MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Yersinia pestis Antiqua plasmid pMT

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008120	A	6	6	1004	1009	100 %	0 %	0 %	0 %	108793533
2	NC_008120	C	6	6	1601	1606	0 %	0 %	0 %	100 %	108793534
3	NC_008120	A	6	6	2919	2924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008120	C	6	6	5923	5928	0 %	0 %	0 %	100 %	108793537
5	NC_008120	T	6	6	5981	5986	0 %	100 %	0 %	0 %	108793537
6	NC_008120	T	6	6	10616	10621	0 %	100 %	0 %	0 %	108793538
7	NC_008120	C	6	6	11381	11386	0 %	0 %	0 %	100 %	108793539
8	NC_008120	T	6	6	19757	19762	0 %	100 %	0 %	0 %	108793547
9	NC_008120	T	6	6	22615	22620	0 %	100 %	0 %	0 %	108793553
10	NC_008120	T	6	6	25069	25074	0 %	100 %	0 %	0 %	108793556
11	NC_008120	T	6	6	26457	26462	0 %	100 %	0 %	0 %	108793556
12	NC_008120	T	6	6	31306	31311	0 %	100 %	0 %	0 %	108793563
13	NC_008120	A	6	6	31929	31934	100 %	0 %	0 %	0 %	108793564
14	NC_008120	A	6	6	32776	32781	100 %	0 %	0 %	0 %	108793565
15	NC_008120	G	7	7	34889	34895	0 %	0 %	100 %	0 %	108793568
16	NC_008120	T	8	8	35184	35191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008120	A	6	6	35202	35207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008120	A	6	6	35338	35343	100 %	0 %	0 %	0 %	108793569
19	NC_008120	A	6	6	35782	35787	100 %	0 %	0 %	0 %	108793569
20	NC_008120	T	6	6	36033	36038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008120	A	6	6	36991	36996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008120	T	6	6	37625	37630	0 %	100 %	0 %	0 %	108793571
23	NC_008120	T	7	7	40058	40064	0 %	100 %	0 %	0 %	108793572
24	NC_008120	T	7	7	41976	41982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008120	G	6	6	42140	42145	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008120	A	6	6	42190	42195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008120	A	6	6	42913	42918	100 %	0 %	0 %	0 %	108793574
28	NC_008120	T	6	6	46600	46605	0 %	100 %	0 %	0 %	108793577
29	NC_008120	A	6	6	48920	48925	100 %	0 %	0 %	0 %	108793581
30	NC_008120	C	6	6	49511	49516	0 %	0 %	0 %	100 %	108793582
31	NC_008120	T	6	6	49886	49891	0 %	100 %	0 %	0 %	108793625
32	NC_008120	T	6	6	49896	49901	0 %	100 %	0 %	0 %	108793625
33	NC_008120	A	6	6	50361	50366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008120	T	6	6	55433	55438	0 %	100 %	0 %	0 %	108793588
35	NC_008120	A	6	6	55921	55926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008120	A	6	6	56565	56570	100 %	0 %	0 %	0 %	108793589
37	NC_008120	T	7	7	62302	62308	0 %	100 %	0 %	0 %	108793593
38	NC_008120	G	6	6	64281	64286	0 %	0 %	100 %	0 %	108793594
39	NC_008120	T	6	6	64878	64883	0 %	100 %	0 %	0 %	108793595
40	NC_008120	A	6	6	67285	67290	100 %	0 %	0 %	0 %	108793599
41	NC_008120	A	7	7	68656	68662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008120	A	6	6	68805	68810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008120	A	7	7	68931	68937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008120	T	7	7	69735	69741	0 %	100 %	0 %	0 %	108793627
45	NC_008120	T	6	6	69878	69883	0 %	100 %	0 %	0 %	108793601
46	NC_008120	T	6	6	69951	69956	0 %	100 %	0 %	0 %	108793601
47	NC_008120	T	6	6	70337	70342	0 %	100 %	0 %	0 %	108793601
48	NC_008120	T	6	6	70685	70690	0 %	100 %	0 %	0 %	108793601
49	NC_008120	A	7	7	70752	70758	100 %	0 %	0 %	0 %	108793601
50	NC_008120	T	6	6	70810	70815	0 %	100 %	0 %	0 %	108793601
51	NC_008120	T	8	8	71061	71068	0 %	100 %	0 %	0 %	108793601
52	NC_008120	C	6	6	71278	71283	0 %	0 %	0 %	100 %	108793601
53	NC_008120	C	6	6	71400	71405	0 %	0 %	0 %	100 %	108793601
54	NC_008120	C	6	6	72564	72569	0 %	0 %	0 %	100 %	108793602
55	NC_008120	T	6	6	73696	73701	0 %	100 %	0 %	0 %	108793628
56	NC_008120	T	6	6	74099	74104	0 %	100 %	0 %	0 %	108793628
57	NC_008120	A	6	6	74465	74470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008120	A	7	7	75827	75833	100 %	0 %	0 %	0 %	108793603
59	NC_008120	T	6	6	75955	75960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008120	T	7	7	76031	76037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008120	A	7	7	76056	76062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008120	A	6	6	76132	76137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008120	A	6	6	76287	76292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008120	T	9	9	80144	80152	0 %	100 %	0 %	0 %	108793607
65	NC_008120	T	6	6	80202	80207	0 %	100 %	0 %	0 %	108793607
66	NC_008120	T	6	6	80303	80308	0 %	100 %	0 %	0 %	108793607
67	NC_008120	T	7	7	80501	80507	0 %	100 %	0 %	0 %	108793607
68	NC_008120	T	6	6	80803	80808	0 %	100 %	0 %	0 %	108793607
69	NC_008120	T	7	7	80965	80971	0 %	100 %	0 %	0 %	108793607
70	NC_008120	G	6	6	81157	81162	0 %	0 %	100 %	0 %	108793607
71	NC_008120	A	8	8	81857	81864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008120	A	6	6	82080	82085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008120	T	6	6	82101	82106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008120	A	6	6	82293	82298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008120	T	7	7	82315	82321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008120	T	6	6	84417	84422	0 %	100 %	0 %	0 %	108793611
77	NC_008120	T	6	6	84478	84483	0 %	100 %	0 %	0 %	108793611
78	NC_008120	T	8	8	85197	85204	0 %	100 %	0 %	0 %	108793612
79	NC_008120	T	6	6	85458	85463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008120	T	6	6	87732	87737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008120	A	6	6	90531	90536	100 %	0 %	0 %	0 %	108793616
82	NC_008120	A	6	6	91665	91670	100 %	0 %	0 %	0 %	108793618
83	NC_008120	T	6	6	92899	92904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008120	A	6	6	94460	94465	100 %	0 %	0 %	0 %	108793622
85	NC_008120	A	7	7	94475	94481	100 %	0 %	0 %	0 %	108793622

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.