691	0 %	50 %	0 %	50 %	108793538
14	NC_008120	AT	3	6	6697	6702	50 %	50 %	0 %	0 %	108793538
15	NC_008120	CG	3	6	7424	7429	0 %	0 %	50 %	50 %	108793538
16	NC_008120	CT	3	6	8540	8545	0 %	50 %	0 %	50 %	108793538
17	NC_008120	CG	3	6	8728	8733	0 %	0 %	50 %	50 %	108793538
18	NC_008120	AG	3	6	8924	8929	50 %	0 %	50 %	0 %	108793538
19	NC_008120	TG	3	6	10330	10335	0 %	50 %	50 %	0 %	108793538
20	NC_008120	GT	3	6	11824	11829	0 %	50 %	50 %	0 %	108793540
21	NC_008120	AC	3	6	13104	13109	50 %	0 %	0 %	50 %	108793541
22	NC_008120	CG	3	6	13476	13481	0 %	0 %	50 %	50 %	108793542
23	NC_008120	GA	3	6	15224	15229	50 %	0 %	50 %	0 %	108793543
24	NC_008120	AG	3	6	15474	15479	50 %	0 %	50 %	0 %	108793544
25	NC_008120	GA	3	6	16907	16912	50 %	0 %	50 %	0 %	108793544
26	NC_008120	AC	3	6	17590	17595	50 %	0 %	0 %	50 %	108793544
27	NC_008120	CA	3	6	19178	19183	50 %	0 %	0 %	50 %	108793547
28	NC_008120	GA	3	6	19266	19271	50 %	0 %	50 %	0 %	108793547
29	NC_008120	CT	3	6	20316	20321	0 %	50 %	0 %	50 %	108793549
30	NC_008120	AG	3	6	23245	23250	50 %	0 %	50 %	0 %	108793554
31	NC_008120	AT	3	6	25016	25021	50 %	50 %	0 %	0 %	108793556
32	NC_008120	AG	3	6	25267	25272	50 %	0 %	50 %	0 %	108793556
33	NC_008120	CG	4	8	25979	25986	0 %	0 %	50 %	50 %	108793556
34	NC_008120	GC	4	8	26074	26081	0 %	0 %	50 %	50 %	108793556
35	NC_008120	AT	3	6	26849	26854	50 %	50 %	0 %	0 %	108793557
36	NC_008120	CA	3	6	26957	26962	50 %	0 %	0 %	50 %	108793557
37	NC_008120	CG	3	6	27672	27677	0 %	0 %	50 %	50 %	108793557
38	NC_008120	CA	3	6	27725	27730	50 %	0 %	0 %	50 %	108793557
39	NC_008120	GT	3	6	28369	28374	0 %	50 %	50 %	0 %	108793558
40	NC_008120	CG	3	6	32626	32631	0 %	0 %	50 %	50 %	108793565
41	NC_008120	AG	3	6	33691	33696	50 %	0 %	50 %	0 %	108793565
42	NC_008120	GA	3	6	34245	34250	50 %	0 %	50 %	0 %	108793567
43	NC_008120	CG	3	6	34516	34521	0 %	0 %	50 %	50 %	108793568
44	NC_008120	TC	3	6	34563	34568	0 %	50 %	0 %	50 %	108793568
45	NC_008120	CA	3	6	36671	36676	50 %	0 %	0 %	50 %	108793570
46	NC_008120	AG	3	6	38606	38611	50 %	0 %	50 %	0 %	108793572
47	NC_008120	TG	3	6	38826	38831	0 %	50 %	50 %	0 %	108793572
48	NC_008120	GT	3	6	39924	39929	0 %	50 %	50 %	0 %	108793572
49	NC_008120	AG	3	6	41268	41273	50 %	0 %	50 %	0 %	108793573
50	NC_008120	AC	3	6	42219	42224	50 %	0 %	0 %	50 %	108793574
51	NC_008120	TG	3	6	46913	46918	0 %	50 %	50 %	0 %	108793578
52	NC_008120	GT	3	6	47674	47679	0 %	50 %	50 %	0 %	108793580
53	NC_008120	TC	4	8	48311	48318	0 %	50 %	0 %	50 %	108793581
54	NC_008120	CG	3	6	48540	48545	0 %	0 %	50 %	50 %	108793581
55	NC_008120	TC	3	6	48654	48659	0 %	50 %	0 %	50 %	108793581
56	NC_008120	CG	4	8	52041	52048	0 %	0 %	50 %	50 %	108793584
57	NC_008120	AG	3	6	52153	52158	50 %	0 %	50 %	0 %	108793584
58	NC_008120	CG	3	6	53287	53292	0 %	0 %	50 %	50 %	108793586
59	NC_008120	GA	3	6	53460	53465	50 %	0 %	50 %	0 %	108793586
60	NC_008120	GT	4	8	54078	54085	0 %	50 %	50 %	0 %	108793587
61	NC_008120	CA	3	6	54648	54653	50 %	0 %	0 %	50 %	108793587
62	NC_008120	GA	3	6	55115	55120	50 %	0 %	50 %	0 %	108793588
63	NC_008120	TA	3	6	55481	55486	50 %	50 %	0 %	0 %	108793588
64	NC_008120	CT	3	6	56027	56032	0 %	50 %	0 %	50 %	108793589
65	NC_008120	CA	3	6	56435	56440	50 %	0 %	0 %	50 %	108793589
66	NC_008120	CG	3	6	58283	58288	0 %	0 %	50 %	50 %	108793591
67	NC_008120	CT	3	6	58797	58802	0 %	50 %	0 %	50 %	108793591
68	NC_008120	GT	3	6	59572	59577	0 %	50 %	50 %	0 %	108793591
69	NC_008120	TC	3	6	60308	60313	0 %	50 %	0 %	50 %	108793591
70	NC_008120	TC	3	6	60477	60482	0 %	50 %	0 %	50 %	108793591
71	NC_008120	AC	3	6	61216	61221	50 %	0 %	0 %	50 %	108793592
72	NC_008120	GT	3	6	61564	61569	0 %	50 %	50 %	0 %	108793592
73	NC_008120	GA	3	6	61774	61779	50 %	0 %	50 %	0 %	108793592
74	NC_008120	GA	3	6	65144	65149	50 %	0 %	50 %	0 %	108793595
75	NC_008120	CG	3	6	65258	65263	0 %	0 %	50 %	50 %	108793595
76	NC_008120	GA	4	8	65485	65492	50 %	0 %	50 %	0 %	108793595
77	NC_008120	TG	3	6	66003	66008	0 %	50 %	50 %	0 %	108793596
78	NC_008120	CT	3	6	66109	66114	0 %	50 %	0 %	50 %	108793596
79	NC_008120	TC	3	6	67116	67121	0 %	50 %	0 %	50 %	108793599
80	NC_008120	CG	3	6	68031	68036	0 %	0 %	50 %	50 %	108793600
81	NC_008120	GA	3	6	69384	69389	50 %	0 %	50 %	0 %	108793627
82	NC_008120	AT	3	6	69743	69748	50 %	50 %	0 %	0 %	108793627
83	NC_008120	TC	3	6	69922	69927	0 %	50 %	0 %	50 %	108793601
84	NC_008120	TC	3	6	70211	70216	0 %	50 %	0 %	50 %	108793601
85	NC_008120	AC	3	6	70556	70561	50 %	0 %	0 %	50 %	108793601
86	NC_008120	GT	3	6	71327	71332	0 %	50 %	50 %	0 %	108793601
87	NC_008120	CT	3	6	72214	72219	0 %	50 %	0 %	50 %	108793601
88	NC_008120	CA	3	6	72299	72304	50 %	0 %	0 %	50 %	108793601
89	NC_008120	AT	3	6	72731	72736	50 %	50 %	0 %	0 %	108793602
90	NC_008120	CT	3	6	72781	72786	0 %	50 %	0 %	50 %	108793602
91	NC_008120	AT	3	6	73490	73495	50 %	50 %	0 %	0 %	108793628
92	NC_008120	AT	3	6	73613	73618	50 %	50 %	0 %	0 %	108793628
93	NC_008120	AG	3	6	73856	73861	50 %	0 %	50 %	0 %	108793628
94	NC_008120	CA	3	6	75008	75013	50 %	0 %	0 %	50 %	108793603
95	NC_008120	TC	3	6	78996	79001	0 %	50 %	0 %	50 %	108793606
96	NC_008120	TG	3	6	80681	80686	0 %	50 %	50 %	0 %	108793607
97	NC_008120	TA	3	6	81176	81181	50 %	50 %	0 %	0 %	108793607
98	NC_008120	GA	3	6	81729	81734	50 %	0 %	50 %	0 %	108793608
99	NC_008120	AG	3	6	83175	83180	50 %	0 %	50 %	0 %	108793610
100	NC_008120	AT	4	8	85807	85814	50 %	50 %	0 %	0 %	108793613
101	NC_008120	AT	3	6	86714	86719	50 %	50 %	0 %	0 %	108793613
102	NC_008120	CG	3	6	86943	86948	0 %	0 %	50 %	50 %	108793614
103	NC_008120	TC	4	8	87247	87254	0 %	50 %	0 %	50 %	108793614
104	NC_008120	GA	3	6	87547	87552	50 %	0 %	50 %	0 %	108793614
105	NC_008120	CA	3	6	88289	88294	50 %	0 %	0 %	50 %	108793615
106	NC_008120	GC	3	6	89941	89946	0 %	0 %	50 %	50 %	108793631
107	NC_008120	CA	3	6	90824	90829	50 %	0 %	0 %	50 %	108793616
108	NC_008120	GC	3	6	90971	90976	0 %	0 %	50 %	50 %	108793616
109	NC_008120	TG	3	6	91080	91085	0 %	50 %	50 %	0 %	108793617
110	NC_008120	GC	3	6	91769	91774	0 %	0 %	50 %	50 %	108793619
111	NC_008120	GC	3	6	92141	92146	0 %	0 %	50 %	50 %	108793619
112	NC_008120	CG	3	6	92169	92174	0 %	0 %	50 %	50 %	108793619
113	NC_008120	GC	3	6	94828	94833	0 %	0 %	50 %	50 %	108793622

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.