MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Nepal516 plasmid pPCP

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008119	TGG	2	6	1907	1912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008119	CGT	2	6	1938	1943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008119	TGA	2	6	1952	1957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008119	CAG	2	6	2090	2095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008119	ACA	2	6	2110	2115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008119	GAT	2	6	2235	2240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008119	GTT	2	6	2375	2380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008119	GTC	2	6	2393	2398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008119	TGT	2	6	2530	2535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008119	TAC	2	6	2715	2720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008119	AAT	2	6	2793	2798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008119	TGA	2	6	3119	3124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008119	CAG	2	6	3257	3262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008119	ACA	2	6	3277	3282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008119	GAT	2	6	3402	3407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008119	GTT	2	6	3542	3547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008119	GTC	2	6	3560	3565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008119	TGT	2	6	3697	3702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008119	TAC	2	6	3882	3887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008119	AAT	2	6	3960	3965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008119	GCG	2	6	4569	4574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008119	GCA	2	6	5039	5044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008119	GCA	2	6	5237	5242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008119	AAG	2	6	5269	5274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008119	CAG	2	6	5316	5321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008119	ATG	2	6	5328	5333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008119	TGC	2	6	5349	5354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008119	ATT	2	6	5470	5475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008119	ATC	2	6	5554	5559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008119	GAT	2	6	5749	5754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008119	TAA	2	6	5817	5822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008119	TAG	2	6	5886	5891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008119	TAT	2	6	5930	5935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008119	ATT	2	6	5955	5960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008119	TAA	2	6	7130	7135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008119	CGC	2	6	7141	7146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_008119	AAT	2	6	7162	7167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008119	GCA	2	6	7226	7231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008119	GAC	2	6	7709	7714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008119	ATT	2	6	7731	7736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008119	ATT	2	6	7752	7757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008119	ATA	2	6	7786	7791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008119	TCC	2	6	8793	8798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_008119	GGA	2	6	8807	8812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008119	AGG	2	6	8824	8829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008119	TGT	2	6	8899	8904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008119	CAC	2	6	9698	9703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_008119	CAA	2	6	9749	9754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008119	CCG	2	6	9768	9773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_008119	TGG	2	6	9879	9884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008119	CAA	2	6	9963	9968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008119	CAG	2	6	10028	10033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008119	CAA	2	6	10183	10188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008119	TGC	2	6	10234	10239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008119	AAT	2	6	10351	10356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008119	CCT	2	6	10538	10543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_008119	CCA	2	6	10568	10573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_008119	AGG	2	6	10592	10597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008119	ATA	2	6	10733	10738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.