MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis Antiqua plasmid pMT

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008120	A	6	6	1004	1009	100 %	0 %	0 %	0 %	108793533
2	NC_008120	C	6	6	1601	1606	0 %	0 %	0 %	100 %	108793534
3	NC_008120	C	6	6	5923	5928	0 %	0 %	0 %	100 %	108793537
4	NC_008120	T	6	6	5981	5986	0 %	100 %	0 %	0 %	108793537
5	NC_008120	T	6	6	10616	10621	0 %	100 %	0 %	0 %	108793538
6	NC_008120	C	6	6	11381	11386	0 %	0 %	0 %	100 %	108793539
7	NC_008120	T	6	6	19757	19762	0 %	100 %	0 %	0 %	108793547
8	NC_008120	T	6	6	22615	22620	0 %	100 %	0 %	0 %	108793553
9	NC_008120	T	6	6	25069	25074	0 %	100 %	0 %	0 %	108793556
10	NC_008120	T	6	6	26457	26462	0 %	100 %	0 %	0 %	108793556
11	NC_008120	T	6	6	31306	31311	0 %	100 %	0 %	0 %	108793563
12	NC_008120	A	6	6	31929	31934	100 %	0 %	0 %	0 %	108793564
13	NC_008120	A	6	6	32776	32781	100 %	0 %	0 %	0 %	108793565
14	NC_008120	G	7	7	34889	34895	0 %	0 %	100 %	0 %	108793568
15	NC_008120	A	6	6	35338	35343	100 %	0 %	0 %	0 %	108793569
16	NC_008120	A	6	6	35782	35787	100 %	0 %	0 %	0 %	108793569
17	NC_008120	T	6	6	37625	37630	0 %	100 %	0 %	0 %	108793571
18	NC_008120	T	7	7	40058	40064	0 %	100 %	0 %	0 %	108793572
19	NC_008120	A	6	6	42913	42918	100 %	0 %	0 %	0 %	108793574
20	NC_008120	T	6	6	46600	46605	0 %	100 %	0 %	0 %	108793577
21	NC_008120	A	6	6	48920	48925	100 %	0 %	0 %	0 %	108793581
22	NC_008120	C	6	6	49511	49516	0 %	0 %	0 %	100 %	108793582
23	NC_008120	T	6	6	49886	49891	0 %	100 %	0 %	0 %	108793625
24	NC_008120	T	6	6	49896	49901	0 %	100 %	0 %	0 %	108793625
25	NC_008120	T	6	6	55433	55438	0 %	100 %	0 %	0 %	108793588
26	NC_008120	A	6	6	56565	56570	100 %	0 %	0 %	0 %	108793589
27	NC_008120	T	7	7	62302	62308	0 %	100 %	0 %	0 %	108793593
28	NC_008120	G	6	6	64281	64286	0 %	0 %	100 %	0 %	108793594
29	NC_008120	T	6	6	64878	64883	0 %	100 %	0 %	0 %	108793595
30	NC_008120	A	6	6	67285	67290	100 %	0 %	0 %	0 %	108793599
31	NC_008120	T	7	7	69735	69741	0 %	100 %	0 %	0 %	108793627
32	NC_008120	T	6	6	69878	69883	0 %	100 %	0 %	0 %	108793601
33	NC_008120	T	6	6	69951	69956	0 %	100 %	0 %	0 %	108793601
34	NC_008120	T	6	6	70337	70342	0 %	100 %	0 %	0 %	108793601
35	NC_008120	T	6	6	70685	70690	0 %	100 %	0 %	0 %	108793601
36	NC_008120	A	7	7	70752	70758	100 %	0 %	0 %	0 %	108793601
37	NC_008120	T	6	6	70810	70815	0 %	100 %	0 %	0 %	108793601
38	NC_008120	T	8	8	71061	71068	0 %	100 %	0 %	0 %	108793601
39	NC_008120	C	6	6	71278	71283	0 %	0 %	0 %	100 %	108793601
40	NC_008120	C	6	6	71400	71405	0 %	0 %	0 %	100 %	108793601
41	NC_008120	C	6	6	72564	72569	0 %	0 %	0 %	100 %	108793602
42	NC_008120	T	6	6	73696	73701	0 %	100 %	0 %	0 %	108793628
43	NC_008120	T	6	6	74099	74104	0 %	100 %	0 %	0 %	108793628
44	NC_008120	A	7	7	75827	75833	100 %	0 %	0 %	0 %	108793603
45	NC_008120	T	9	9	80144	80152	0 %	100 %	0 %	0 %	108793607
46	NC_008120	T	6	6	80202	80207	0 %	100 %	0 %	0 %	108793607
47	NC_008120	T	6	6	80303	80308	0 %	100 %	0 %	0 %	108793607
48	NC_008120	T	7	7	80501	80507	0 %	100 %	0 %	0 %	108793607
49	NC_008120	T	6	6	80803	80808	0 %	100 %	0 %	0 %	108793607
50	NC_008120	T	7	7	80965	80971	0 %	100 %	0 %	0 %	108793607
51	NC_008120	G	6	6	81157	81162	0 %	0 %	100 %	0 %	108793607
52	NC_008120	T	6	6	84417	84422	0 %	100 %	0 %	0 %	108793611
53	NC_008120	T	6	6	84478	84483	0 %	100 %	0 %	0 %	108793611
54	NC_008120	T	8	8	85197	85204	0 %	100 %	0 %	0 %	108793612
55	NC_008120	A	6	6	90531	90536	100 %	0 %	0 %	0 %	108793616
56	NC_008120	A	6	6	91665	91670	100 %	0 %	0 %	0 %	108793618
57	NC_008120	A	6	6	94460	94465	100 %	0 %	0 %	0 %	108793622
58	NC_008120	A	7	7	94475	94481	100 %	0 %	0 %	0 %	108793622

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.